En flytende biopsi for høyrisiko pre-kreftscreening av esophageal adenokarsinom (EMERALD)

Esophageal adenokarsinom (EAC) er et betydelig globalt helseproblem, rangert som nummer to i dødelighet (etter kreft i bukspyttkjertelen). Til tross for at det potensielt kan forebygges, er det fortsatt en ledende årsak til kreftrelaterte dødsfall. Tradisjonelle screeningmetoder har basert seg på en endoskopi-første tilnærming for å screene for forløperen til EAC, som er Barretts esophagus (BE). Etter BE-deteksjon overvåkes BE regelmessig for å overvåke utviklingen av dysplasi, som kan behandles for å forhindre ondartet transformasjon. En endoskopi-første tilnærming er sensitiv BE, og derfor reduserer den risikoen for å utvikle EAC, men den står også overfor utfordringer som invasivitet, kostnader og pasientoverholdelse.

Ikke-invasive tester er mer attraktive for pasienter enn invasive tester og kan øke deltakelsesraten. Biomarkørstudier har vist lovende, men eksisterende tester mangler følsomhet for tidlig stadium EAC og, viktigst av alt, for dens forløperlesjon BE. Dette er sannsynligvis fordi de oversamplet analytter som primært er uttrykt i EAC-enden av spekteret, men ikke i BE ennå under BE til EAC-sekvensen.

Denne studien foreslår å utvikle en innovativ flytende biopsitest skreddersydd for EAC og BE for å løse dette. En ideell screeningtest bør være minimalt invasiv, høysensitiv og kostnadseffektiv. Denne testen vil optimalisere pasientens etterlevelse og ressursallokering ved å oppdage begge tilstandene fra en enkelt blodprøve. Mer spesifikt viser sirkulerende mikroRNA (miRNA) analyse lovende: tester basert på cellefritt mikroRNA (cf-miRNA) har vist høy sensitivitet.

Denne studien vil utvikle en ikke-invasiv blodprøve for BE og EAC i fire faser:

1. In silico genom-omfattende profilering av vev miRNA for å velge de beste kandidatene for biomarkørpaneler.
2. Prioritering av biomarkørene som er differensielt uttrykt over hele kontinuumet av BE til EAC-sekvens, sammenlignet med den normale slimhinnen
3. Overgang av disse biomarkørene til en flytende biopsianalyse, som bekrefter deres påvisbarhet i blod så vel som deres differensielle uttrykk i tilfeller sammenlignet med kontroller
4. Bruke maskinlæring for å identifisere de mest lovende kandidatene og trene algoritmer for å oppdage EAC og BE, basert på resultater fra kvantitativ polymerasekjedereaksjon (qPCR) analyse.
5. Uavhengig validering av disse signaturene ved hjelp av forskjellige kohorter for å sikre bred anvendelighet og sammenligne effektiviteten av blodanalysen med standardbehandling gjennom retrospektive og prospektive studier.

Denne studien tar sikte på å utvikle en svært sensitiv, spesifikk og kostnadseffektiv væskebiopsi for tidlig påvisning av BE og EAC. Suksess kan transformere klinisk praksis ved å forhindre EAC gjennom tidlig påvisning av pre-maligne lesjoner. Innovasjoner inkluderer å inkludere pre-maligne lesjoner i screening. Denne tilnærmingen kan potensielt redusere EAC-dødelighet og forekomst og bane vei for nye kliniske studier.