- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT01775072
Profilage génomique chez les patients cancéreux
Le but de cette étude est de déterminer si certains gènes du cancer peuvent être anormaux. Lorsqu'un gène est anormal, cela s'appelle une mutation. La plupart des mutations dans les cellules cancéreuses ne sont pas héréditaires (transmises par les parents) mais se produisent après la naissance dans le cancer lui-même. La plupart des cancers ont de nombreuses mutations. Certaines de ces mutations sont importantes pour la survie des cellules cancéreuses alors que d'autres ne le sont pas. L'objectif de cette étude est de tester le cancer pour certaines mutations à l'aide de tissus tumoraux restants d'une chirurgie ou d'une biopsie antérieure. Les participants seront également invités à fournir un tube d'écouvillon sanguin (également connu sous le nom d'écouvillon buccal) ou un échantillon de salive contenant des gènes normaux à des fins de comparaison.
Le but de la partie B de cette étude est de :
Comprendre comment les changements génétiques dans la tumeur affectent les chances de répondre à un traitement anticancéreux expérimental. Comprendre comment les gènes de la tumeur changent au fil du temps en réponse à un traitement ciblé contre le cancer.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Zsofia Stadler, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-4039
Lieux d'étude
-
-
Connecticut
-
Bridgeport, Connecticut, États-Unis, 06606
- Pas encore de recrutement
- St. Vincent (Data Collection Only)
-
Contact:
- Christopher Iannuzzi, MD
- Numéro de téléphone: 203-576-6000
-
Hartford, Connecticut, États-Unis, 06102
- Pas encore de recrutement
- Hartford Healthcare Cancer Institute @ Hartford Hospital
-
Contact:
- Andrew Salner, MD
- Numéro de téléphone: 860-972-2803
-
Norwalk, Connecticut, États-Unis, 06850
- Recrutement
- Norwalk Hospital
-
Contact:
- Linda Vahdat, MD
- Numéro de téléphone: 203-845-4811
-
-
Florida
-
Miami, Florida, États-Unis, 33143
- Recrutement
- Baptist Alliance MCI
-
Contact:
- John Diaz, MD
- Numéro de téléphone: 786-596-2000
-
-
New Jersey
-
Basking Ridge, New Jersey, États-Unis, 07920
- Recrutement
- Memorial Sloan Kettering Basking Ridge
-
Contact:
- David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
-
Middletown, New Jersey, États-Unis, 07748
- Recrutement
- Memorial Sloan Kettering Monmouth
-
Contact:
- David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
-
Montvale, New Jersey, États-Unis, 07645
- Recrutement
- Memorial Sloan Kettering Bergen
-
Contact:
- David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
-
-
New York
-
Brooklyn, New York, États-Unis, 11203
- Recrutement
- Kings County Hopsital Center
-
Contact:
- Jason Gonsky, MD
- Numéro de téléphone: 718-245-2847
-
Commack, New York, États-Unis, 11725
- Recrutement
- Memorial Sloan Kettering Cancer Commack
-
Contact:
- David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
-
Harrison, New York, États-Unis, 10604
- Recrutement
- Memorial Sloan Kettering Westchester
-
Contact:
- David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
-
Jamaica, New York, États-Unis, 11432
- Recrutement
- Queens Cancer Center of Queens Hospital
-
Contact:
- Debra Ferman, MD
- Numéro de téléphone: 718-579-6021
-
New York, New York, États-Unis, 10065
- Recrutement
- Memorial Sloan Kettering Cancer Center
-
Contact:
- David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
-
Contact:
- Zsofia Stadler, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-4039
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Chercheur principal:
- David Solit, MD
-
New York, New York, États-Unis, 10029
- Recrutement
- Metropolitan Hospital Center
-
Contact:
- Anitha Srinivasan, MD
- Numéro de téléphone: 212-423-6262
-
New York, New York, États-Unis, 10035
- Recrutement
- Ralph Lauren Center for Cancer Care and Prevention
-
Contact:
- Lewis P. Kampel, MD
- Numéro de téléphone: 646-422-4474
-
Richmond Hill, New York, États-Unis, 11418
- Recrutement
- Medisys Health Network (Data Collection Only)
-
Contact:
- Rosa Nouvini, MD
- Numéro de téléphone: 718-206-6000
-
The Bronx, New York, États-Unis, 10451
- Recrutement
- NYC Health & Hospitals /Lincoln Medical Center
-
Contact:
- Monica Reddy Muppidi, MD
- Numéro de téléphone: 718-579-4977
-
Chercheur principal:
- Monica Reddy Muppidi, MD
-
Uniondale, New York, États-Unis, 11553
- Recrutement
- Memorial Sloan Kettering Nassau
-
Contact:
- David Solit, MD
- Numéro de téléphone: 646-888-2641
-
-
Pennsylvania
-
Allentown, Pennsylvania, États-Unis, 18103
- Recrutement
- Lehigh Valley Health Network
-
Contact:
- Suresh Nair, MD
- Numéro de téléphone: 610-402-7880
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Les patients atteints de cancers solides ou hématologiques susceptibles d'être et considérés comme des candidats potentiels à un protocole thérapeutique seront recrutés pour la partie A de cette étude. L'inscription aux essais cliniques thérapeutiques ne dépendra pas de l'inscription à ce protocole.
