- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT01775072
Genomisk profilering hos kræftpatienter
Formålet med denne undersøgelse er at afgøre, om visse gener i kræft kan være unormale. Når et gen er unormalt, kaldes dette en mutation. De fleste mutationer i kræftceller er ikke arvet (overført fra forældre), men sker efter fødslen i selve kræften. De fleste kræftformer har mange mutationer. Nogle af disse mutationer er vigtige for, at kræftcellerne kan overleve, mens andre ikke er det. Målet med denne undersøgelse er at teste kræft for visse mutationer ved hjælp af resterende tumorvæv fra en tidligere operation eller biopsi. Deltagerne vil også blive bedt om at give et rør med blodkind (også kendt som en mundkurv) eller en spytprøve, der indeholder normale gener til sammenligning.
Formålet med del B af denne undersøgelse er at:
Forstå, hvordan genetiske ændringer i tumor påvirker chancen for at reagere på eksperimentel cancerbehandling. Forstå, hvordan generne i tumoren ændrer sig overarbejde som reaktion på målrettet kræftbehandling.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Zsofia Stadler, MD
- Telefonnummer: 646-888-4039
Studiesteder
-
-
Connecticut
-
Bridgeport, Connecticut, Forenede Stater, 06606
- Ikke rekrutterer endnu
- St. Vincent (Data Collection Only)
-
Kontakt:
- Christopher Iannuzzi, MD
- Telefonnummer: 203-576-6000
-
Hartford, Connecticut, Forenede Stater, 06102
- Ikke rekrutterer endnu
- Hartford Healthcare Cancer Institute @ Hartford Hospital
-
Kontakt:
- Andrew Salner, MD
- Telefonnummer: 860-972-2803
-
Norwalk, Connecticut, Forenede Stater, 06850
- Rekruttering
- Norwalk Hospital
-
Kontakt:
- Linda Vahdat, MD
- Telefonnummer: 203-845-4811
-
-
Florida
-
Miami, Florida, Forenede Stater, 33143
- Rekruttering
- Baptist Alliance MCI
-
Kontakt:
- John Diaz, MD
- Telefonnummer: 786-596-2000
-
-
New Jersey
-
Basking Ridge, New Jersey, Forenede Stater, 07920
- Rekruttering
- Memorial Sloan Kettering Basking Ridge
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Middletown, New Jersey, Forenede Stater, 07748
- Rekruttering
- Memorial Sloan Kettering Monmouth
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Montvale, New Jersey, Forenede Stater, 07645
- Rekruttering
- Memorial Sloan Kettering Bergen
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
-
New York
-
Bronx, New York, Forenede Stater, 10451
- Rekruttering
- NYC Health & Hospitals /Lincoln Medical Center
-
Kontakt:
- Monica Reddy Muppidi, MD
- Telefonnummer: 718-579-4977
-
Ledende efterforsker:
- Monica Reddy Muppidi, MD
-
Bronx, New York, Forenede Stater, 10469
- Rekruttering
- New York Cancer & Blood Specialists (Data collection only)
-
Kontakt:
- Richard Zuniga, MD
- Telefonnummer: 631-751-3000
-
Brooklyn, New York, Forenede Stater, 11203
- Rekruttering
- Kings County Hopsital Center
-
Kontakt:
- Jason Gonsky, MD
- Telefonnummer: 718-245-2847
-
Commack, New York, Forenede Stater, 11725
- Rekruttering
- Memorial Sloan Kettering Cancer Commack
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Harrison, New York, Forenede Stater, 10604
- Rekruttering
- Memorial Sloan Kettering Westchester
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Jamaica, New York, Forenede Stater, 11432
- Rekruttering
- Queens Cancer Center of Queens Hospital
-
Kontakt:
- Margaret Kemeny, MD
- Telefonnummer: 718-883-4031
-
New York, New York, Forenede Stater, 10065
- Rekruttering
- Memorial Sloan Kettering Cancer Center
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Kontakt:
- Zsofia Stadler, MD
- Telefonnummer: 646-888-4039
-
Ledende efterforsker:
- David Solit, MD
-
New York, New York, Forenede Stater, 10029
- Rekruttering
- Metropolitan Hospital Center
-
Kontakt:
- Anitha Srinivasan, MD
- Telefonnummer: 212-423-6262
-
New York, New York, Forenede Stater, 10035
- Rekruttering
- Ralph Lauren Center for Cancer Care and Prevention
-
Kontakt:
- Lewis P. Kampel, MD
- Telefonnummer: 646-422-4474
-
Uniondale, New York, Forenede Stater, 11553
- Rekruttering
- Memorial Sloan Kettering Nassau
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
-
Pennsylvania
-
Allentown, Pennsylvania, Forenede Stater, 18103
- Rekruttering
- Lehigh Valley Health Network
-
Kontakt:
- Suresh Nair, MD
- Telefonnummer: 610-402-7880
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Patienter med solid eller hæmatologisk cancer, som kan være og betragtes som potentielle kandidater til en terapeutisk protokol, vil blive rekrutteret til del A af denne undersøgelse. Tilmelding til terapeutiske kliniske forsøg vil ikke være betinget af tilmelding til denne protokol.
