Plasman eksosomaalinen RNA-allekirjoitus eturauhassyövän luustoon etäpesäkkeille (EXO-MET)
Plasman eksosomaalisen RNA:n signatuuri PSMA PET:llä määritellyn luuston etäpesäkkeen ennustamiseksi eturauhassyövässä: Prospektiivinen, monikeskuksinen löytö-, kehittämis- ja validointitutkimus
Lyhyt yhteenveto:
Tämä prospektiivinen, monikeskustutkimus pyrkii löytämään, kehittämään ja validoimaan plasman eksosomaaliseen RNA:han perustuvan allekirjoituksen poissulkutestiksi luustoetastaasien ennustamiseen eturauhassyövässä, käyttäen lähtötilanteen hoitonaivia PSMA-PET-kuvantamista kultaisena standardina. Tutkimus on jaettu neljään peräkkäiseen vaiheeseen:
Vaihe 1 (Löytäminen, n=250): Plasman eksosomaalisten RNA:iden suuritehoinen sekvensointi erilaistuneiden ehdokas-RNA:iden tunnistamiseksi.
Vaihe 2 (Mallin kehitys, n=300): Ehdokkaiden digitaalinen pisara-PCR (ddPCR) -analyysi riippumattomassa kohortissa lopullisen moni-RNA-prediktiivisen allekirjoituksen rakentamiseksi ja lukitsemiseksi käyttäen sopivia koneoppimismenetelmiä.
Vaihe 3 (Sisäinen validointi, n=300): Lukitun allekirjoituksen riippumaton validointi peräkkäisessä kohortissa, joka heijastaa luonnollista taudin esiintyvyyttä.
Vaihe 4 (Ulkoinen validointi, n=150): Lopullinen riippumaton validointi monikeskuksisessa kohortissa, joka on rikastettu luustoetastaasien suhteen.
Ensisijainen tulos:
Arvioida allekirjoituksen diagnostista suorituskykyä poissulkutestinä PSMA-PET:llä määritetyille luustoetastaaseille. Ensisijaiset suorituskykymittarit ovat:
Herkkyys, ennalta määritetty tavoite ≥95% (vähäisten väärien negatiivisten varmistamiseksi).
Tarkkuus (erittely) herkkyystasolla, jolla saavutetaan ≥95% herkkyys. Tarkkuus ≥30% katsotaan kliiniselle hyödylle tueksi. Tarkkuus ≥30% (tai 95% luottamusvälin alaraja ylittää 20%) katsotaan kliiniselle hyödylle tueksi.
Tarve:
Nykyisistä biomarkkereista puuttuu herkkyys ja tarkkuus luustoetastaasien varhaiseen havaitsemiseen. Tärkeämpää on, että olemassa olevista työkaluista puuttuu riittävä negatiivinen ennustearvo (NPV) sulkeakseen luustoetastaasit turvallisesti pois pieniriskisiltä potilailta, mikä johtaa ylikuvantamiseen tai viivästyneeseen havaitsemiseen. On kiireellinen tarve noninvasiiviselle poissulkutestille, jolla PSMA-PET/TT-tutkimus voidaan turvallisesti lykätä erittäin matalan riskin potilailta. Plasman eksosomaaliset RNA:t tarjoavat lupaavan nestebiopsiamenetelmän, mutta prospektiiviset ja tiukan validoinnin sisältävät monikeskustutkimukset puuttuvat.
Toissijaiset tulosmuuttujat:
- Toissijaisia mittareita ovat negatiivinen ennustearvo (NPV), positiivinen ennustearvo (PPV), ROC-käyrän alle jäävä pinta-ala (AUC), kalibrointi ja päätöskäyräanalyysi.
- Eksosomaalisten RNA-tasojen ja luustoetastaasileesioiden lukumäärän (PSMA-PET) välinen korrelaatio.
- Yhteys PSA:han, PSMA-PET SUVmaxiin ja MRI-löydöksiin.
- Kudos-plasma -korrelaatio kasvainalkuperän vahvistamiseksi (tutkiva).
- Keskeisten ehdokkaiden mekanistinen tutkiminen in vitro/in vivo -testeillä (tutkiva).
- Alaryhmäanalyysit hormoniresistenssin!, etastaasikuvion ja Gleason-asteen mukaan (tutkiva).
Sisäänottokriteerit:
- Histologisesti vahvistettu eturauhassyöpä, ja perustason PSMA-PET suunniteltuna.
- PSMA-PET tehty ennen mitään eturauhassyövän hoitoon liittyvää toimenpidettä.
- Verinäytteet kerätty ennen mitään hoitoa JA ennen eturauhasen biopsiaa.
- Halukas käymään eturauhasen biopsiassa, jos kliinisesti aiheellista (verenkeruun jälkeen).
- Kirjallinen tietoon perustuva suostumus.
- Ikä ≥18 vuotta.
Poissulkukriteerit:
- Mikä tahansa aikaisempi eturauhassyövän hoito ennen perustason PSMA-PET:iä.
- Verinäytteet kerätty eturauhasen biopsian jälkeen.
- Muu aktiivinen pahanlaatuinen sairaus viimeisen kahden vuoden aikana (pois lukien ei-melanooma-tyyppinen ihosyöpä).
- Riittämätön verinäytteen laatu tai määrä.
- Vaikeat liitännäissairaudet, jotka haittaavat tutkimuksen suorittamista.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tausta. Eturauhassyöpä (PCa) on maailmanlaajuisesti yksi merkittävimmistä syöpään liittyvän sairastuvuuden syistä, ja luustoetäpesäkkeet ovat yleisin ja vakavin komplikaatio. Varhainen ja tarkka luustoetäpesäkkeiden havaitseminen on kriittistä oikea-aikaisen hoidon ja potilaiden ennusteen parantamiseksi. Nykyiset biomarkkerit, kuten PSA, eivät kuitenkaan ole riittävän herkkiä ja spesifisiä varhaiseen etäpesäkkeiden havaitsemiseen, ja tavanomaiset kuvantamismenetelmät (esim. luustokuvaus, TT) tunnistavat etäpesäkkeitä usein vasta niiden tultua kliinisesti ilmeisiksi. PSMA-PET on noussut herkimmäksi kuvantamismenetelmäksi etäpesäkkeiden statuksen määrittämisessä lähtötilanteessa, mutta sen korkeat kustannukset, rajallinen saatavuus ja säteilyaltistus estävät sen käytön yleisenä seulontatyökaluna.
Samanaikaisesti nesteobiopsia – erityisesti plasman eksosomaalisten RNA:iden analyysi – tarjoaa ainutlaatuisen ikkunan kasvainbiologiaan. Eksosomaaliset RNA:t ovat stabiileja verenkierrossa, heijastavat primaarikasvaimen molekulaarisia ominaisuuksia ja ne voidaan havaita herkillä menetelmillä, kuten suuren suorituskyvyn sekvensoinnilla ja digitaalisella pisara-PCR:llä. Lupauksistaan huolimatta laajamittaiset prospektiiviset monikeskustutkimukset, joissa on tiukka monivaihevalidointi, puuttuvat.
Tarve. On olemassa kriittinen tarve ei-invasiiviselle ja luotettavalle biomarkkerille, joka pystyy tunnistamaan potilaat, joilla on erittäin pieni luustoetäpesäkkeiden riski, mikä mahdollistaisi PSMA-PET/TT:n turvallisen lykkäämisen. Nykyiset työkalut eivät tarjoa riittävää negatiivista ennustearvoa luustoetäpesäkkeiden sulkemiseksi pois matalan riskin populaatioissa. Onnistunut poissulkeva testi vähentäisi tarpeetonta kuvantamista, alentaisi terveydenhuollon kustannuksia ja minimoisi potilaiden säteilyaltistusta. Tämä tutkimus toteuttaa nelivaiheisen suunnitelman, jossa vaihekohtaiset otoskoon harkinnat ovat linjassa nykyaikaisten biomarkkerikehitysstandardien kanssa.
Tutkimussuunnitelma ja tekniset vaiheet. Tämä on prospektiivinen, monikeskuksinen, vaiheittainen biomarkkerin kehitys- ja validointitutkimus. Kultainen standardi luustoetäpesäkkeiden statukselle on lähtötilanteessa tehty hoitamaton PSMA-PET/TT. Kaikki verinäytteet kerätään ennen mitään eturauhassyöpään liittyvää hoitoa ja ennen eturauhasen biopsiaa (jos tehdään) biopsian aiheuttaman kontaminaation välttämiseksi. Kokoveri (noin 10 ml EDTA-putkissa) käsitellään 2 tunnin sisällä plasman saamiseksi, joka säilytetään -80 °C:ssa analyysiin saakka.
Neljä vaihetta määritellään seuraavasti:
Vaihe 1 (Löytövaihe, n=250): Plasman eksosomien suuren suorituskyvyn RNA-sekvensointi (esim. pienten RNA:iden sekvensointi). Differentiaalinen ilmentymisanalyysi (esim. DESeq2 tai edgeR) tunnistaa ehdokas-RNA:t, jotka erottavat potilaat, joilla on ja joilla ei ole luustoetäpesäkkeitä. Moninkertaisten testien korjaus (FDR <0.05) tehdään.
Vaihe 2 (Mallin kehitys, n=300): Riittämätön rikastettu kohortti, jossa luustoetäpesäkkeitä on paljon (noin 200 positiivista, 100 negatiivista), käytetään ehdokas-RNA:iden kvantitatiiviseen mittaamiseen ddPCR:llä. Jatkuva riskipisteytysmalli rakennetaan käyttäen koneoppimista (esim. regularisoitu regressio, satunnaismetsät tai gradienttitehostus). Malli lukitaan sisäisen ristiinvalidonnin jälkeen, ennen kuin mitään validointidataa tarkastellaan.
Vaihe 3 (Sisäinen validointi, n=300): Peräkkäinen kohortti, joka heijastaa luonnollista taudin esiintyvyyttä (odotettu luustoetäpesäkkeiden osuus noin 30%), käytetään lukitun mallin arvioimiseen. Tässä vaiheessa valitaan yksi raja-arvo saavuttamaan ≥95 % herkkyys. Spesifisyys tällä raja-arvolla on ensisijainen päätepiste. Toissijaiset mittarit (NPV, PPV, AUC, kalibrointi, decision curve-analyysi) arvioidaan myös.
Vaihe 4 (Ulkoinen validointi, n=150): Maantieteellisesti erillinen, monikeskuksinen ja luustoetäpesäkkeillä rikastettu kohortti käytetään yleistettävyyden arviointiin, soveltaen samaa raja-arvoa, joka määritettiin vaiheessa 3.
Tilastolliset näkökohdat. Otoskoon perustelu. Otoskoko valittiin julkaistujen suositusten perusteella vaiheistetuille biomarkkeritutkimuksille ja formaalille tarkkuusanalyysille ensisijaisesta päätepisteestä (spesifisyys ≥95 % herkkyysrajalla).
Vaihe 1 (Löytövaihe, n=250): Tämä otoskoko on tyypillinen suuren suorituskyvyn löytötutkimuksille. Odotetulla luustoetäpesäkkeiden esiintyvyydellä noin 30% saadaan noin 75 positiivista ja 175 negatiivista tapausta, mikä antaa riittävän tehon tunnistaa differentiaalinen ilmentyminen FDR<0.05:llä.
Vaihe 2 (Mallin kehitys, n=300): Noudattamalla tapahtumien lukumäärän suhdetta ennustajiin (EPV-sääntö, ≥10 tapahtumaa per ehdokasennustaja) ja olettaen niukan lopullisen mallin (≤20 ehdokas-RNA:ta vaiheen 1 jälkeen), vaaditaan vähintään 200 positiivista tapahtumaa. Kohortti rikastetaan luustoetäpesäkkeillä (tavoite ~67% positiivinen), joten yhteensä 300 potilasta (≈200 positiivista, ≈100 negatiivista) suunnitellaan.
Vaihe 3 (Sisäinen validointi, n=300): Ensisijainen päätepiste on spesifisyys raja-arvolla, joka saavuttaa ≥95% herkkyyden. Olettaen todellisen spesifisyyden 35 % tällä kynnyksellä, otos, jossa on noin 210 negatiivista potilasta (kokonaismäärästä n=300, jossa noin 30%:n luustoetäpesäkkeiden esiintyvyys), tuottaa 95%:n luottamusvälin puolileveydeksi noin ±6-7%. Tämä tarkkuus on enemmän kuin riittävä sulkemaan pois kliinisesti hyödyttömän spesifisyyden (esim. <15%) ja mahdollistaa vahvat alaryhmäanalyysit.
Vaihe 4 (Ulkoinen validointi, n=150): Tämä monikeskuksinen kohortti rikastetaan luustoetäpesäkkeillä (tavoite ~40-50% positiivisia). 150 (≈75 positiivista, ≈75 negatiivista) mahdollistaa spesifisyyden (95%:n luottamusvälin puolileveys ±11% olettaen 35%:n spesifisyyden) ja herkkyyden tarkan arvioinnin riippumattomassa ympäristössä varmistaen yleistettävyyden.
Kaikkia otoskokoja voidaan mukauttaa lievästi todellisen rekrytoinnin perusteella; mahdolliset muutokset dokumentoidaan.
Tilastollinen analyysisuunnitelma (yleistasolla). Analyysit tehdään R-ohjelmistolla (versio ≥4.2). Lopullinen analyysisuunnitelma viimeistellään ennen validointidatan lukitsemista.
Vaihe 1: Differentiaalinen ilmentymisanalyysi (DESeq2/edgeR). Ehdokkaiden valinta perustuu ilmentymistasojen muutokseen, korjattuun p-arvoon ja runsauteen.
Vaihe 2: Koneoppimismallin rakentaminen käyttäen ristiinvalidointia. Lopullinen jatkuva malli lukitaan.
Vaihe 3: Sovelletaan lukittua mallia sisäiseen validointikohorttiin. Määritetään raja-arvo, joka saavuttaa ≥95% herkkyyden. Raportoidaan spesifisyys, NPV, PPV, AUC, kalibrointi ja decision curve -analyysi tällä raja-arvolla.
Vaihe 4: Sovelletaan samaa raja-arvoa ulkoiseen validointikohorttiin ja toistetaan suorituskykyarviointi.
Toissijaiset / tutkivat analyysit: Korrelaatio, alaryhmäanalyysit, mekanistiset tutkimukset (kuten tarkemmin kuvataan toissijaisissa päätepisteissä).
Tiedonhallinta. Tiedot tallennetaan keskitetysti REDCap-tietokantaan kolmivaiheisella tunnistautumisella. Tietojen syöttö tapahtuu noin 3-6 kuukauden välein. Potilaiden yksityisyyttä suojataan.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Jianhua Jiao, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
Opiskelupaikat
-
-
Gansu
-
Lanzhou, Gansu, Kiina
- Rekrytointi
- The First Hospital of Lanzhou University
-
Päätutkija:
- Wei Zhang, MD.
-
Ottaa yhteyttä:
- Wei Zhang, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
-
Ningxia
-
Yinchuan, Ningxia, Kiina
- Rekrytointi
- General Hospital of Ningxia Medical University
-
Ottaa yhteyttä:
- Zhiyong Lv, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Zhiyong Lv, MD.
-
-
Shaanxi
-
Weinan, Shaanxi, Kiina
- Rekrytointi
- Weinan Central Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Weihong Zhao, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Weihong Zhao, MD.
-
Xi'an, Shaanxi, Kiina, 710032
- Rekrytointi
- Xijing Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Jianhua Jiao, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Weijun Qin, MD.
-
Xi'an, Shaanxi, Kiina
- Rekrytointi
- Shaanxi Provincial People's Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Yi Sun, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Yi Sun, MD.
-
Xi'an, Shaanxi, Kiina
- Rekrytointi
- Xijing 986 Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Wuhe Zhang, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Wuhe Zhang, MD.
-
Xianyang, Shaanxi, Kiina
- Rekrytointi
- The Second Affiliated Hospital of Shaanxi University of Chinese Medicine
-
Ottaa yhteyttä:
- Wei Zheng, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Wei Zheng, MD.
-
Xining, Shaanxi, Kiina
- Rekrytointi
- Qinghai University Affiliated Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Guojun Chen, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Guojun Chen, MD.
-
Yan’an, Shaanxi, Kiina
- Rekrytointi
- Affiliated Hospital of Yan'an University
-
Ottaa yhteyttä:
- Jixue Gao, MD.
- Puhelinnumero: +86 18700919857
- Sähköposti: 1531769428@qq.com
-
Päätutkija:
- Gao, MD.
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisäänottokriteerit
- Potilaat, joilla on histologisesti vahvistettu eturauhassyöpä ja jotka on suunniteltu läpikäymään perustason PSMA-PET-kuvaus.
- Potilaat, jotka käyvät PSMA-PET-kuvauksessa ennen mitään eturauhassyöpään liittyvää hoitoa (mukaan lukien androgeenideprivaatiohoito, sädehoito tai leikkaus).
Potilaat, jotka antavat verinäytteitä plasman eksosomaalista RNA-analyysiä varten, jotka on kerätty ennen mitään hoitoa JA ennen eturauhasen biopsiaa (jos sovellettavissa).
Täysverinäytteet (noin 10 ml) kerätään EDTA-putkiin tässä määritellyssä aikapisteessä. Näytteet käsitellään 2 tunnin kuluessa plasman saamiseksi ja säilytetään -80 °C:ssa analyysiin asti. Tämä ajoitus varmistaa, että verenkierron eksosomaaliset RNA-profiilit heijastavat kasvaimen biologiaa ilman biopsian aiheuttamaa kontaminaatiota.
- Potilaat, jotka ovat valmiita käymään eturauhasen biopsiassa, jos se on kliinisesti aiheellista (biopsia suoritetaan verenoton jälkeen).
- Potilaat, jotka antavat kirjallisen suostumuksen osallistuakseen tutkimukseen.
- Ikä ≥ 18 vuotta.
Poissulkukriteerit
- Potilaat, jotka ovat saaneet mitään aikaisempaa eturauhassyöpään liittyvää hoitoa ennen perustason PSMA-PET-kuvausta (mukaan lukien hormonihoito, sädehoito, kemoterapia tai leikkaus).
- Potilaat, joiden verinäytteet on kerätty eturauhasen biopsian jälkeen.
- Potilaat, joilla on ollut muita aktiivisia pahanlaatuisia kasvaimia viimeisen kahden vuoden aikana (pois lukien ei-melanomatoottinen ihosyöpä).
- Potilaat, joilla on riittämätön verinäytteen laatu tai määrä eksosomaalisen RNA:n uuttoa ja analyysiä varten (esim. hemolyysi, riittämätön tilavuus < 8 ml).
- Potilaat, joilla on vaikeita liitännäissairauksia tai tiloja, jotka tutkijan harkinnan mukaan voivat häiritä tutkimuksen noudattamista tai aiheuttaa merkittävää riskiä.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Eturauhassyöpäkohortti
Yksi kohortti, johon kuuluu 1000 potilasta, joilla on epäilty tai histologisesti vahvistettu eturauhassyöpä ja joille tehdään hoitoa edeltävä PSMA PET-kuvaus.
Kaikilta potilailta kerätään verinäytteitä plasman eksosomaalisen RNA:n analyysiä varten ennen mitään hoitoa ja ennen eturauhasen biopsiaa.
Tätä kohorttia käytetään nelivaiheiseen biomarkkeritutkimukseen: Vaihe 1 (Löytövaihe, n=250) RNA-sekvensointia varten kandidaattibiomarkkerien tunnistamiseksi; Vaihe 2 (Mallin kehitys, n=300) digitaaliseen PCR-pohjaiseen signatuurin kehittämiseen; Vaihe 3 (Sisäinen validointi, n=300) riippumatonta validointia varten peräkkäisessä kohortissa; ja Vaihe 4 (Ulkoinen validointi, n=150) monikeskusvalidointia varten.
Luuston etäpesäkkeiden tila määritetään PSMA PET:llä.
Vaiheen 2 ja vaiheen 3 kohortit ovat ajallisesti ja maantieteellisesti riippumattomia.
Yhtään potilasta ei sisällytetä useampaan kuin yhteen vaiheeseen.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Plasman eksosomaalisen RNA-pohjaisen ennustesignatuurin spesifisyys PSMA PET:llä määritellyn luustometastaasin havaitsemiseksi ennalta määritellyllä herkkyysrajalla ≥95%
Aikaikkuna: Lähtötaso
|
Kuvaus: Allekirjoitus kehitetään jatkuvana riskipisteenä käyttäen koneoppimista riippumattomassa kehityskohortissa (vaihe 2, n≥300, rikastettu luuston etäpesäkkeillä). Mallin lukitsemisen jälkeen sisäisessä validointikohortissa (vaihe 3, n≥300, heijastaa luonnollista taudin esiintyvyyttä) valitaan yksittäinen raja-arvo, jotta saavutetaan ≥95 % herkkyys PSMA PET/TT:llä määritellyn luuston etäpesäkkeen havaitsemiseksi. Ensisijainen lopputulos on allekirjoituksen spesifisyys tällä raja-arvolla. Spesifisyyttä ≥30 % (tai 95 %:n luottamusvälin alaraja yli 20 %) pidetään kliinistä hyödyllisyyttä tukevana. Mittausvälineet ja -yksiköt: Plasman eksosomaalinen RNA-taso: digitaalinen pisara-PCR (ddPCR), ilmaistuna absoluuttisena kopiolukuna/ml plasmaa. Luuston etäpesäkkeen status: PSMA PET/TT, binäärinen (positiivinen/negatiivinen). Herkkyys ja spesifisyys: osuudet 95 %:n luottamusväleineen (Clopper-Pearsonin tarkka menetelmä). |
Lähtötaso
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Plasma eksosomaalisen RNA-tason ja PSMA-PET:ssä havaittujen luuston etäpesäkkeiden lukumäärän välinen korrelaatio
Aikaikkuna: Lähtötilanne
|
Luun etäpesäkeleesioiden määrä kvantifioidaan PSMA PET/CT:llä diskreettilaskuna.
Spearmanin järjestyskorrelaatiokerroin (rho) lasketaan monotonisen assosiaation arvioimiseksi eksosomaalisen RNA-tason kanssa.
|
Lähtötilanne
|
|
Korrelaatio plasman eksosomaalisten RNA-tasojen ja seerumin PSA-tasojen välillä
Aikaikkuna: Perustaso
|
Seerumin PSA mitataan ng/mL käyttäen standardeja kliinisen laboratorion menetelmiä.
Spearmanin korrelaatiokerroin lasketaan.
|
Perustaso
|
|
Korrelaatio plasman eksosomaalisen RNA-tason ja PSMA PET SUVmax -arvon välillä
Aikaikkuna: Lähtötaso
|
<div lang="fi">SUVmax (maksimaalinen standardoitu ottoarvo) johdetaan PSMA-PET/TT:stä.
Spearmanin korrelaatiokerroin lasketaan.</div> |
Lähtötaso
|
|
Association between exo-RNA and MRI findings (exploratory)
Aikaikkuna: Lähtötaso
|
MRI-löydökset luokitellaan PI-RADpisteiksi, ">epäilyttävä luuston etäpesäkkeestä<" tai ">ei epäilyttävä<".
|
Lähtötaso
|
|
Korrelaatio kudoksen RNA-ilmentymisen (RNA-seq, normalisoidut luvut kuten FPKM/TPM) ja plasman eksosomaalisen RNA-tason (ddPCR, kopiot/mL) välillä
Aikaikkuna: Perustaso
|
Potilailla, joilta on saatavilla formaliinilla kiinnitettyjä parafiiniin valettuja (FFPE) tai tuoreita jäädytettyjä kasvainkudosnäytteitä, valittujen eksosomaalisten RNA-ehdokkaiden (esim. 2-3 eniten differentiaalisesti ilmentynyttä RNA:ta lukitusta signatuurista) RNA-ilmentyminen mitataan RNA-sekvensoinnilla (RNA-seq). Ilmentymistasot kvantifioidaan normalisoituina lukuina (esim. fragmentteja per kilobasi transkriptiota per miljoona kartoitettua lukemaa [FPKM] tai transkriptejä per miljoona [TPM]) käyttäen standardeja bioinformatiikan työnkulkuja (esim. STAR + featureCounts + DESeq2 normalisointi). Saman ehdokkaan vastaava plasman eksosomaalinen RNA-taso mitataan digitaalisella pisara-PCR:llä (ddPCR) ja ilmaistaan absoluuttisena kopiolukumääränä per ml plasmaa. Spearmanin järjestyskorrelaatiokerroin (rho) ja sen 95 %:n luottamusväli lasketaan kudos- ja plasmatasojen välisen yhteyden vahvuuden arvioimiseksi. |
Perustaso
|
|
Keskeisten ajuriehdokkaiden mekanistinen tutkiminen toiminnallisilla määrityksillä (tutkiva)
Aikaikkuna: Lähtötilanne
|
Kaikkein merkittävimmin epäsäädellyille RNA-ehdokkaille validoidusta signatuurista suoritetaan funktionaalisia määrityksiä: Soluproliferaatio: CCK-8-määritys mitattuna absorbanssina aallonpituudella 450 nm, tai EdU-määritys mitattuna EdU-positiivisten solujen prosenttiosuutena. Solumigraatio/invasiivisuus: Transwell-määritys mitattuna migroituneiden/invasiivisten solujen lukumääränä suuritehoisella kentällä (keskiarvo 5 kentästä). In vivo -kasvainkasvu: kasvaimen tilavuus mitattuna työntömitalla mm³ käyttäen kaavaa (pituus × leveys²)/2. In vivo etäpesäkkeet: laskettujen makroskooppisten etäpesäkkeiden lukumäärä. Kuvailevaa tilastotietoa (keskiarvo ± SD, mediaani IQR:llä) raportoidaan. |
Lähtötilanne
|
|
Diagnostisen suorituskyvyn alaryhmäanalyysit (tutkiva)
Aikaikkuna: Lähtötaso
|
Lukitasn allekirjoitetun tunnusmerkistön suorituskyky (herkkyys, tarkkuus, negatiivinen ennustearvo, positiivinen ennustearvo) lasketaan erikseen seuraaville ryhmille: Hormoniherkkä vs. kastraatioresistentti eturauhassyöpä Oligometastaattinen (≤3 leesiota) vs. polymetastaattinen (>3 leesiota) tauti Gleasonin luokitusryhmä ≤7 vs. ≥8 Jokainen suorituskykymittari raportoidaan 95 %:n luottamusväleillä. |
Lähtötaso
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Urogenitaaliset sairaudet
- Sukuelinten sairaudet
- Patologiset prosessit
- Sukuelinten kasvaimet, mies
- Urogenitaaliset kasvaimet
- Neoplasmat sivustoittain
- Neoplasmat
- Sukuelinten sairaudet, mies
- Eturauhasen sairaudet
- Miesten urogenitaaliset sairaudet
- Patologiset tilat, merkit ja oireet
- Eturauhasen kasvaimet
- Sairaus
Muut tutkimustunnusnumerot
- KY20262011-F-1
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .