- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT01775072
Genomisk profilering hos cancerpatienter
Syftet med denna studie är att avgöra om vissa gener i cancer kan vara onormala. När en gen är onormal kallas detta en mutation. De flesta mutationer i cancerceller ärvs inte (överförs från föräldrar) utan sker efter födseln i själva cancern. De flesta cancerformer har många mutationer. Vissa av dessa mutationer är viktiga för att cancercellerna ska överleva medan andra inte är det. Målet med denna studie är att testa cancer för vissa mutationer med hjälp av överbliven tumörvävnad från en tidigare operation eller biopsi. Deltagarna kommer också att uppmanas att tillhandahålla en tub med blodkind (även känd som en buckal) pinne, eller ett salivprov som innehåller normala gener för jämförelse.
Syftet med del B av denna studie är att:
Förstå hur genetiska förändringar i tumören påverkar chansen att svara på experimentell cancerbehandling. Förstå hur generna i tumören förändras övertid som svar på riktad cancerbehandling.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Studietyp
Inskrivning (Beräknad)
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
Studera Kontakt Backup
- Namn: Zsofia Stadler, MD
- Telefonnummer: 646-888-4039
Studieorter
-
-
Connecticut
-
Bridgeport, Connecticut, Förenta staterna, 06606
- Har inte rekryterat ännu
- St. Vincent (Data Collection Only)
-
Kontakt:
- Christopher Iannuzzi, MD
- Telefonnummer: 203-576-6000
-
Hartford, Connecticut, Förenta staterna, 06102
- Har inte rekryterat ännu
- Hartford Healthcare Cancer Institute @ Hartford Hospital
-
Kontakt:
- Andrew Salner, MD
- Telefonnummer: 860-972-2803
-
Norwalk, Connecticut, Förenta staterna, 06850
- Rekrytering
- Norwalk Hospital
-
Kontakt:
- Linda Vahdat, MD
- Telefonnummer: 203-845-4811
-
-
Florida
-
Miami, Florida, Förenta staterna, 33143
- Rekrytering
- Baptist Alliance MCI
-
Kontakt:
- John Diaz, MD
- Telefonnummer: 786-596-2000
-
-
New Jersey
-
Basking Ridge, New Jersey, Förenta staterna, 07920
- Rekrytering
- Memorial Sloan Kettering Basking Ridge
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Middletown, New Jersey, Förenta staterna, 07748
- Rekrytering
- Memorial Sloan Kettering Monmouth
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Montvale, New Jersey, Förenta staterna, 07645
- Rekrytering
- Memorial Sloan Kettering Bergen
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
-
New York
-
Brooklyn, New York, Förenta staterna, 11203
- Rekrytering
- Kings County Hopsital Center
-
Kontakt:
- Jason Gonsky, MD
- Telefonnummer: 718-245-2847
-
Commack, New York, Förenta staterna, 11725
- Rekrytering
- Memorial Sloan Kettering Cancer Commack
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Harrison, New York, Förenta staterna, 10604
- Rekrytering
- Memorial Sloan Kettering Westchester
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Jamaica, New York, Förenta staterna, 11432
- Rekrytering
- Queens Cancer Center of Queens Hospital
-
Kontakt:
- Debra Ferman, MD
- Telefonnummer: 718-579-6021
-
New York, New York, Förenta staterna, 10065
- Rekrytering
- Memorial Sloan Kettering Cancer Center
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
Kontakt:
- Zsofia Stadler, MD
- Telefonnummer: 646-888-4039
-
Huvudutredare:
- David Solit, MD
-
New York, New York, Förenta staterna, 10029
- Rekrytering
- Metropolitan Hospital Center
-
Kontakt:
- Anitha Srinivasan, MD
- Telefonnummer: 212-423-6262
-
New York, New York, Förenta staterna, 10035
- Rekrytering
- Ralph Lauren Center for Cancer Care and Prevention
-
Kontakt:
- Lewis P. Kampel, MD
- Telefonnummer: 646-422-4474
-
Richmond Hill, New York, Förenta staterna, 11418
- Rekrytering
- Medisys Health Network (Data Collection Only)
-
Kontakt:
- Rosa Nouvini, MD
- Telefonnummer: 718-206-6000
-
The Bronx, New York, Förenta staterna, 10451
- Rekrytering
- NYC Health & Hospitals /Lincoln Medical Center
-
Kontakt:
- Monica Reddy Muppidi, MD
- Telefonnummer: 718-579-4977
-
Huvudutredare:
- Monica Reddy Muppidi, MD
-
Uniondale, New York, Förenta staterna, 11553
- Rekrytering
- Memorial Sloan Kettering Nassau
-
Kontakt:
- David Solit, MD
- Telefonnummer: 646-888-2641
-
-
Pennsylvania
-
Allentown, Pennsylvania, Förenta staterna, 18103
- Rekrytering
- Lehigh Valley Health Network
-
Kontakt:
- Suresh Nair, MD
- Telefonnummer: 610-402-7880
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Testmetod
Studera befolkning
Patienter med solid eller hematologisk cancer som kan vara och anses vara potentiella kandidater för ett terapeutiskt protokoll kommer att rekryteras till del A av denna studie. Registrering till terapeutiska kliniska prövningar kommer inte att vara beroende av registrering i detta protokoll.
Del B: Forskningssamling Cohort Patienter som potentiellt är lämpliga kommer att identifieras av sin behandlande läkare i varje deltagande sjukdomshanteringsteam.
Beskrivning
Inklusionskriterier:
Del A:
- Patienter med cancer i anamnesen eller patienter utan dokumenterad cancerhistoria som genomgår ett kirurgiskt ingrepp, biopsi eller flytande biopsi (till exempel cellfritt DNA-test) för att bekräfta eller utesluta en cancerdiagnos.
Del B:
- Patienter måste framgångsrikt registreras i del A av MSKCC IRB# 12-245. Förhands skriftligt godkännande för patientens samtycke erhållet från huvud-/medhuvudmannen för MSKCC IRB # 12-245.
Del C:
- Patienten måste få pågående vård hos MSK eller en CHERPn/Alliance/Affiliate-webbplats eller tidigare ha konsulterat en MSK-läkare.
- Patienten måste ha gett sitt samtycke till del A av denna studie.
Del D:
- Patienter utan personlig cancerhistoria med ökad risk för cancerutveckling på grund av familjehistoria, molekylär cancermarkör, känner till bärarstatus för en gen associerad med ökad cancerrisk eller tidigare/pågående miljöexponeringar eller livsstilsfaktorer.
Exklusions kriterier:
Alla delar:
- Ovillig eller oförmögen att ge informerat samtycke.
Del C och D:
- Patienter som har genomgått en allogen benmärgs-/stamcellstransplantation.
- Patienter med en akut eller kronisk myeloid neoplasm, histiocytisk neoplasm eller annan myeloproliferativ sjukdom (t. MDS, MPN, MDS/MPN) som skulle utesluta användningen av blod eller saliv som källa till könscellers DNA. Till exempel patienter med en hematologisk malignitet med hög cirkulerande sjukdomsbörda (definierad som >10 % av WBC från flödescytometri eller CBC-differential).
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Pts med solida tumörer
Patienter måste ha solid eller hematologisk cancer.
för behandling på en .
Patienterna måste ha genomgått patologisk bekräftelse av sin tumör vid MSKCC och ha antingen: 1) arkivvävnad tillgänglig för analys, 2) ha ny vävnadsinsamling planerad som rutinmässig standardvårdsbiopsi eller del av en forskningsbiopsi under en annan klinisk prövning (eller perifert blod) / benmärgsinsamling i fallet med hematologiska cancerformer) utanför detta protokolls sammanhang, eller 3) arkivvävnad .tillgänglig på en extern anläggning.
För prospektiva genotypande vävnadsprover från den primära platsen kommer en metastas eller recidiv att användas baserat på vävnadens tillgänglighet och kvalitet.
|
Del A är den molekylära profileringen av tumörer.
Inga nya tumörbiopsier kommer att utföras i samband med del A. Om en pt har en operation eller tumörbiopsi, kan överbliven vävnad (eller en ytterligare kärna) från denna procedur användas för molekylär profilering.
Klinisk(a) analys(er): Denna testning kommer att utföras i det CLIA-certifierade Molecular Diagnostics Service-laboratoriet.
Forskningsanalys(er): Detta protokoll kommer också att användas som en plattform för att pilotera användningen av undersökningstekniker för "nästa generations" profileringsteknik, inklusive
hel exomsekvensering, helgenomsekvensering RNA-sekvensering cellfri tumör-DNA/RNA-sekvensering, proteomik och andra.
För att bekräfta resultaten som erhållits på dessa analyser med en ortogonal analys, kan ytterligare sekvensering såsom Sanger, Sequenom, MiSeq eller IMPACT-testning användas i antingen CLIA- eller icke-CLIA-inställningen. Del B: DTC Cohort Pts som framgångsrikt registrerats i del B av denna studien kommer att vara kvalificerad för insamling av minimal risk och forskningsbiopsier.
Del C: Klinisk könscellsanalys Deltagare som har donerat ett matchat normalt perifert blodprov för jämförelse med somatisk sekvens kommer att erbjudas möjligheten att få det könslinje-DNA-provet analyserat för närvaron av skadliga eller sannolikt skadliga mutationer i gener på MSK-IMPACT-panelen som är kända för att vara kopplade till ärftlig känslighet eller som finns med på konsensuslistor över gener som bör genomgå sekundär analys (t.ex. "ACMG-listan"). Del D: Germline-profilering för individer med förhöjd cancerrisk |
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
frekvens av "handlingsbara" onkogena mutationer
Tidsram: 1 år
|
"Aktionsbara" mutationer kommer att definieras som antingen 1) en mutation som visat sig förutsäga känslighet eller resistens mot ett läkemedel som FDA godkänt för användning i en annan cancerindikation eller 2) en mutation som förutsäger känslighet eller resistens i prekliniska modeller till en undersökningsklass av läkemedel.
|
1 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
För att bestämma effekten av molekylära profileringsresultat utförda i CLIA-inställningen på behandlingen av patienter.
Tidsram: 1 år
|
Bioinformatikkärnan kommer att hjälpa till att tolka data som genereras av nästa generations sekvenseringstekniker som WES och WGS.
|
1 år
|
|
förhöra mekanismerna
Tidsram: 1 år
|
underliggande respons och motstånd (de-novo och förvärvad) mot riktad terapi.
Den eller de forskningsanalyser som används för att åstadkomma detta kommer att variera baserat på den kliniska miljön och tillgänglig vävnad och kan inkludera Sanger, Sequenom, MiSeq, exon-infångning (dvs: IMPACT), hel exom och helgenomsekvensering.
|
1 år
|
|
Att utforska de genetiska mekanismerna för tumörbildning
Tidsram: 2
|
i en undergrupp av prover utan identifierbara skyldiga genomiska förändringar på högmultiplexad nästa generations sekvensering (d.v.s. IMPACT-testning) genom att använda ännu mer omfattande undersökningsprofileringstekniker såsom hel exomsekvensering, helgenomsekvensering eller RNA-sekvensering
|
2
|
Samarbetspartners och utredare
Utredare
- Huvudutredare: David Solit, MD, Memorial Sloan Kettering Cancer Center
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Seldon CS, Meiyappan K, Hoffman H, Guo JA, Goel N, Hwang WL, Nguyen PL, Mahal BA, Alshalalfa M. Genomic alterations predictive of poor clinical outcomes in pan-cancer. Oncotarget. 2022 Sep 28;13:1069-1077. doi: 10.18632/oncotarget.28276. eCollection 2022.