Del B: Forskningsindsamlings kohorte Patienter, der potentielt er relevante, vil blive identificeret af deres behandlende læge i hvert deltagende sygdomshåndteringsteam.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Del A:
- Patienter med en kræfthistorie eller patienter uden dokumenteret kræfthistorie, der gennemgår et kirurgisk indgreb, biopsi eller væskebiopsi (f.eks. cellefri DNA-test) for at bekræfte eller udelukke en kræftdiagnose.
Del B:
- Patienter skal med succes registreres til del A af MSKCC IRB# 12-245. Forudgående skriftlig godkendelse af patientens samtykke indhentet fra Principal/Co-Principal Investigator af MSKCC IRB # 12-245.
Del C:
- Patienten skal være i løbende behandling hos MSK eller et CHERPn/Alliance/Affiliate-sted eller tidligere have konsulteret en MSK-læge.
- Patienten skal have givet sit samtykke til del A af denne undersøgelse.
Del D:
- Patienter uden personlig kræfthistorie med øget risiko for kræftudvikling på grund af familiehistorie, molekylær cancermarkør, kender bærerstatus for et gen forbundet med øget kræftrisiko eller tidligere/igangværende miljøeksponeringer eller livsstilsfaktorer.
Ekskluderingskriterier:
Alle dele:
- Uvillig eller ude af stand til at give informeret samtykke.
Del C og D:
- Patienter, der har fået en allogen knoglemarvs-/stamcelletransplantation.
- Patienter med en akut eller kronisk myeloid neoplasma, histiocytisk neoplasma eller anden myeloproliferativ sygdom (f. MDS, MPN, MDS/MPN), der ville udelukke brugen af blod eller spyt som en kilde til kimlinje-DNA. For eksempel patienter med en hæmatologisk malignitet med en høj cirkulerende sygdomsbyrde (defineret som >10 % af WBC'er fra flowcytometri eller CBC-differential).
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
---|---|
Pts med solide tumorer
Patienter skal have solid eller hæmatologisk cancer.
til behandling på en .
Patienter skal have gennemgået patologisk bekræftelse af deres tumor på MSKCC og have enten: 1) arkivvæv tilgængeligt til analyse, 2) have frisk vævsindsamling planlagt som rutinemæssig standardbehandlingsbiopsi eller en del af en forskningsbiopsi under et andet klinisk forsøg (eller perifert blod) / knoglemarvsindsamling i tilfælde af hæmatologiske kræftformer) uden for denne protokols sammenhæng, eller 3) arkivvæv tilgængeligt på en ekstern facilitet.
For prospektive genotypebestemmelsesvævsprøver fra det primære sted, vil en metastase eller recidiv blive brugt baseret på tilgængeligheden og kvaliteten af væv.
|
Del A er den molekylære profilering af tumorer.
Der vil ikke blive udført nye tumorbiopsier i forbindelse med del A. Hvis en pt har en operation eller tumorbiopsi, kan resterende væv (eller en ekstra kerne) fra denne procedure bruges til molekylær profilering.
Klinisk(e) analyse(r): Denne test vil blive udført i det CLIA-certificerede Molecular Diagnostics Service-laboratorium.
