- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT07553754
Sygnatura RNA w egzosomach osocza dla przerzutów do kości raka prostaty (EXO-MET)
Sygnatura RNA z egzosomów osocza do przewidywania przerzutów do kości zdefiniowanych za pomocą PSMA PET w raku prostaty: prospektywne, wieloośrodkowe badanie odkrywcze, opracowawcze i walidacyjne
Krótkie podsumowanie:
To prospektywne, wieloośrodkowe badanie ma na celu odkrycie, opracowanie i walidację sygnatury opartej na RNA z egzosomów w osoczu jako testu wykluczającego przerzuty do kości w raku prostaty, z zastosowaniem jako złotego standardu wyjściowego, nienaładowanego leczeniem PSMA PET. Badanie zaprojektowano w czterech następujących po sobie fazach:
Faza 1 (Odkrycie, n=250): Sekwencjonowanie wysokoprzepustowe RNA z egzosomów osocza w celu identyfikacji różnicowo eksprymowanych kandydackich RNA.
Faza 2 (Opracowanie modelu, n=300): Analiza za pomocą cyfrowego PCR kropelkowego (ddPCR) kandydatów w niezależnej kohorcie w celu skonstruowania i utrwalenia ostatecznej, wielo-RNA predykcyjnej sygnatury przy użyciu odpowiednich metod uczenia maszynowego.
Faza 3 (Walidacja wewnętrzna, n=300): Niezależna walidacja utrwalonej sygnatury na kolejnej kohorcie odzwierciedlającej naturalną częstość występowania choroby.
Faza 4 (Walidacja zewnętrzna, n=150): Ostateczna niezależna walidacja na kohorcie wieloośrodkowej wzbogaconej o przerzuty do kości.
Główny punkt końcowy:
Ocena wydajności diagnostycznej sygnatury jako testu wykluczającego przerzuty do kości określone za pomocą PSMA PET. Podstawowymi miarami wydajności są:
Czułość, z predefiniowanym celem ≥95% (aby zminimalizować wyniki fałszywie ujemne).
Swoistość przy progu osiągającym czułość ≥95%. Swoistość ≥30% zostanie uznana za wspierającą użyteczność kliniczną. Swoistość ≥30% (lub dolna granica 95% przedziału ufności przekraczająca 20%) zostanie uznana za wspierającą użyteczność kliniczną.
Zapotrzebowanie:
Obecne biomarkery mają niską czułość i swoistość dla wczesnego wykrywania przerzutów do kości. Co ważniejsze, istniejące narzędzia nie mają wystarczającej wartości predykcyjnej ujemnej, aby bezpiecznie wykluczyć przerzuty do kości u pacjentów niskiego ryzyka, co prowadzi do nadmiernej diagnostyki obrazowej lub opóźnionego wykrywania. Istnieje pilna potrzeba opracowania nieinwazyjnego testu wykluczającego, aby bezpiecznie odroczyć PSMA PET/CT u pacjentów bardzo niskiego ryzyka. RNA z egzosomów osocza oferują obiecujące podejście do biopsji płynnej, ale brakuje prospektywnych, wieloośrodkowych badań z rygorystyczną walidacją.
Punkty końcowe drugorzędowe:
- Drugorzędowymi wskaźnikami są wartość predykcyjna ujemna (NPV), wartość predykcyjna dodatnia (PPV), pole pod krzywą ROC (AUC), kalibracja i analiza krzywych decyzyjnych.
- Korelacja między poziomami egzosomalnego RNA a liczbą przerzutów do kości (PSMA PET).
- Związek z PSA, SUVmax w PSMA PET i wynikami MRI.
- Korelacja tkankowo-osoczowa w celu potwierdzenia pochodzenia nowotworu (eksploracyjnie).
- Eksploracja mechanistyczna kluczowych kandydatów za pomocą testów in vitro/in vivo (eksploracyjnie).
- Analizy podgrup według wrażliwości hormonalnej, wzorca przerzutów, stopnia złośliwości w skali Gleasona (eksploracyjnie).
Kryteria włączenia:
- Potwierdzony histologicznie rak prostaty zaplanowany do wyjściowego PSMA PET.
- PSMA PET wykonane przed jakimkolwiek leczeniem raka prostaty.
- Próbki krwi pobrane przed jakimkolwiek leczeniem ORAZ przed biopsją prostaty.
- Gotowość do poddania się biopsji prostaty, jeśli jest wskazana klinicznie (po pobraniu krwi).