Partie B : Cohorte de recherche Les patients potentiellement appropriés seront identifiés par leur médecin traitant dans chaque équipe de gestion des maladies participante.
La description
Critère d'intégration:
Partie A :
- Patients ayant des antécédents de cancer ou patients sans antécédent documenté de cancer subissant une intervention chirurgicale, une biopsie ou une biopsie liquide (par exemple, un test ADN acellulaire) pour confirmer ou exclure un diagnostic de cancer.
Partie B :
- Les patients doivent être inscrits avec succès à la partie A du MSKCC IRB # 12-245 Approbation écrite préalable pour le consentement du patient obtenue auprès du chercheur principal / co-principal du MSKCC IRB # 12-245.
Partie C :
- Le patient doit recevoir des soins continus à MSK ou sur un site CHERPn/Alliance/Affilié ou avoir déjà consulté un médecin MSK.
- Le patient doit avoir consenti avec succès à la partie A de cette étude.
Partie D :
- Patients sans antécédent personnel de cancer présentant un risque accru de développer un cancer en raison d'antécédents familiaux, d'un marqueur moléculaire du cancer, d'un statut de porteur connu d'un gène associé à un risque accru de cancer ou d'expositions environnementales antérieures/en cours ou de facteurs liés au mode de vie.
Critère d'exclusion:
Toutes les parties:
- Refus ou incapacité de fournir un consentement éclairé.
Partie C et D :
- Patients ayant subi une greffe allogénique de moelle osseuse/cellules souches.
- Les patients atteints d'un néoplasme myéloïde aigu ou chronique, d'un néoplasme histiocytaire ou d'une autre maladie myéloproliférative (par ex. MDS, MPN, MDS/MPN) qui empêcherait l'utilisation de sang ou de salive comme source d'ADN germinal. Par exemple, les patients atteints d'une hémopathie maligne avec une charge de morbidité circulante élevée (définie comme > 10 % des globules blancs issus de la cytométrie en flux ou de la formule sanguine différentielle).
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
|
Pts avec tumeurs solides
Les patients doivent avoir un cancer solide ou hématologique.
pour un traitement sur un .
Les patients doivent avoir subi une confirmation pathologique de leur tumeur au MSKCC et avoir soit : 1) des tissus d'archives disponibles pour analyse, 2) avoir une collecte de tissus frais planifiée comme biopsie standard de soins de routine ou dans le cadre d'une biopsie de recherche dans le cadre d'un autre essai clinique (ou sang périphérique / prélèvement de moelle osseuse dans le cas de cancers hématologiques) en dehors du cadre de ce protocole, ou 3) tissu d'archives .disponible dans un établissement extérieur.
Pour les échantillons de tissus de génotypage prospectifs du site primaire, une métastase ou une récidive sera utilisée en fonction de la disponibilité et de la qualité des tissus.
|
La partie A est le profilage moléculaire des tumeurs.
Aucune nouvelle biopsie tumorale ne sera effectuée dans le cadre de la partie A. Si un pt subit une intervention chirurgicale ou une biopsie tumorale, les tissus restants (ou un noyau supplémentaire) de cette procédure peuvent être utilisés pour le profilage moléculaire.
Test(s) clinique(s) : Ce test sera effectué dans le laboratoire du service de diagnostic moléculaire certifié CLIA.
Essai(s) de recherche : ce protocole sera également utilisé comme plate-forme pour piloter l'utilisation de technologies de profilage expérimentales de « prochaine génération ».
séquençage de l'exome entier, séquençage du génome entier séquençage de l'ARN séquençage de l'ADN/ARN tumoral sans cellule, protéomique, et autres.
Pour confirmer les résultats obtenus sur ces tests à l'aide d'un test orthogonal, un séquençage supplémentaire tel que les tests Sanger, Sequenom, MiSeq ou IMPACT peut être utilisé dans le cadre CLIA ou non CLIA. Partie B : DTC Cohort Pts enregistrés avec succès dans la partie B de ce l'étude sera éligible pour la collecte à risque minimal et les biopsies de recherche.