Forskningsassay(er): Denne protokol vil også blive brugt som en platform til at pilotere brugen af "næste-generations" profileringsteknologier i undersøgelser, herunder
hel exom sekventering, hel genom sekventering RNA sekventering cellefri tumor DNA/RNA sekvensering, proteomics, og andre.
For at bekræfte resultaterne opnået på disse assays ved hjælp af et ortogonalt assay, kan yderligere sekventering såsom Sanger, Sequenom, MiSeq eller IMPACT-test anvendes i enten CLIA eller ikke-CLIA indstillingen. undersøgelse vil være berettiget til minimal risikoindsamling og forskningsbiopsier.
Del C: Klinisk kimlinjeanalyse Deltagere, der har doneret en matchet normal perifer blodprøve til sammenligning med somatisk sekvens, vil blive tilbudt muligheden for at få den kimlinje-DNA-prøve analyseret for tilstedeværelsen af skadelige eller sandsynlige skadelige mutationer i gener på MSK-IMPACT-panelet som vides at være forbundet med arvelig modtagelighed, eller som er inkluderet på konsensuslister over gener, der bør gennemgå sekundær analyse (f.eks. "ACMG-listen"). Del D: Kimlinjeprofilering for personer med forhøjet kræftrisiko |
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
hyppigheden af "handlingsbare" onkogene mutationer
Tidsramme: 1 år
|
"Handlingsbare" mutationer vil blive defineret som enten 1) en mutation, der er vist at forudsige for følsomhed eller resistens over for et lægemiddel, FDA godkendt til brug i en anden cancerindikation eller 2) en mutation, der forudsiger for følsomhed eller resistens i prækliniske modeller til en undersøgelsesklasse af stoffer.
|
1 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
At bestemme virkningen af molekylære profileringsresultater udført i CLIA-indstillingen på behandlingen af patienter.
Tidsramme: 1 år
|
Bioinformatikkernen vil hjælpe med at fortolke data genereret af næste generations sekventeringsteknikker såsom WES og WGS.
|
1 år
|
afhøre mekanismerne
Tidsramme: 1 år
|
underliggende respons og modstand (de-novo og erhvervet) til målrettet terapi.
Den eller de forskningsassays, der bruges til at opnå dette, vil variere baseret på den kliniske indstilling og det tilgængelige væv og kan omfatte Sanger, Sequenom, MiSeq, exon-capture (dvs.: IMPACT), hel exom og hel genom-sekventering.
|
1 år
|
At udforske de genetiske mekanismer bag tumorgenese
Tidsramme: 2
|
i en undergruppe af prøver uden identificerbare skyldige genomiske ændringer på højmultiplekset næste generations sekventering (dvs.: IMPACT-testning) ved at bruge endnu mere omfattende undersøgelsesprofileringsteknikker såsom hel exome-sekventering, helgenom-sekventering eller RNA-sekventering
|
2
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: David Solit, MD, Memorial Sloan Kettering Cancer Center
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Seldon CS, Meiyappan K, Hoffman H, Guo JA, Goel N, Hwang WL, Nguyen PL, Mahal BA, Alshalalfa M. Genomic alterations predictive of poor clinical outcomes in pan-cancer. Oncotarget. 2022 Sep 28;13:1069-1077. doi: 10.18632/oncotarget.28276. eCollection 2022.
- Rosenzweig J, Pillai PM, Prockop S, Benayed R, Eidenschink Brodersen L, Najfeld V, Loken MR, Zhang Y, Shukla N. Acute myeloid leukemia with an MN1-ETV6 fusion in a young child with Down syndrome. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2022 Apr 28;8(3):a006167. doi: 10.1101/mcs.a006167. Print 2022 Apr.
- Lin AL, Tabar V, Young RJ, Cohen M, Cuaron J, Yang TJ, Rosenblum M, Rudneva VA, Geer EB, Bodei L. Synergism of Checkpoint Inhibitors and Peptide Receptor Radionuclide Therapy in the Treatment of Pituitary Carcinoma. J Endocr Soc. 2021 Aug 7;5(10):bvab133. doi: 10.1210/jendso/bvab133. eCollection 2021 Oct 1.