- Świadoma zgoda na piśmie.
- Wiek ≥18 lat.
Kryteria wykluczenia:
- Jakiekolwiek wcześniejsze leczenie raka prostaty przed wyjściowym PSMA PET.
- Próbki krwi pobrane po biopsji prostaty.
- Inny aktywny nowotwór złośliwy w ciągu ostatnich dwóch lat (z wyjątkiem nieczerniakowego raka skóry).
- Nieodpowiednia jakość lub objętość próbki krwi.
- Ciężkie choroby współistniejące zakłócające przebieg badania.
Przegląd badań
Status
Szczegółowy opis
Tło Rak gruczołu krokowego (PCa) jest główną przyczyną zachorowalności związanej z nowotworami na świecie, a przerzuty do kości są najczęstszym i najbardziej niszczycielskim powikłaniem. Wczesne i dokładne wykrycie przerzutów do kości jest kluczowe dla szybkiego leczenia i poprawy wyników leczenia pacjentów. Jednak obecne biomarkery, takie jak PSA, nie mają wystarczającej czułości i swoistości do wczesnego wykrywania przerzutów, a konwencjonalne obrazowanie (np. scyntygrafia kości, CT) często identyfikuje przerzuty dopiero po ich klinicznym ujawnieniu. PSMA PET wyłoniło się jako najbardziej czuła metoda obrazowania do określania statusu przerzutów na początku leczenia, ale jego wysoki koszt, ograniczona dostępność i ekspozycja na promieniowanie uniemożliwiają jego zastosowanie jako uniwersalnego narzędzia przesiewowego.
Równocześnie biopsja płynna – w szczególności analiza egzosomalnych RNA w osoczu – oferuje unikalne okno do biologii guza. Egzosomalne RNA są stabilne w krążeniu, odzwierciedlają charakterystykę cząsteczkową pierwotnego guza i mogą być wykrywane za pomocą czułych metod, takich jak sekwencjonowanie o wysokiej przepustowości i cyfrowa PCR kropelkowa. Pomimo swojego potencjału, brakuje prospektywnych wieloośrodkowych badań na dużą skalę z rygorystyczną, wielofazową walidacją.
Potrzeba Istnieje niezaspokojona potrzeba nieinwazyjnego, solidnego biomarkera, który pozwoliłby zidentyfikować pacjentów o bardzo niskim ryzyku przerzutów do kości, umożliwiając tym samym bezpieczne odroczenie PSMA PET/CT. Istniejące narzędzia nie mają wystarczającej ujemnej wartości predykcyjnej, aby z pewnością wykluczyć przerzuty do kości w populacjach niskiego ryzyka. Udany test wykluczający zmniejszyłby niepotrzebne obrazowanie, obniżył koszty opieki zdrowotnej i zminimalizował ekspozycję pacjenta na promieniowanie. To badanie realizuje czterofazowy projekt z uwzględnieniem wielkości próby w poszczególnych fazach, zgodny z współczesnymi standardami rozwoju biomarkerów.
Projekt badania i fazy techniczne Jest to prospektywne, wieloośrodkowe, fazowo-sekwencyjne badanie rozwoju i walidacji biomarkera. Złotym standardem dla statusu przerzutów do kości jest wyjściowe, nieleczone PSMA PET/CT. Wszystkie próbki krwi są pobierane przed jakimkolwiek leczeniem związanym z rakiem prostaty i przed biopsją prostaty (jeśli wykonywaną), aby uniknąć zanieczyszczenia spowodowanego biopsją. Pełna krew (około 10 ml w probówkach EDTA) jest przetwarzana w ciągu 2 godzin w celu uzyskania osocza, które jest przechowywane w temperaturze -80°C do czasu analizy.
Cztery fazy są zdefiniowane następująco:
Faza 1 (Odkrycie, n=250): Sekwencjonowanie RNA o wysokiej przepustowości (np. małe RNA-seq) egzosomów w osoczu. Analiza różnicowej ekspresji (np. DESeq2 lub edgeR) identyfikuje kandydackie RNA odróżniające pacjentów z przerzutami do kości od pacjentów bez takich przerzutów. Zastosowano korektę na wielokrotne testowanie (FDR <0,05).
Faza 2 (Budowa modelu, n=300): Niezależna kohorta wzbogacona w przerzuty do kości (około 200 pozytywnych, 100 negatywnych) jest używana do ilościowego pomiaru kandydackich RNA za pomocą ddPCR. Model ciągłej oceny ryzyka jest konstruowany przy użyciu uczenia maszynowego (np. regulowana regresja, lasy losowe lub boosting gradientowy). Model jest zamrażany po wewnętrznej walidacji krzyżowej, przed przeanalizowaniem jakichkolwiek danych walidacyjnych.
