Nestemäinen biopsia ruokatorven adenokarsinooman korkean riskin syöpää edeltävään seulomiseen (EMERALD)

Ruokatorven adenokarsinooma (EAC) on merkittävä maailmanlaajuinen terveysongelma, ja se sijoittuu toiseksi kuolleisuudessa (haimasyövän jälkeen). Vaikka se on mahdollisesti ehkäistävissä, se on edelleen johtava syöpäkuolemien syy. Perinteiset seulontamenetelmät ovat tukeneet endoskopia-ensimmäistä lähestymistapaa EAC:n esiasteelle, joka on Barrettin ruokatorvi (BE). BE:n havaitsemisen jälkeen BE:tä seurataan säännöllisesti dysplasian kehittymisen seuraamiseksi, jota voidaan hoitaa pahanlaatuisen transformaation estämiseksi. Endoskopia-ensimmäinen lähestymistapa on herkkä BE ja siksi se pienentää EAC:n kehittymisen riskiä, ​​mutta se kohtaa myös haasteita, kuten invasiivisuus, kustannukset ja potilaiden hoitomyöntyvyys.

Ei-invasiiviset testit houkuttelevat potilaita enemmän kuin invasiiviset testit ja voivat lisätä osallistumisastetta. Biomarkkeritutkimukset ovat osoittaneet lupaavia, mutta olemassa olevista testeistä puuttuu herkkyys varhaisen vaiheen EAC:lle ja, mikä tärkeintä, sen esiastevauriolle BE. Tämä on todennäköistä, koska he ottivat ylinäytteitä analyyteistä, jotka ilmentyvät ensisijaisesti spektrin EAC-päässä, mutta eivät vielä BE:ssä BE-EAC-sekvenssin aikana.

Tässä tutkimuksessa ehdotetaan EAC:lle ja BE:lle räätälöidyn innovatiivisen nestebiopsian kehittämistä tämän ratkaisemiseksi. Ihanteellisen seulontatestin tulee olla minimaalisesti invasiivinen, erittäin herkkä ja kustannustehokas. Tämä testi optimoi potilaan hoitomyöntyvyyden ja resurssien allokoinnin havaitsemalla molemmat sairaudet yhdestä verinäytteestä. Tarkemmin sanottuna kiertävän mikroRNA:n (miRNA) analyysi on lupaava: soluttomaan mikroRNA:han (cf-miRNA) perustuvat testit ovat osoittaneet korkean herkkyyden.

Tässä tutkimuksessa kehitetään ei-invasiivinen verikoe BE:lle ja EAC:lle neljässä vaiheessa:

1. KudosmiRNA:n in silico genominlaajuinen profilointi parhaiden ehdokkaiden valitsemiseksi biomarkkeripaneeleihin.
2. Biomarkkerien priorisointi, jotka ilmentyvät eri tavalla koko BE:n ja EAC-sekvenssin jatkumossa verrattuna normaaliin limakalvoon
3. Näiden biomarkkerien siirtyminen nestebiopsiakokeeseen, joka vahvistaa niiden havaittavuuden veressä sekä niiden erilaisen ilmentymisen tapauksissa verrattuna kontrolleihin
4. Koneoppimisen avulla tunnistetaan lupaavimmat ehdokkaat ja koulutetaan algoritmeja EAC:n ja BE:n havaitsemiseen kvantitatiivisen polymeraasiketjureaktioanalyysin (qPCR) tulosten perusteella.
5. Näiden allekirjoitusten riippumaton validointi eri kohortteilla varmistaakseen laajan sovellettavuuden ja vertaillakseen verimäärityksen tehokkuutta tavanomaiseen hoitoon retrospektiivisten ja prospektiivisten tutkimusten avulla.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on kehittää erittäin herkkä, spesifinen ja kustannustehokas nestebiopsia BE:n ja EAC:n varhaiseen havaitsemiseen. Menestys voisi muuttaa kliinistä käytäntöä estämällä EAC:n havaitsemalla varhaisessa pahanlaatuisia vaurioita. Innovaatioita ovat esipahanlaatuisten leesioiden sisällyttäminen seulomiseen. Tämä lähestymistapa voisi mahdollisesti vähentää EAC-kuolleisuutta ja ilmaantuvuutta ja tasoittaa tietä uusille kliinisille tutkimuksille.