- Fiala EM, Jayakumaran G, Mauguen A, Kennedy JA, Bouvier N, Kemel Y, Fleischut MH, Maio A, Salo-Mullen EE, Sheehan M, Arnold AG, Latham A, Carlo MI, Cadoo K, Murkherjee S, Slotkin EK, Trippett T, Glade Bender J, Meyers PA, Wexler L, Dela Cruz FS, Cheung NK, Basu E, Kentsis A, Ortiz M, Francis JH, Dunkel IJ, Khakoo Y, Gilheeney S, Farouk Sait S, Forlenza CJ, Sulis M, Karajannis M, Modak S, Gerstle JT, Heaton TE, Roberts S, Yang C, Jairam S, Vijai J, Topka S, Friedman DN, Stadler ZK, Robson M, Berger MF, Schultz N, Ladanyi M, O'Reilly RJ, Abramson DH, Ceyhan-Birsoy O, Zhang L, Mandelker D, Shukla NN, Kung AL, Offit K, Zehir A, Walsh MF. Prospective pan-cancer germline testing using MSK-IMPACT informs clinical translation in 751 patients with pediatric solid tumors. Nat Cancer. 2021 Mar;2:357-365. doi: 10.1038/s43018-021-00172-1. Epub 2021 Feb 15.
- Stadler ZK, Maio A, Chakravarty D, Kemel Y, Sheehan M, Salo-Mullen E, Tkachuk K, Fong CJ, Nguyen B, Erakky A, Cadoo K, Liu Y, Carlo MI, Latham A, Zhang H, Kundra R, Smith S, Galle J, Aghajanian C, Abu-Rustum N, Varghese A, O'Reilly EM, Morris M, Abida W, Walsh M, Drilon A, Jayakumaran G, Zehir A, Ladanyi M, Ceyhan-Birsoy O, Solit DB, Schultz N, Berger MF, Mandelker D, Diaz LA Jr, Offit K, Robson ME. Therapeutic Implications of Germline Testing in Patients With Advanced Cancers. J Clin Oncol. 2021 Aug 20;39(24):2698-2709. doi: 10.1200/JCO.20.03661. Epub 2021 Jun 16.
- Diolaiti D, Dela Cruz FS, Gundem G, Bouvier N, Boulad M, Zhang Y, Chou AJ, Dunkel IJ, Sanghvi R, Shah M, Geiger H, Rahman S, Felice V, Wrzeszczynski KO, Darnell RB, Antonescu CR, French CA, Papaemmanuil E, Kung AL, Shukla N. A recurrent novel MGA-NUTM1 fusion identifies a new subtype of high-grade spindle cell sarcoma. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6):a003194. doi: 10.1101/mcs.a003194. Print 2018 Dec.
- Forlenza CJ, Zhang Y, Yao J, Benayed R, Steinherz P, Ramaswamy K, Kessel R, Roshal M, Shukla N. A case of KMT2A-SEPT9 fusion-associated acute megakaryoblastic leukemia. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6):a003426. doi: 10.1101/mcs.a003426. Print 2018 Dec.
- Boucai L, Falcone J, Ukena J, Coombs CC, Zehir A, Ptashkin R, Berger MF, Levine RL, Fagin JA. Radioactive Iodine-Related Clonal Hematopoiesis in Thyroid Cancer Is Common and Associated With Decreased Survival. J Clin Endocrinol Metab. 2018 Nov 1;103(11):4216-4223. doi: 10.1210/jc.2018-00803.
- Schram AM, Reales D, Galle J, Cambria R, Durany R, Feldman D, Sherman E, Rosenberg J, D'Andrea G, Baxi S, Janjigian Y, Tap W, Dickler M, Baselga J, Taylor BS, Chakravarty D, Gao J, Schultz N, Solit DB, Berger MF, Hyman DM. Oncologist use and perception of large panel next-generation tumor sequencing. Ann Oncol. 2017 Sep 1;28(9):2298-2304. doi: 10.1093/annonc/mdx294.