Partie C : Analyse clinique de la lignée germinale Les participants qui ont fait don d'un échantillon de sang périphérique normal correspondant à des fins de comparaison avec la séquence somatique se verront offrir la possibilité de faire analyser cet échantillon d'ADN de la lignée germinale pour détecter la présence de mutations délétères ou probablement délétères dans les gènes du panel MSK-IMPACT. qui sont connus pour être liés à une susceptibilité héréditaire ou qui sont inclus sur des listes consensuelles de gènes qui devraient subir une analyse secondaire (par exemple la "liste ACMG"). Partie D : Profilage de la lignée germinale pour les personnes à risque élevé de cancer |
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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fréquence des mutations oncogènes "actionnables"
Délai: 1 année
|
Les mutations « exploitables » seront définies comme 1) une mutation dont il a été démontré qu'elle prédit la sensibilité ou la résistance à un médicament approuvé par la FDA pour une utilisation dans une autre indication de cancer ou 2) une mutation qui prédit la sensibilité ou la résistance dans des modèles précliniques à une classe expérimentale de drogues.
|
1 année
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Déterminer l'impact des résultats du profilage moléculaire effectué dans le cadre du CLIA sur le traitement des patients.
Délai: 1 année
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Le noyau bioinformatique aidera à interpréter les données générées par les techniques de séquençage de nouvelle génération telles que WES et WGS.
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1 année
|
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interroger les mécanismes
Délai: 1 année
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réponse sous-jacente et résistance (de novo et acquise) à la thérapie ciblée.
Le ou les tests de recherche utilisés pour y parvenir varieront en fonction du contexte clinique et des tissus disponibles et peuvent inclure Sanger, Sequenom, MiSeq, la capture d'exon (c'est-à-dire : IMPACT), l'exome entier et le séquençage du génome entier.
|
1 année
|
|
Explorer les mécanismes génétiques de la tumorigenèse
Délai: 2
|
dans un sous-ensemble d'échantillons sans altérations génomiques coupables identifiables sur le séquençage de nouvelle génération hautement multiplexé (c.
|
2
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: David Solit, MD, Memorial Sloan Kettering Cancer Center
Publications et liens utiles
Publications générales
- Seldon CS, Meiyappan K, Hoffman H, Guo JA, Goel N, Hwang WL, Nguyen PL, Mahal BA, Alshalalfa M. Genomic alterations predictive of poor clinical outcomes in pan-cancer. Oncotarget. 2022 Sep 28;13:1069-1077. doi: 10.18632/oncotarget.28276. eCollection 2022.
- Rosenzweig J, Pillai PM, Prockop S, Benayed R, Eidenschink Brodersen L, Najfeld V, Loken MR, Zhang Y, Shukla N. Acute myeloid leukemia with an MN1-ETV6 fusion in a young child with Down syndrome. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2022 Apr 28;8(3):a006167. doi: 10.1101/mcs.a006167. Print 2022 Apr.
- Lin AL, Tabar V, Young RJ, Cohen M, Cuaron J, Yang TJ, Rosenblum M, Rudneva VA, Geer EB, Bodei L. Synergism of Checkpoint Inhibitors and Peptide Receptor Radionuclide Therapy in the Treatment of Pituitary Carcinoma. J Endocr Soc. 2021 Aug 7;5(10):bvab133. doi: 10.1210/jendso/bvab133. eCollection 2021 Oct 1.
- Fiala EM, Jayakumaran G, Mauguen A, Kennedy JA, Bouvier N, Kemel Y, Fleischut MH, Maio A, Salo-Mullen EE, Sheehan M, Arnold AG, Latham A, Carlo MI, Cadoo K, Murkherjee S, Slotkin EK, Trippett T, Glade Bender J, Meyers PA, Wexler L, Dela Cruz FS, Cheung NK, Basu E, Kentsis A, Ortiz M, Francis JH, Dunkel IJ, Khakoo Y, Gilheeney S, Farouk Sait S, Forlenza CJ, Sulis M, Karajannis M, Modak S, Gerstle JT, Heaton TE, Roberts S, Yang C, Jairam S, Vijai J, Topka S, Friedman DN, Stadler ZK, Robson M, Berger MF, Schultz N, Ladanyi M, O'Reilly RJ, Abramson DH, Ceyhan-Birsoy O, Zhang L, Mandelker D, Shukla NN, Kung AL, Offit K, Zehir A, Walsh MF. Prospective pan-cancer germline testing using MSK-IMPACT informs clinical translation in 751 patients with pediatric solid tumors. Nat Cancer. 2021 Mar;2:357-365. doi: 10.1038/s43018-021-00172-1. Epub 2021 Feb 15.
- Stadler ZK, Maio A, Chakravarty D, Kemel Y, Sheehan M, Salo-Mullen E, Tkachuk K, Fong CJ, Nguyen B, Erakky A, Cadoo K, Liu Y, Carlo MI, Latham A, Zhang H, Kundra R, Smith S, Galle J, Aghajanian C, Abu-Rustum N, Varghese A, O'Reilly EM, Morris M, Abida W, Walsh M, Drilon A, Jayakumaran G, Zehir A, Ladanyi M, Ceyhan-Birsoy O, Solit DB, Schultz N, Berger MF, Mandelker D, Diaz LA Jr, Offit K, Robson ME. Therapeutic Implications of Germline Testing in Patients With Advanced Cancers. J Clin Oncol. 2021 Aug 20;39(24):2698-2709. doi: 10.1200/JCO.20.03661. Epub 2021 Jun 16.
- Diolaiti D, Dela Cruz FS, Gundem G, Bouvier N, Boulad M, Zhang Y, Chou AJ, Dunkel IJ, Sanghvi R, Shah M, Geiger H, Rahman S, Felice V, Wrzeszczynski KO, Darnell RB, Antonescu CR, French CA, Papaemmanuil E, Kung AL, Shukla N. A recurrent novel MGA-NUTM1 fusion identifies a new subtype of high-grade spindle cell sarcoma. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6):a003194. doi: 10.1101/mcs.a003194. Print 2018 Dec.
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- Schram AM, Reales D, Galle J, Cambria R, Durany R, Feldman D, Sherman E, Rosenberg J, D'Andrea G, Baxi S, Janjigian Y, Tap W, Dickler M, Baselga J, Taylor BS, Chakravarty D, Gao J, Schultz N, Solit DB, Berger MF, Hyman DM. Oncologist use and perception of large panel next-generation tumor sequencing. Ann Oncol. 2017 Sep 1;28(9):2298-2304. doi: 10.1093/annonc/mdx294.
- Mandelker D, Zhang L, Kemel Y, Stadler ZK, Joseph V, Zehir A, Pradhan N, Arnold A, Walsh MF, Li Y, Balakrishnan AR, Syed A, Prasad M, Nafa K, Carlo MI, Cadoo KA, Sheehan M, Fleischut MH, Salo-Mullen E, Trottier M, Lipkin SM, Lincoln A, Mukherjee S, Ravichandran V, Cambria R, Galle J, Abida W, Arcila ME, Benayed R, Shah R, Yu K, Bajorin DF, Coleman JA, Leach SD, Lowery MA, Garcia-Aguilar J, Kantoff PW, Sawyers CL, Dickler MN, Saltz L, Motzer RJ, O'Reilly EM, Scher HI, Baselga J, Klimstra DS, Solit DB, Hyman DM, Berger MF, Ladanyi M, Robson ME, Offit K. Mutation Detection in Patients With Advanced Cancer by Universal Sequencing of Cancer-Related Genes in Tumor and Normal DNA vs Guideline-Based Germline Testing. JAMA. 2017 Sep 5;318(9):825-835. doi: 10.1001/jama.2017.11137.
- Borio M, Sheehan M, Katabi N, Sacca RE, Maio A, Kemel Y, Khurram A, Mandelker D, Birsoy O, Solit D, Carlo MI, Liu Y, Abbass M, Banaszak L, Kesserwan C, Murciano-Goroff YR, Latham A, Offit K, Wong RJ, Ghossein R, Boucai L, Tuttle M, Stadler ZK. Prevalence of Germline Pathogenic RET Variants in a Pan-Cancer Patient Population. JCO Precis Oncol. 2026 May;10(5):e2500737. doi: 10.1200/PO-25-00737. Epub 2026 May 22.
- Gelfer R, Gulla A, Kalvin HL, Song Y, Harding J, Abou-Alfa GK, O'Reilly EM, Park W, Chandwani R, Wei A, Kingham P, Drebin J, Balachandran V, D'Angelica M, Soares K, Gonen M, Jarnagin WR. KRAS Variants Are Associated With Survival Outcomes and Genomic Alterations in Biliary Tract Cancers. JCO Precis Oncol. 2024 Dec;8:e2400263. doi: 10.1200/PO.24.00263. Epub 2024 Dec 6.
- Mondaca S, Walch H, Sepulveda S, Schultz N, Munoz G, Yaqubie A, Macanas P, Pareja C, Garcia P, Chatila W, Nervi B, Li B, Harding JJ, Viviani P, Roa JC, Abou-Alfa GK. Clinical and Genomic Characterization of ERBB2-Altered Gallbladder Cancer: Exploring Differences Between an American and a Chilean Cohort. JCO Glob Oncol. 2024 Oct;10:e2400090. doi: 10.1200/GO.24.00090. Epub 2024 Oct 10.
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