Faza 3 (Wewnętrzna walidacja, n=300): Kohorta następujących po sobie pacjentów odzwierciedlająca naturalną częstość występowania choroby (oczekiwany wskaźnik przerzutów do kości ~30%) jest używana do oceny zamrożonego modelu. W tej fazie wybiera się pojedynczą wartość odcięcia, aby osiągnąć czułość ≥95%. Swoistość przy tym odcięciu jest pierwszorzędowym punktem końcowym. Oceniane są również drugorzędowe miary (NPV, PPV, AUC, kalibracja, analiza krzywych decyzyjnych).
Faza 4 (Zewnętrzna walidacja, n=150): Geograficznie odrębna, wieloośrodkowa kohorta wzbogacona w przerzuty do kości jest używana do oceny uogólnialności, z zastosowaniem tego samego odcięcia określonego w Fazie 3.
Uwagi statystyczne Uzasadnienie wielkości próby Wielkość próby została wybrana na podstawie opublikowanych zaleceń dotyczących fazowych badań biomarkerów oraz formalnej analizy precyzji dla pierwszorzędowego punktu końcowego (swoistość przy progu czułości ≥95%).
Faza 1 (Odkrycie, n=250): Ta wielkość próby jest typowa dla badań odkrywczych o wysokiej przepustowości. Przy oczekiwanej częstości przerzutów do kości wynoszącej ~30%, dostępnych będzie około 75 przypadków pozytywnych i 175 negatywnych, zapewniając wystarczającą moc do wykrycia różnicowej ekspresji z FDR <0,05.
Faza 2 (Budowa modelu, n=300): Zgodnie z zasadą „zdarzenia na zmienną” (EPV) (≥10 zdarzeń na kandydacką zmienną predykcyjną) i zakładając oszczędny model końcowy (≤20 kandydackich RNA po Fazie 1), wymagane jest co najmniej 200 pozytywnych zdarzeń. Kohorta jest wzbogacona w przerzuty do kości (cel ~67% pozytywnych), dlatego zaplanowano łącznie 300 pacjentów (~200 pozytywnych, ~100 negatywnych).
Faza 3 (Wewnętrzna walidacja, n=300): Pierwszorzędowym punktem końcowym jest swoistość przy odcięciu osiągającym czułość ≥95%. Zakładając rzeczywistą swoistość 35% przy tym progu, próba około 210 pacjentów negatywnych (z całkowitej liczby n=300 przy częstości przerzutów do kości ~30%) daje połowę szerokości 95% przedziału ufności wynoszącą około ±6-7%. Ta precyzja jest więcej niż wystarczająca, aby wykluczyć klinicznie bezużyteczną swoistość (np. <15%) i umożliwia solidne analizy podgrup.
Faza 4 (Zewnętrzna walidacja, n=150): Ta wieloośrodkowa kohorta jest wzbogacona w przerzuty do kości (cel ~40-50% pozytywnych). Wielkość próby wynosząca 150 (~75 pozytywnych, ~75 negatywnych) pozwala na precyzyjne oszacowanie swoistości (95% CI połowa szerokości ±11% przy założeniu 35% swoistości) i czułości w niezależnym otoczeniu, potwierdzając uogólnialność.
Wszystkie wielkości próby mogą być skromnie dostosowane w oparciu o rzeczywistą rekrutację; wszelkie dostosowania będą udokumentowane.
Plan analizy statystycznej (na wysokim poziomie) Analizy zostaną przeprowadzone przy użyciu R (wersja ≥4.2). Ostateczny plan analizy zostanie sfinalizowany przed zamrożeniem danych walidacyjnych.
Faza 1: Analiza różnicowej ekspresji (DESeq2/edgeR). Wybór kandydatów na podstawie stopnia zmiany, skorygowanego p-value i liczności.
Faza 2: Budowa modelu uczenia maszynowego z użyciem walidacji krzyżowej. Ostateczny model ciągły jest zamrażany.
Faza 3: Zastosowanie zamrożonego modelu do wewnętrznej kohorty walidacyjnej. Określenie wartości odcięcia, która osiąga czułość ≥95%. Raportowanie swoistości, NPV, PPV, AUC, kalibracji i analizy krzywych decyzyjnych przy tym odcięciu.
Faza 4: Zastosowanie tego samego odcięcia do zewnętrznej kohorty walidacyjnej i powtórzenie oceny wydajności.
Analizy drugorzędowe/eksploracyjne: Korelacja, analizy podgrup, badania mechanistyczne (jak szczegółowo opisano w drugorzędowych miarach wyników).
Zarządzanie danymi Dane będą przechowywane centralnie w bazie REDCap z 3-stopniowym uwierzytelnianiem. Wprowadzanie danych będzie odbywać się mniej więcej co 3-6 miesięcy. Dane pacjenta zostaną utrzymane w poufności.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Jianhua Jiao, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
Lokalizacje studiów
-
-
Gansu
-
Lanzhou, Gansu, Chiny
- Rekrutacyjny
- The First Hospital of Lanzhou University
-
Główny śledczy:
- Wei Zhang, MD.
-
Kontakt:
- Wei Zhang, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
-
Ningxia
-
Yinchuan, Ningxia, Chiny
- Rekrutacyjny
- General Hospital of Ningxia Medical University
-
Kontakt:
- Zhiyong Lv, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Zhiyong Lv, MD.
-
-
Shaanxi
-
Weinan, Shaanxi, Chiny
- Rekrutacyjny
- Weinan Central Hospital
-
Kontakt:
- Weihong Zhao, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Weihong Zhao, MD.
-
Xi'an, Shaanxi, Chiny, 710032
- Rekrutacyjny
- Xijing Hospital
-
Kontakt:
- Jianhua Jiao, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Weijun Qin, MD.
-
Xi'an, Shaanxi, Chiny
- Rekrutacyjny
- Shaanxi Provincial People's Hospital
-
Kontakt:
- Yi Sun, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Yi Sun, MD.
-
Xi'an, Shaanxi, Chiny
- Rekrutacyjny
- Xijing 986 Hospital
-
Kontakt:
- Wuhe Zhang, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Wuhe Zhang, MD.
-
Xianyang, Shaanxi, Chiny
- Rekrutacyjny
- The Second Affiliated Hospital of Shaanxi University of Chinese Medicine
-
Kontakt:
- Wei Zheng, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Wei Zheng, MD.
-
Xining, Shaanxi, Chiny
- Rekrutacyjny
- Qinghai University Affiliated Hospital
-
Kontakt:
- Guojun Chen, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Guojun Chen, MD.
-
Yan’an, Shaanxi, Chiny
- Rekrutacyjny
- Affiliated Hospital of Yan'an University
-
Kontakt:
- Jixue Gao, MD.
- Numer telefonu: +86 18700919857
- E-mail: 1531769428@qq.com
-
Główny śledczy:
- Gao, MD.
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Wszyscy pacjenci przechodzą wyjściowe PSMA PET/CT i dostarczają próbki krwi przed leczeniem (pobrane przed jakąkolwiek terapią i przed biopsją prostaty).
Pojedyncza, ogólna kohorta jest przydzielana do czterech sekwencyjnych, niezależnych faz: Faza 1 (Odkrywcza, n=250), Faza 2 (Rozwój Modelu, n≥300, wzbogacona o przerzuty do kości), Faza 3 (Wewnętrzna Walidacja, n≥300, naturalna częstość występowania) oraz Faza 4 (Zewnętrzna Walidacja, n=150, wzbogacona wieloośrodkowo).
Status przerzutów do kości jest definiowany na podstawie PSMA PET/CT.
Opis
Kryteria włączenia
- Pacjenci z potwierdzonym histologicznie rakiem prostaty, którzy mają zaplanowane wykonanie wyjściowego obrazowania PSMA PET.
- Pacjenci poddawani obrazowaniu PSMA PET przed jakimkolwiek leczeniem związanym z rakiem prostaty (w tym terapią deprywacji androgenowej, radioterapią lub operacją).
Pacjenci, którzy dostarczą próbki krwi do analizy egzosomalnego RNA w osoczu, pobrane przed jakimkolwiek leczeniem ORAZ przed biopsją prostaty (jeśli dotyczy).
Pełne próbki krwi (około 10 ml) będą pobierane do probówek EDTA w tym określonym czasie. Próbki będą przetwarzane w ciągu 2 godzin w celu uzyskania osocza i przechowywane w temperaturze -80°C do czasu analizy. Ten harmonogram zapewnia, że krążące profile egzosomalnego RNA odzwierciedlają biologię guza bez zanieczyszczenia wywołanego biopsją.