- Mandelker D, Zhang L, Kemel Y, Stadler ZK, Joseph V, Zehir A, Pradhan N, Arnold A, Walsh MF, Li Y, Balakrishnan AR, Syed A, Prasad M, Nafa K, Carlo MI, Cadoo KA, Sheehan M, Fleischut MH, Salo-Mullen E, Trottier M, Lipkin SM, Lincoln A, Mukherjee S, Ravichandran V, Cambria R, Galle J, Abida W, Arcila ME, Benayed R, Shah R, Yu K, Bajorin DF, Coleman JA, Leach SD, Lowery MA, Garcia-Aguilar J, Kantoff PW, Sawyers CL, Dickler MN, Saltz L, Motzer RJ, O'Reilly EM, Scher HI, Baselga J, Klimstra DS, Solit DB, Hyman DM, Berger MF, Ladanyi M, Robson ME, Offit K. Mutation Detection in Patients With Advanced Cancer by Universal Sequencing of Cancer-Related Genes in Tumor and Normal DNA vs Guideline-Based Germline Testing. JAMA. 2017 Sep 5;318(9):825-835. doi: 10.1001/jama.2017.11137. Erratum In: JAMA. 2018 Dec 11;320(22):2381.
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 12-245
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Faste tumorer
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterRekrutteringSolid tumor | Solid tumor, voksen | Solid tumor, uspecificeret, voksenForenede Stater
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterLincoln Medical and Mental Health CenterRekrutteringSolid tumor | Solid tumor, voksen | Solid tumor, uspecificeret, voksenForenede Stater, Puerto Rico
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterLincoln Medical and Mental Health CenterRekrutteringSolid tumor | Solid tumor, voksen | Solid tumor, uspecificeret, voksenForenede Stater, Puerto Rico
-
Sorrento Therapeutics, Inc.Trukket tilbageSolid tumor | Recidiverende solid tumor | Refraktær tumor
-
Impact Therapeutics, Inc.RekrutteringSolid tumor | Avanceret solid tumorKina, Taiwan, Forenede Stater, Australien
-
Partner Therapeutics, Inc.Trukket tilbageSolid tumor | Solid tumor, voksenForenede Stater
-
BeiGeneRekrutteringSolid tumor | Avanceret solid tumorForenede Stater, New Zealand, Australien, Kina
-
Anjali PawarRekrutteringSolid tumor | Solid tumor, barndomForenede Stater
-
Pyxis Oncology, IncRekrutteringSolid tumor | Avanceret solid tumorForenede Stater, Spanien, Belgien
-
Neurogene Inc.Merck Sharp & Dohme LLCAktiv, ikke rekrutterendeSolid tumor | Avanceret solid tumorForenede Stater, Australien, Canada
Kliniske forsøg med molekylær profilering af tumorer
-
University of Wisconsin, MadisonNational Cancer Institute (NCI)Rekruttering
-
Dartmouth-Hitchcock Medical CenterRekruttering
-
Tianjin Medical University Second HospitalUkendt
-
National Institute for Medical Research, TanzaniaUniversity of Kinshasa (UNIKIN), Congo, The Democratic Republic of the... og andre samarbejdspartnereIkke rekrutterer endnu
-
International Center for Neurological Restoration...Centro de Immunologia Molecular, CubaAfsluttet
-
Sohag UniversityIkke rekrutterer endnu
-
First Affiliated Hospital Bengbu Medical CollegeRekrutteringAdenocarcinom i maven | Adenocarcinom - GEJKina
-
Rutgers, The State University of New JerseyNational Cancer Institute (NCI)Aktiv, ikke rekrutterendeKlinisk trin III HPV-medieret (p16-positiv) orofaryngealt karcinom AJCC v8 | Klinisk fase I HPV-medieret (p16-positiv) orofarynxcarcinom AJCC v8 | Klinisk fase II HPV-medieret (p16-positiv) orofaryngealt karcinom AJCC v8 | Orofaryngealt humant papillomavirus-positivt planocellulært karcinomForenede Stater
-
The Medicines CompanyAfsluttetHjertefejl | Forhøjet blodtrykForenede Stater, Tyskland, Frankrig
-
Robert LowskyNational Cancer Institute (NCI)AfsluttetAkut myeloid leukæmi | Hodgkin lymfom | Kronisk lymfatisk leukæmi | Myelodysplastisk syndrom | B-celle non-Hodgkin lymfom | Myeloproliferativ neoplasma | T-celle non-Hodgkin lymfomForenede Stater