- Rosenzweig J, Pillai PM, Prockop S, Benayed R, Eidenschink Brodersen L, Najfeld V, Loken MR, Zhang Y, Shukla N. Acute myeloid leukemia with an MN1-ETV6 fusion in a young child with Down syndrome. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2022 Apr 28;8(3):a006167. doi: 10.1101/mcs.a006167. Print 2022 Apr.
- Lin AL, Tabar V, Young RJ, Cohen M, Cuaron J, Yang TJ, Rosenblum M, Rudneva VA, Geer EB, Bodei L. Synergism of Checkpoint Inhibitors and Peptide Receptor Radionuclide Therapy in the Treatment of Pituitary Carcinoma. J Endocr Soc. 2021 Aug 7;5(10):bvab133. doi: 10.1210/jendso/bvab133. eCollection 2021 Oct 1.
- Fiala EM, Jayakumaran G, Mauguen A, Kennedy JA, Bouvier N, Kemel Y, Fleischut MH, Maio A, Salo-Mullen EE, Sheehan M, Arnold AG, Latham A, Carlo MI, Cadoo K, Murkherjee S, Slotkin EK, Trippett T, Glade Bender J, Meyers PA, Wexler L, Dela Cruz FS, Cheung NK, Basu E, Kentsis A, Ortiz M, Francis JH, Dunkel IJ, Khakoo Y, Gilheeney S, Farouk Sait S, Forlenza CJ, Sulis M, Karajannis M, Modak S, Gerstle JT, Heaton TE, Roberts S, Yang C, Jairam S, Vijai J, Topka S, Friedman DN, Stadler ZK, Robson M, Berger MF, Schultz N, Ladanyi M, O'Reilly RJ, Abramson DH, Ceyhan-Birsoy O, Zhang L, Mandelker D, Shukla NN, Kung AL, Offit K, Zehir A, Walsh MF. Prospective pan-cancer germline testing using MSK-IMPACT informs clinical translation in 751 patients with pediatric solid tumors. Nat Cancer. 2021 Mar;2:357-365. doi: 10.1038/s43018-021-00172-1. Epub 2021 Feb 15.
- Stadler ZK, Maio A, Chakravarty D, Kemel Y, Sheehan M, Salo-Mullen E, Tkachuk K, Fong CJ, Nguyen B, Erakky A, Cadoo K, Liu Y, Carlo MI, Latham A, Zhang H, Kundra R, Smith S, Galle J, Aghajanian C, Abu-Rustum N, Varghese A, O'Reilly EM, Morris M, Abida W, Walsh M, Drilon A, Jayakumaran G, Zehir A, Ladanyi M, Ceyhan-Birsoy O, Solit DB, Schultz N, Berger MF, Mandelker D, Diaz LA Jr, Offit K, Robson ME. Therapeutic Implications of Germline Testing in Patients With Advanced Cancers. J Clin Oncol. 2021 Aug 20;39(24):2698-2709. doi: 10.1200/JCO.20.03661. Epub 2021 Jun 16.
- Diolaiti D, Dela Cruz FS, Gundem G, Bouvier N, Boulad M, Zhang Y, Chou AJ, Dunkel IJ, Sanghvi R, Shah M, Geiger H, Rahman S, Felice V, Wrzeszczynski KO, Darnell RB, Antonescu CR, French CA, Papaemmanuil E, Kung AL, Shukla N. A recurrent novel MGA-NUTM1 fusion identifies a new subtype of high-grade spindle cell sarcoma. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6):a003194. doi: 10.1101/mcs.a003194. Print 2018 Dec.
- Forlenza CJ, Zhang Y, Yao J, Benayed R, Steinherz P, Ramaswamy K, Kessel R, Roshal M, Shukla N. A case of KMT2A-SEPT9 fusion-associated acute megakaryoblastic leukemia. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6):a003426. doi: 10.1101/mcs.a003426. Print 2018 Dec.
- Boucai L, Falcone J, Ukena J, Coombs CC, Zehir A, Ptashkin R, Berger MF, Levine RL, Fagin JA. Radioactive Iodine-Related Clonal Hematopoiesis in Thyroid Cancer Is Common and Associated With Decreased Survival. J Clin Endocrinol Metab. 2018 Nov 1;103(11):4216-4223. doi: 10.1210/jc.2018-00803.
- Schram AM, Reales D, Galle J, Cambria R, Durany R, Feldman D, Sherman E, Rosenberg J, D'Andrea G, Baxi S, Janjigian Y, Tap W, Dickler M, Baselga J, Taylor BS, Chakravarty D, Gao J, Schultz N, Solit DB, Berger MF, Hyman DM. Oncologist use and perception of large panel next-generation tumor sequencing. Ann Oncol. 2017 Sep 1;28(9):2298-2304. doi: 10.1093/annonc/mdx294.
- Mandelker D, Zhang L, Kemel Y, Stadler ZK, Joseph V, Zehir A, Pradhan N, Arnold A, Walsh MF, Li Y, Balakrishnan AR, Syed A, Prasad M, Nafa K, Carlo MI, Cadoo KA, Sheehan M, Fleischut MH, Salo-Mullen E, Trottier M, Lipkin SM, Lincoln A, Mukherjee S, Ravichandran V, Cambria R, Galle J, Abida W, Arcila ME, Benayed R, Shah R, Yu K, Bajorin DF, Coleman JA, Leach SD, Lowery MA, Garcia-Aguilar J, Kantoff PW, Sawyers CL, Dickler MN, Saltz L, Motzer RJ, O'Reilly EM, Scher HI, Baselga J, Klimstra DS, Solit DB, Hyman DM, Berger MF, Ladanyi M, Robson ME, Offit K. Mutation Detection in Patients With Advanced Cancer by Universal Sequencing of Cancer-Related Genes in Tumor and Normal DNA vs Guideline-Based Germline Testing. JAMA. 2017 Sep 5;318(9):825-835. doi: 10.1001/jama.2017.11137.
- Borio M, Sheehan M, Katabi N, Sacca RE, Maio A, Kemel Y, Khurram A, Mandelker D, Birsoy O, Solit D, Carlo MI, Liu Y, Abbass M, Banaszak L, Kesserwan C, Murciano-Goroff YR, Latham A, Offit K, Wong RJ, Ghossein R, Boucai L, Tuttle M, Stadler ZK. Prevalence of Germline Pathogenic RET Variants in a Pan-Cancer Patient Population. JCO Precis Oncol. 2026 May;10(5):e2500737. doi: 10.1200/PO-25-00737. Epub 2026 May 22.
- Gelfer R, Gulla A, Kalvin HL, Song Y, Harding J, Abou-Alfa GK, O'Reilly EM, Park W, Chandwani R, Wei A, Kingham P, Drebin J, Balachandran V, D'Angelica M, Soares K, Gonen M, Jarnagin WR. KRAS Variants Are Associated With Survival Outcomes and Genomic Alterations in Biliary Tract Cancers. JCO Precis Oncol. 2024 Dec;8:e2400263. doi: 10.1200/PO.24.00263. Epub 2024 Dec 6.
- Mondaca S, Walch H, Sepulveda S, Schultz N, Munoz G, Yaqubie A, Macanas P, Pareja C, Garcia P, Chatila W, Nervi B, Li B, Harding JJ, Viviani P, Roa JC, Abou-Alfa GK. Clinical and Genomic Characterization of ERBB2-Altered Gallbladder Cancer: Exploring Differences Between an American and a Chilean Cohort. JCO Glob Oncol. 2024 Oct;10:e2400090. doi: 10.1200/GO.24.00090. Epub 2024 Oct 10.
Användbara länkar
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart
Primärt slutförande (Beräknad)
Avslutad studie (Beräknad)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Beräknad)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 12-245
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .