Kolorektaalisyövän varhaisen seulonnan parantaminen Portugalissa: Suoliston mikrobiomibiomarkkerien tunnistaminen ulosteessa (GUTBIOME-PT) (GUTBIOME-PT)
Kolorektaalisyövän varhaisen seulonnan parantaminen Portugalissa: Ulosteessa olevien suoliston mikrobiomien biomarkkerien tunnistaminen ja validointi
Kolorektaalisyöpä (CRC) on suuri kansanterveysongelma, joka aiheuttaa 2 miljoonaa uutta tapausta ja lähes miljoona kuolemaa vuosittain maailmanlaajuisesti. Vuodesta 2022 lähtien Portugalissa CRC on yleisin syöpä, jossa on raportoitu 10 575 uutta tapausta, ja toiseksi yleisin syöpäkuolleisuuden syy, mikä aiheutti 4 809 kuolemaa (noin 14 % kaikista syöpään liittyvistä kuolemista). Viime vuosina alle 50-vuotiaiden CRC:n ilmaantuvuus ja kuolleisuus on lisääntynyt hälyttävästi.
Varhainen havaitseminen on ratkaisevan tärkeää, koska eloonjäämisluvut laskevat jyrkästi varhaisessa havaitusta 90 prosentista vain 10 prosenttiin pitkälle edenneissä vaiheissa. Ei-invasiiviset diagnostiset testit, kuten Fecal Immunochemical Test (FIT), ovat alhaisia herkkyys varhaisvaiheen leesioissa ja suuri määrä vääriä positiivisia. Siksi on kiireellisesti parannettava ei-invasiivisia diagnostisia menetelmiä CRC:n varhaisessa havaitsemisessa, koska tehokas seulonta voi estää sen havaitsemalla ja poistamalla pahanlaatuisia esivaurioita.
Viimeaikaiset tutkimukset viittaavat siihen, että muuttunut suoliston mikrobisto voi aiheuttaa alttiutta tietyntyyppisille syöpätyypeille. Mielenkiintoista on, että adenoomia tai CRC:tä sairastavien potilaiden suoliston mikrobiota eroaa terveiden yksilöiden omasta. Tämän tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa suoliston mikrobiomibiomarkkereita ulostenäytteistä, jotka liittyvät CRC:hen ja/tai korkean riskin adenoomiin, jotta varhaista havaitsemista voidaan parantaa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Tässä tutkimuksessa analysoidaan suoliston mikrobiomia ulostenäytteistä, jotka on kerätty Portugalin Lissabonin metropolialueella asuvilta henkilöiltä. Haulikkometagenomiikkaa käyttämällä tutkijat pyrkivät tunnistamaan mikrobiomibiomarkkereita, jotka liittyvät CRC:n varhaiseen havaitsemiseen ja syöpää edeltävien leesioiden (adenoomien) etenemiseen. Tunnistetut biomarkkerit testataan ei-invasiivisen ja erittäin herkän seulontatyökalun kehittämiseksi CRC- ja esisyöpäleesioihin.
Ensisijainen tavoite:
Suoliston mikrobiomibiomarkkerien tunnistaminen ulosteen DNA:ssa, jotka liittyvät CRC:hen ja/tai korkean riskin adenoomiin.
Toissijaiset tavoitteet:
i) Selvitä korrelaatio FIT-tulosten, ulosteen mikrobiomitutkimuksen ja kolonoskopiatulosten välillä.
ii) Arvioi CRC:n esiintyvyys Lissabonin pääkaupunkiseudulla 40–74-vuotiaiden keskuudessa sukupuolen ja ikäryhmän mukaan jaoteltuna.
iii) Analysoi kliinisen tiedon (esim. kliinisen historian, elämäntapojen ja ruokailutottumusten), ulosteen mikrobiomiprofiilien, FIT-tulosten ja kolonoskopiatulosten välisiä yhteyksiä vertaamalla yksilöitä, joilla on CRC ja/tai korkean riskin adenoomat, terveisiin yksilöihin koko näytteen osalta sekä sukupuolen ja ikäryhmän mukaan; iv) Tunnista CRC:n kehittymiseen liittyvät riskitekijät (esim. kliininen historia, elämäntapa, ruokailutottumukset) sukupuolen ja ikäryhmän mukaan.
Opintojen suunnittelu:
Tämä on havainnollinen, prospektiivinen, pitkittäinen tutkimus, jossa on mukana 40–74-vuotiaita henkilöitä, jotka asuvat Lissabonin metropolialueella ja jotka ilmoittautuvat vapaaehtoisesti tutkimukseen.
Osallistujat, jotka täyttävät kaikki osallistumiskriteerit eivätkä yhtään poissulkemiskriteeriä (kuten on kuvattu asiaa koskevassa osiossa), otetaan mukaan. Perustuu otoskokolaskelmiin käyttämällä Neyman-allokaatiokaavaa ja ottamalla viitteeksi Lissabonin suurkaupunkialueella asuvan väestön jakautumisen (sukupuolen ja ikäryhmien mukaan: 40-49, 50-59, 60-64, 65-69 ja 70-74 vuotta) sekä yleisen FIT-testin esiintyvyyden ja herkkyyden oletukset, yhteensä 30 000 osallistujaa. ilmoittautunut.
Lähtötilanteessa osallistujat toimittavat ulostenäytteen 2–10 päivän kuluessa ilmoittautumisesta. Demografiset, kliiniset tiedot ja elämäntapatiedot, mukaan lukien ikä, CRC:n sukuhistoria, henkilökohtainen sairaushistoria, tupakointitottumukset, fyysinen aktiivisuus, stressi ja painoindeksi (BMI), kerätään itse täytettyjen kyselylomakkeiden avulla. Ruokailutottumuksia ja Välimeren ruokavalion noudattamista arvioidaan puhelinhaastatteluilla.
Osallistujia seurataan kuuden vuoden ajan, ja ulostenäytteet otetaan joka toinen vuosi. Kliiniset tiedot ja elämäntapatiedot päivitetään myös kahden vuoden välein koko tutkimusjakson ajan.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Ana S Almeida, PhD
- Puhelinnumero: +351 217999411
- Sähköposti: ana.almeida@gimm.pt
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Madalena Reis
- Puhelinnumero: +351 217999411
- Sähköposti: madalena.reis@gimm.pt
Opiskelupaikat
-
-
Lisbon District
-
Lisbon, Lisbon District, Portugali, 1649-028
- Rekrytointi
- Gulbenkian Institute for Molecular Medicine
-
Ottaa yhteyttä:
- Madalena Reis
- Puhelinnumero: +351 217999411
- Sähköposti: madalena.reis@gimm.pt
-
Päätutkija:
- Ana S Almeida, PhD
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Käytetään kahta erilaista rekrytointistrategiaa:
- Opportunistinen rekrytointi: rekrytointi toteutetaan yhteistyössä Lissabonin kumppanisairaaloiden gastroenterologian ja yleislääketieteen osastojen kanssa. Seulontakolonoskopiaan varatut henkilöt tiedottavat tutkimuksesta paikan päällä olevalta tutkimuskoordinaattorilta. Osallistujat allekirjoittavat tietoisen suostumuslomakkeen.
- Satunnainen rekrytointi: kiinnostuneet voivat saada yksityiskohtaista tietoa ja arvioida kelpoisuuttaan täyttämällä online-kyselyn tutkimuksen verkkosivuilla. Osallistujat voivat rekisteröityä ja antaa tietoisen suostumuksen digitaalisesti. Ilmoittautumisen jälkeen osallistujiin ollaan yhteydessä sopiakseen itsekeräyssarjan toimituksesta ulostenäytteen ottoa varten.
Kuvaus
Sisällön kriteerit:
- Kyky antaa kirjallinen tietoinen suostumus ja noudattaa tutkimusmenettelyjä
- Asua Lissabonin metropolialueella, Portugalissa
- Ikä 40-74 vuotta
Poissulkemiskriteerit:
- Ikä < 40 vuotta tai ≥ 75 vuotta
- Tietoon perustuvaa suostumusta ei voida antaa
- Kieltäytyminen antamasta ulostenäytteitä
- Aktiivinen onkologinen sairaus
- CRC:n henkilökohtainen historia
- Viimeisten 24 kuukauden aikana poistettujen paksusuolen adenoomien henkilöhistoria
- CRC:n ensimmäisen asteen suvussa
- Aiempi diagnoosi: tulehduksellinen suolistosairaus (haavainen paksusuolitulehdus, Crohnin tauti tai epämääräinen paksusuolitulehdus), tulehduksellinen suolen oireyhtymä, jatkuva ja tarttuva gastroenteriitti, paksusuolentulehdus tai gastriitti, jatkuva tai krooninen ripuli, jonka etiologia on tuntematon, tai toistuva Clostridioides difficilen aiheuttama infektio
- Vakavat sydän- tai sydänsairaudet lääketieteellisellä diagnoosilla
- Hemodialyysiä vaativa vaikea munuaisten vajaatoiminta
- Vaikea keuhkosairaus
- Raskaus
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kontrolliryhmä
Terveet osallistujat, joilla on negatiivinen kolonoskopiatulos
|
Ei interventiota: havainnointitutkimus
|
|
Kolorektaalinen syöpä
Osallistujat, joilla on kolonoskopialla vahvistettu paksusuolen syöpädiagnoosi
|
Ei interventiota: havainnointitutkimus
|
|
Matalariskiset polyypit
Osallistujat, joilla on positiivinen kolonoskopia ja matalariskisten adenoomien havaitseminen
|
Ei interventiota: havainnointitutkimus
|
|
Korkean riskin polyypit
Osallistujat, joilla on positiivinen kolonoskopia ja korkean riskin adenoomien havaitseminen
|
Ei interventiota: havainnointitutkimus
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mikrobiomin biomarkkerit, jotka liittyvät CRC:hen ja/tai korkean riskin polyyppeihin.
Aikaikkuna: Lähtötilanne ja seuranta 2 vuoden välein 6 vuoteen asti
|
Ulosteen mikrobiotakoostumus ja geeniprofiilit analysoidaan haulikon metagenomisella sekvensoinnilla osajoukossa osallistujia (enintään 10 000 näytettä).
Tiedot integroidaan elämäntapaan, ruokavalioon ja kolonoskopiatuloksiin CRC:hen ja adenoomeihin liittyvien biomarkkerien tunnistamiseksi.
|
Lähtötilanne ja seuranta 2 vuoden välein 6 vuoteen asti
|
|
Korrelaatio mikrobiomibiomarkkerien ja FIT-tulosten välillä
Aikaikkuna: Lähtötilanne ja seuranta 2 vuoden välein 6 vuoteen asti
|
Ulosteen mikrobiomianalyysin tuloksia verrataan FIT-testin tuloksiin, jotta voidaan arvioida ennustearvo, negatiivinen ennustearvo ja yleinen tehokkuus CRC:n havaitsemisessa oireettomassa populaatiossa.
|
Lähtötilanne ja seuranta 2 vuoden välein 6 vuoteen asti
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Ruokavalion vaikutus CRC-riskiin ja suoliston mikrobiotan koostumukseen
Aikaikkuna: Perustaso
|
Ruokavalion saanti arvioidaan puhelinhaastattelulla kahdella 24 tunnin palautuksella Euroopan elintarviketurvallisuusviranomaisen (EFSA) hyväksymän protokollan mukaisesti.
|
Perustaso
|
|
Välimeren ruokavalion vaikutus CRC-riskiin ja suoliston mikrobiston koostumukseen
Aikaikkuna: Perustaso
|
Välimeren ruokavalion noudattamista arvioidaan käyttämällä PREvención con DIeta MEDiterránea (PREDIMED) -ravitsemuskyselyä, validoitua 14-kohtaista työkalua.
Jokainen kysymys pisteytetään joko 0 (ehto ei täyty) tai 1 (ehto täyttyy), jolloin kokonaispistemäärä vaihtelee välillä 0-14 (7).
Tämän lopullisen pistemäärän perusteella Välimeren ruokavalion noudattaminen luokitellaan kolmeen ryhmään: alhainen sitoutuminen (pisteet < 5), kohtalainen sitoutuminen (pisteet 6-9) ja korkea sitoutuminen (pisteet > 10)
|
Perustaso
|
|
Fyysisen aktiivisuuden vaikutus CRC-riskiin ja suoliston mikrobiotan koostumukseen
Aikaikkuna: Perustaso
|
Fyysistä aktiivisuutta arvioidaan käyttämällä pohjoismaista liikuntakyselylomaketta, validoitua työkalua, joka koostuu kahdesta suljetusta kysymyksestä, jonka avulla seurataan WHO:n liikuntasuositusten noudattamista.
Osallistujat luokitellaan "WHO:n fyysisen aktiivisuussuosituksen alapuolelle" tai "Yhtä WHO:n fyysisen aktiivisuussuosituksen kanssa"
|
Perustaso
|
|
Nukkumistottumusten vaikutus CRC-riskiin ja suoliston mikrobiston koostumukseen
Aikaikkuna: Perustaso
|
Nukkumistapoja arvioidaan Pittsburghin unen laatuindeksillä (PSQI), validoidulla kyselylomakkeella, joka koostuu 19 kohdasta, jotka on jaettu seitsemään "komponenttiin": subjektiivinen unen laatu; unen latenssi; unen kesto; tavanomainen unen tehokkuus; unihäiriöt; unilääkkeiden käyttö; päiväsaikaan toimintahäiriö.
Jokainen komponentti pisteytetään 0–2, ja komponenttien pisteiden summa antaa globaalin PSQI-pisteen.
Globaali PSQI-pistemäärä ≥6 tarkoittaa huonoa unen laatua.
|
Perustaso
|
|
Stressitason vaikutus CRC-riskiin ja suoliston mikrobiston koostumukseen
Aikaikkuna: Perustaso
|
Stressitasoja arvioidaan Perceived Stress Scale -asteikolla, validoidulla kyselylomakkeella, joka koostuu 10 kysymyksestä.
Yksittäiset pisteet PSS:ssä voivat vaihdella välillä 0–40, korkeammat pisteet osoittavat suurempaa koettua stressiä.
Pisteitä 0–13 pidetään vähäisenä stressinä, 14–26 kohtalaisena stressinä ja pisteet 27–40 suurena koettuna stressinä.
|
Perustaso
|
|
CRC:hen ja/tai korkean riskin polyypeihin liittyvät riskitekijät (sairaushistoria, elämäntavat ja ruokailutottumukset)
Aikaikkuna: Lähtötilanne ja seuranta 2 vuoden välein 6 vuoteen asti
|
Tukikelpoiset osallistujat kutsutaan osallistumaan joka toinen vuosi kuuden vuoden ajan.
Pitkittäistiedot tunnistavat merkittävät riskitekijät CRC:n tai korkean riskin polyyppien kehittymiselle.
|
Lähtötilanne ja seuranta 2 vuoden välein 6 vuoteen asti
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- CAML Ref Nº: 111/23
- 101060102 (Muu apuraha/rahoitusnumero: European Union)
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .