Améliorer le dépistage précoce du cancer colorectal au Portugal : identification des biomarqueurs du microbiome intestinal dans les selles (GUTBIOME-PT) (GUTBIOME-PT)
Améliorer le dépistage précoce du cancer colorectal au Portugal : identification et validation des biomarqueurs du microbiome intestinal dans les selles
Le cancer colorectal (CCR) est un problème majeur de santé publique, responsable de 2 millions de nouveaux cas et de près d'un million de décès chaque année dans le monde. Au Portugal, en 2022, le CCR est le cancer le plus répandu, avec 10 575 nouveaux cas signalés, et la deuxième cause de mortalité liée au cancer, représentant 4 809 décès (environ 14 % de tous les décès liés au cancer). Ces dernières années, on a observé une augmentation alarmante de l’incidence et de la mortalité du CCR chez les personnes de moins de 50 ans.
La détection précoce est cruciale, car les taux de survie diminuent fortement, passant de 90 % en cas de détection précoce à seulement 10 % aux stades avancés. Les tests de diagnostic non invasifs, tels que le test immunochimique fécal (FIT), ont une faible sensibilité pour les lésions à un stade précoce et un taux élevé de faux positifs. Par conséquent, il existe un besoin urgent d’améliorer les méthodes de diagnostic non invasives pour la détection précoce du CCR, car un dépistage efficace peut le prévenir en détectant et en éliminant les lésions précancéreuses.
Des études récentes suggèrent qu’une altération du microbiote intestinal pourrait conférer une susceptibilité à certains types de cancer. Il est intéressant de noter que le microbiote intestinal des patients atteints d’adénomes ou de CCR diffère de celui des individus en bonne santé. Cette étude vise à identifier les biomarqueurs du microbiome intestinal dans les échantillons fécaux associés au CCR et/ou aux adénomes à haut risque pour améliorer la détection précoce.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Cette étude analysera le microbiome intestinal dans des échantillons de selles prélevés auprès d'individus vivant dans la région métropolitaine de Lisbonne, au Portugal. À l'aide de la métagénomique de fusil de chasse, les enquêteurs visent à identifier les biomarqueurs du microbiome associés à la détection précoce du CCR et à la progression des lésions précancéreuses (adénomes). Les biomarqueurs identifiés seront testés pour développer un outil de dépistage non invasif et hautement sensible du CCR et des lésions précancéreuses.
Objectif principal :
Identifier les biomarqueurs du microbiome intestinal dans l'ADN fécal associés au CCR et/ou aux adénomes à haut risque.
Objectifs secondaires :
i) Établir la corrélation entre les résultats du FIT, les tests du microbiome fécal et les résultats de la coloscopie.
ii) Estimer l'incidence du CCR dans la région métropolitaine de Lisbonne chez les individus âgés de 40 à 74 ans, stratifiés par sexe et groupe d'âge.
iii) Analyser les associations entre les données cliniques (par exemple, les antécédents cliniques, le mode de vie et les habitudes alimentaires), les profils du microbiome fécal, les résultats du FIT et les résultats de la coloscopie, en comparant les individus atteints de CCR et/ou d'adénomes à haut risque avec des individus en bonne santé, pour l'échantillon total. et par sexe et groupe d'âge ; iv) Identifier les facteurs de risque (par exemple, antécédents cliniques, mode de vie, habitudes alimentaires) associés au développement du CCR, stratifiés par sexe et groupe d'âge.
Conception de l'étude :
Il s'agit d'une étude observationnelle, prospective et longitudinale impliquant des personnes âgées de 40 à 74 ans résidant dans la zone métropolitaine de Lisbonne qui s'inscrivent volontairement à l'étude.
Les participants répondant à tous les critères d'inclusion et à aucun critère d'exclusion (tels que détaillés dans la section correspondante) seront inclus. Basé sur des calculs de taille d'échantillon utilisant la formule d'allocation Neyman et en prenant comme référence la répartition de la population vivant dans la zone métropolitaine de Lisbonne (stratifiée par sexe et tranches d'âge : 40-49, 50-59, 60-64, 65-69 et 70-74 ans), ainsi que les hypothèses sur la prévalence et la sensibilité globales du test FIT, un total de 30 000 participants seront inscrits.
Au départ, les participants fourniront un échantillon fécal dans les 2 à 10 jours suivant l'inscription. Données démographiques, cliniques et de style de vie, y compris l'âge, les antécédents familiaux de CCR, les antécédents médicaux personnels, les habitudes tabagiques, les niveaux d'activité physique, le stress et l'indice de masse corporelle (IMC) - seront collectés via des questionnaires auto-administrés. Les habitudes alimentaires et l'adhésion au régime méditerranéen seront évaluées au moyen d'entretiens téléphoniques.
Les participants seront suivis pendant six ans, avec des échantillons fécaux collectés tous les 2 ans. Les données cliniques et de style de vie seront également mises à jour tous les deux ans tout au long de la période d'étude.
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Ana S Almeida, PhD
- Numéro de téléphone: +351 217999411
- E-mail: ana.almeida@gimm.pt
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Madalena Reis
- Numéro de téléphone: +351 217999411
- E-mail: madalena.reis@gimm.pt
Lieux d'étude
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Lisbon District
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Lisbon, Lisbon District, Le Portugal, 1649-028
- Recrutement
- Gulbenkian Institute for Molecular Medicine
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Contact:
- Madalena Reis
- Numéro de téléphone: +351 217999411
- E-mail: madalena.reis@gimm.pt
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Chercheur principal:
- Ana S Almeida, PhD
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Deux stratégies de recrutement différentes seront utilisées :
- Recrutement opportuniste : le recrutement sera réalisé en collaboration avec les services de gastro-entérologie et de médecine générale des hôpitaux partenaires de Lisbonne. Les personnes éligibles devant subir une coloscopie de dépistage seront informées de l'étude par un coordinateur d'étude sur place. Les personnes souhaitant participer signeront un formulaire de consentement éclairé.
- Recrutement aléatoire : les personnes intéressées peuvent accéder à des informations détaillées et évaluer leur éligibilité en remplissant un questionnaire en ligne sur le site Internet de l'étude. Les participants éligibles peuvent s’inscrire et fournir leur consentement éclairé par voie numérique. Après l'inscription, les participants seront contactés pour organiser la livraison d'un kit d'auto-collecte pour le prélèvement d'échantillons de selles.
La description
Critères d'intégration :
- Capacité à fournir un consentement éclairé écrit et à se conformer aux procédures de l'étude
- Résider dans la zone métropolitaine de Lisbonne, Portugal
- Âge de 40 à 74 ans
Critères d'exclusion :
- Âge < 40 ans ou ≥ 75 ans
- Incapable de fournir un consentement éclairé
- Refus de fournir des échantillons de selles
- Maladie oncologique active
- Histoire personnelle du CRC
- Antécédents personnels d'adénomes du côlon retirés au cours des 24 derniers mois
- Antécédents familiaux de CCR au premier degré
- Diagnostic antérieur de maladie inflammatoire de l'intestin (colite ulcéreuse, maladie de Crohn ou colite indéterminée), de syndrome inflammatoire de l'intestin, de gastro-entérite persistante et infectieuse, de colite ou de gastrite, de diarrhée persistante ou chronique d'étiologie inconnue ou d'infection récurrente à Clostridioides difficile.
- Maladies cardiovasculaires ou cardiaques graves avec diagnostic médical
- Insuffisance rénale sévère nécessitant une hémodialyse
- Maladie pulmonaire grave
- Grossesse
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Groupe témoin
Participants en bonne santé avec un résultat de coloscopie négatif
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Aucune intervention : étude observationnelle
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Cancer colorectal
Participants ayant reçu un diagnostic de cancer colorectal confirmé par coloscopie
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Aucune intervention : étude observationnelle
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Polypes à faible risque
Participants avec coloscopie positive et détection d'adénomes à faible risque
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Aucune intervention : étude observationnelle
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Polypes à haut risque
Participants avec coloscopie positive et détection d'adénomes à haut risque
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Aucune intervention : étude observationnelle
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Biomarqueurs du microbiome associés au CCR et/ou aux polypes à haut risque.
Délai: Référence et suivi tous les 2 ans jusqu'à 6 ans
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La composition du microbiote fécal et les profils génétiques seront analysés à l'aide d'un séquençage métagénomique par fusil de chasse sur un sous-ensemble de participants (jusqu'à 10 000 échantillons).
Les données seront intégrées au mode de vie, aux facteurs alimentaires et aux résultats de la coloscopie pour identifier les biomarqueurs liés au CCR et aux adénomes.
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Référence et suivi tous les 2 ans jusqu'à 6 ans
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Corrélation entre les biomarqueurs du microbiome et les résultats FIT
Délai: Référence et suivi tous les 2 ans jusqu'à 6 ans
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Les résultats de l'analyse du microbiome fécal seront comparés aux résultats du test FIT pour évaluer la valeur prédictive, la valeur prédictive négative et l'efficacité globale dans la détection du CCR dans une population asymptomatique.
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Référence et suivi tous les 2 ans jusqu'à 6 ans
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Effet du régime alimentaire sur le risque de CCR et la composition du microbiote intestinal
Délai: Référence
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L'apport alimentaire sera évalué par entretien téléphonique à travers deux rappels de 24 heures, suivant le protocole validé par l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA).
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Référence
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Effet du régime méditerranéen sur le risque de CCR et la composition du microbiote intestinal
Délai: Référence
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L'adhésion au régime méditerranéen sera évaluée à l'aide du questionnaire nutritionnel PREvención con DIeta MEDiterránea (PREDIMED), un outil validé en 14 éléments.
Chaque question est notée soit 0 (condition non remplie), soit 1 (condition remplie), ce qui donne un score total allant de 0 à 14 (7).
Sur la base de ce score final, l'adhésion au régime méditerranéen sera ensuite classée en trois groupes : faible adhésion (score < 5), adhésion modérée (score 6-9) et adhésion élevée (score > 10).
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Référence
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Effet de l'activité physique sur le risque de CCR et la composition du microbiote intestinal
Délai: Référence
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L'activité physique sera évaluée à l'aide du questionnaire court sur l'activité physique nordique, un outil validé composé de deux questions fermées pour surveiller le respect des recommandations de l'OMS en matière d'activité physique.
Les participants seront classés comme « En dessous des recommandations de l'OMS en matière d'activité physique » ou « Égal aux recommandations de l'OMS en matière d'activité physique »
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Référence
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Effet des habitudes de sommeil sur le risque de CCR et la composition du microbiote intestinal
Délai: Référence
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Les habitudes de sommeil seront évaluées par le Pittsburgh Sleep Quality Index (PSQI), un questionnaire validé composé de 19 éléments répartis en sept « composantes » : qualité subjective du sommeil ; latence du sommeil ; durée du sommeil ; efficacité habituelle du sommeil; troubles du sommeil; utilisation de somnifères; dysfonctionnement diurne.
Chaque composant est noté de 0 à 2, et la somme des scores des composants donne un score PSQI global.
Un score PSQI global ≥6 indiquera une mauvaise qualité de sommeil.
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Référence
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Effet des niveaux de stress sur le risque de CCR et la composition du microbiote intestinal
Délai: Référence
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Les niveaux de stress seront évalués par l'échelle de stress perçu, un questionnaire validé composé de 10 questions.
Les scores individuels au PSS peuvent varier de 0 à 40, des scores plus élevés indiquant un stress perçu plus élevé.
Les scores allant de 0 à 13 seront considérés comme un stress faible, 14 à 26 seront considérés comme un stress modéré et des scores allant de 27 à 40 seront considérés comme un stress perçu élevé.
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Référence
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Facteurs de risque (antécédents médicaux, mode de vie et habitudes alimentaires) associés au CCR et/ou aux polypes à haut risque
Délai: Référence et suivi tous les 2 ans jusqu'à 6 ans
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Les participants éligibles seront invités à participer tous les deux ans pendant six ans.
Les données longitudinales identifieront les facteurs de risque importants pour le développement du CCR ou des polypes à haut risque.
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Référence et suivi tous les 2 ans jusqu'à 6 ans
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Collaborateurs et enquêteurs
Publications et liens utiles
Liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- CAML Ref Nº: 111/23
- 101060102 (Autre subvention/numéro de financement: European Union)
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
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