- Pacjenci, którzy wyrażają zgodę na biopsję prostaty, jeśli jest wskazana klinicznie (biopsja wykonywana po pobraniu krwi).
- Pacjenci, którzy udzielą pisemnej świadomej zgody na udział w badaniu.
- Wiek ≥18 lat.
Kryteria wykluczenia
- Pacjenci, którzy otrzymali jakiekolwiek wcześniejsze leczenie związane z rakiem prostaty przed wyjściowym badaniem PSMA PET (w tym terapię hormonalną, radioterapię, chemioterapię lub operację).
- Pacjenci, u których próbki krwi pobrano po biopsji prostaty.
- Pacjenci z historią innych aktywnych nowotworów w ciągu ostatnich dwóch lat (z wyłączeniem raka skóry niebędącego czerniakiem).
- Pacjenci z niewystarczającą jakością lub ilością próbki krwi do ekstrakcji i analizy egzosomalnego RNA (np. hemoliza, niewystarczająca objętość <8 ml).
- Pacjenci z ciężkimi chorobami współistniejącymi lub stanami, które w ocenie badacza mogą zakłócać przestrzeganie protokołu badania lub stanowić istotne ryzyko.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Kohorta raka prostaty
Jedna kohorta składająca się z 1000 pacjentów z podejrzeniem lub histologicznie potwierdzonym rakiem prostaty, którzy przechodzą wyjściowe badanie PSMA PET przed leczeniem.
Wszyscy pacjenci dostarczają próbki krwi do analizy egzosomalnego RNA z osocza, pobrane przed rozpoczęciem leczenia oraz przed biopsją prostaty. Kohorta ta jest wykorzystywana w czterofazowym badaniu biomarkerów: Faza 1 (Odkrycie, n=250) – sekwencjonowanie RNA w celu identyfikacji potencjalnych biomarkerów; Faza 2 (Opracowanie modelu, n=300) – opracowanie sygnatury opartej na cyfrowym PCR; Faza 3 (Wewnętrzna walidacja, n=300) – niezależna walidacja w kolejnej kohorcie; oraz Faza 4 (Zewnętrzna walidacja, n=150) – walidacja wieloośrodkowa. Stan przerzutów do kości definiowany jest na podstawie PSMA PET. Kohorty z fazy 2 i 3 są czasowo i geograficznie niezależne. Żaden pacjent nie jest uwzględniony w więcej niż jednej fazie. |
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Specyficzność osoczowego sygnatury predykcyjnej opartej na egzosomowym RNA do wykrywania przerzutów do kości zdefiniowanych przez PSMA PET przy wcześniej określonym progu czułości ≥95%
Ramy czasowe:
"Poziom wyjściowy"
|
Opis: Sygnał zostanie opracowany jako ciągłe ryzyko punktowe przy użyciu uczenia maszynowego w niezależnej kohorcie rozwojowej (Faza 2, n≥300, wzbogaconej o przerzuty do kości). Po zamknięciu modelu, pojedyncza wartość odcięcia zostanie wybrana w kohorcie walidacji wewnętrznej (Faza 3, n≥300, odzwierciedlająca naturalne występowanie choroby), aby osiągnąć czułość ≥95% w wykrywaniu przerzutów do kości w PSMA PET/CT. Pierwszorzędowym wynikiem jest swoistość sygnału przy tym punkcie odcięcia. Swoistość ≥30% (lub dolna granica 95% przedziału ufności przekraczająca 20%) będzie uznawana jako potwierdzenie przydatności klinicznej. Narzędzia pomiarowe i jednostki: Poziom egzosomowego RNA w osoczu: cyfrowy PCR kroplowy (ddPCR), wyrażony jako bezwzględna liczba kopii na mL osocza. Status przerzutów do kości: PSMA PET/CT, binarny (dodatni/ujemny). Czułość i swoistość: proporcje z 95% przedziałami ufności (dokładna metoda Cloppera-Pearsona). |
"Poziom wyjściowy"
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Korelacja między poziomem RNA w egzosomach osocza a liczbą ognisk przerzutów do kości w obrazowaniu PSMA PET
Ramy czasowe: (początkowa obserwacja)
|
Liczba ognisk przerzutów do kości zostanie określona ilościowo za pomocą PSMA PET\/CT jako liczba dyskretna.\nWspółczynnik korelacji rang Spearmana (rho) zostanie obliczony w celu oceny monotonicznego związku z poziomem RNA egzosomów.
|
(początkowa obserwacja)
|
|
Korelacja między poziomem RNA w pęcherzykach zewnątrzkomórkowych osocza a poziomem PSA w surowicy
Ramy czasowe: Punkty wyjściowe
|
Stężenie PSA w surowicy będzie mierzone w ng/mL przy użyciu standardowych metod laboratoryjnych.
