En flydende biopsi til højrisiko-pre-cancerscreening af esophageal adenokarcinom (EMERALD)

Esophageal adenocarcinoma (EAC) er et betydeligt globalt sundhedsproblem, der ligger på andenpladsen i dødelighed (efter kræft i bugspytkirtlen). På trods af at det potentielt kan forebygges, er det fortsat en førende årsag til kræftrelaterede dødsfald. Traditionelle screeningmetoder har været afhængige af en endoskopi-første tilgang til screening for forstadiet til EAC, som er Barretts esophagus (BE). Efter BE-detektion overvåges BE regelmæssigt for at overvåge udviklingen af ​​dysplasi, som kan behandles for at forhindre malign transformation. En endoskopi-først tilgang er sensitiv BE, og derfor sænker den risikoen for at udvikle EAC, men den står også over for udfordringer såsom invasivitet, omkostninger og patientcompliance.

Ikke-invasive tests er mere tiltalende for patienter end invasive tests og kan øge deltagelsesraterne. Biomarkørundersøgelser har vist lovende, men eksisterende test mangler følsomhed for tidligt stadie af EAC og, vigtigst af alt, for dets forløberlæsion BE. Dette skyldes sandsynligvis, at de oversamplede analytter, der primært udtrykkes i EAC-enden af ​​spektret, men endnu ikke i BE under BE til EAC-sekvensen.

Denne undersøgelse foreslår udvikling af en innovativ flydende biopsitest, der er skræddersyet til EAC og BE for at løse dette. En ideel screeningstest bør være minimalt invasiv, meget følsom og omkostningseffektiv. Denne test ville optimere patientcompliance og ressourceallokering ved at detektere begge tilstande fra en enkelt blodprøvetagning. Mere specifikt viser cirkulerende mikroRNA (miRNA) analyse lovende: test baseret på cellefrit mikroRNA (cf-miRNA) har vist høj følsomhed.

Denne undersøgelse vil udvikle en ikke-invasiv blodprøve for BE og EAC i fire faser:

1. In silico genom-dækkende profilering af vævs miRNA for at udvælge de bedste kandidater til biomarkørpaneler.
2. Prioritering af biomarkørerne, der er differentielt udtrykt over hele kontinuummet af BE til EAC-sekvens, sammenlignet med den normale slimhinde
3. Overgang af disse biomarkører til en flydende biopsianalyse, der bekræfter deres detekterbarhed i blod såvel som deres differentielle ekspression i tilfælde sammenlignet med kontroller
4. Brug af maskinlæring til at identificere de mest lovende kandidater og træne algoritmer til detektering af EAC og BE baseret på resultater fra kvantitativ polymerasekædereaktion (qPCR) analyse.
5. Uafhængig validering af disse signaturer ved hjælp af forskellige kohorter for at sikre bred anvendelighed og sammenligne effektiviteten af ​​blodanalysen med standardbehandling gennem retrospektive og prospektive undersøgelser.

Denne undersøgelse har til formål at udvikle en meget følsom, specifik og omkostningseffektiv væskebiopsi til tidlig påvisning af BE og EAC. Succes kunne transformere klinisk praksis ved at forhindre EAC gennem tidlig påvisning af præ-maligne læsioner. Innovationer omfatter inkorporering af præ-maligne læsioner i screening. Denne tilgang kan potentielt reducere EAC-dødelighed og forekomst og bane vejen for nye kliniske forsøg.