Współczynnik korelacji Spearmana zostanie obliczony.
|
Punkty wyjściowe
|
|
Korelacja między poziomem RNA w egzosomach osocza a wartością SUVmax w PET PSMA
Ramy czasowe: 9Wartości wyjāciowe
|
Wartość SUVmax (maksymalna standaryzowana wartość wychwytu) zostanie uzyskana z PSMA PET/CT.
Współczynnik korelacji Spearmana zostanie obliczony.
|
9Wartości wyjāciowe
|
|
Związek między egzo-RNA a wynikami MRI (badanie eksploracyjne)
Ramy czasowe: Linia wyjściowa
|
Wyniki MRI będą kategoriekowane jako wyniki PI-RADs, "podejrzane o przerzuty do kości" lub "niepodejrzane".
|
Linia wyjściowa
|
|
Korelacja między ekspresją RNA w tkankach (RNA-seq, znormalizowane liczebności takie jak FPKM/TPM) a poziomem RNA w egzosomach osocza (ddPCR, kopie/mL)
Ramy czasowe: Wartość wyjściowa
|
U pacjentów z dostępnymi próbkami guza utrwalonymi w formalinie i zatopionymi w parafinie (FFPE) lub świeżo mrożonymi, ekspresja RNA wybranych kandydatów na egzosomalne RNA (np. 2-3 najbardziej zróżnicowanych RNA z ustalonego sygnatury) będzie mierzona za pomocą sekwencjonowania RNA (RNA-seq). Odpowiadający poziom egzosomalnego RNA w osoczu tego samego kandydata jest mierzony za pomocą cyfrowego PCR kropelkowego (ddPCR) i wyrażany jako bezwzględna liczba kopii na mL osocza. Współczynnik korelacji rang Spearmana (rho) i jego 95% przedział ufności zostaną obliczone w celu oceny siły związku między poziomami w tkance i osoczu. |
Wartość wyjściowa
|
|
Badanie mechanistyczne kluczowych kandydatów na czynniki sterujące poprzez testy funkcjonalne (eksploracyjne)
Ramy czasowe: Baseline
|
Dla najbardziej istotnie zaburzonego (jednego lub więcej) RNA z walidowanej sygnatury przeprowadzone zostaną testy funkcjonalne: Proliferacja komórek: test CCK-8 mierzony jako absorbancja przy 450 nm, lub test EdU mierzony jako odsetek komórek EdU-dodatnich. Migracja/inwazja komórek: test Transwell mierzony jako liczba zamigrowanych/zainwazowanych komórek na pole o dużej mocy (średnia z 5 pól). Wzrost guza in vivo: objętość guza mierzona suwmiarką w mm³ za pomocą wzoru (długość × szerokość²)/2. Przerzuty in vivo: liczba makroskopowych guzków przerzutowych zliczona. Statystyka opisowa (średnia ± SD, mediana z IQR) zostanie podana. |
Baseline
|
|
Analizy podgrup wydajności diagnostycznej (eksploracyjne)
Ramy czasowe: Wartość początkowa
|
Wydajność zablokowanego sygnatury (czułość, swoistość, ujemna wartość predykcyjna, dodatnia wartość predykcyjna) zostanie obliczona osobno dla: Rak prostaty hormonoważny w porównaniu z opornym na kastrację Choroba oligometatstatyczna (≤3 zmiany) w porównaniu z polimetastatyczną (>3 zmiany) Grupa stopnia Gleasona ≤7 w porównaniu z ≥8 Każdy wskaźnik wydajności zostanie przedstawiony z 95% przedziałami ufności. |
Wartość początkowa
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Współpracownicy
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Choroby układu moczowo-płciowego
- Choroby narządów płciowych
- Procesy patologiczne
- Nowotwory narządów płciowych, mężczyzna
- Nowotwory układu moczowo-płciowego
- Nowotwory według lokalizacji
- Nowotwory
- Choroby narządów płciowych, mężczyzna
- Choroby prostaty
- Choroby układu moczowo-płciowego u mężczyzn
- Stany patologiczne, oznaki i objawy
- Nowotwory prostaty
- Choroba
Inne numery identyfikacyjne badania
- KY20262011-F-1
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .