HYPOCHOL : Une stratégie basée sur la génétique pour identifier de nouvelles cibles dans le métabolisme du cholestérol (HYPOCHOL)

L'objectif est de recruter 400 sujets : 200 sujets adultes atteints d'hypobêtalipoprotéinémie familiale (FHBL) (cas index) plus 200 sujets apparentés supplémentaires dans au moins 10 grandes familles FHBL informatives, dans lesquelles il n'y a pas de mutation connue dans les gènes FHBL.

La prise en charge du patient est modifiée : le patient aura un questionnaire Hospital Anxiety and Depression (HAD) (accent mis sur le syndrome dépressif), un journal alimentaire, et quelques analyses sanguines complémentaires (dont analyse génétique).

L'un des principaux problèmes pour recruter des patients FHBL est le fait qu'ils sont asymptomatiques et que le FHBL n'est pas identifié comme une maladie grave par leurs médecins généralistes.

Étape 1. Exclusion de mutations dans des gènes candidats sélectionnés Comme première approche pour cribler des gènes candidats et exclure des patients présentant des mutations connues, les chercheurs ont développé une conception personnalisée basée sur la technologie Haloplex™ (Agilent® Technologies) pour effectuer un séquençage à haut débit des régions codantes de 10 gènes, y compris ceux précédemment décrits dans la FHBL (apolipoprotéine B (APOB), proprotéine convertase subtilisine/kexine de type 9 (PCSK9)), protéine de transfert des triglycérides microsomaux (MTP ou ABL), maladie de rétention des chylomicrons (CMRD), sécrétion associée, GTPase liée à Ras (gène SARA2), ainsi que 6 gènes candidats supplémentaires dans le métabolisme du cholestérol (récepteur des lipoprotéines de basse densité (LDLR), sortiline (SORT1), dégradeur inductible du récepteur LDL (IDOL), protéine de transfert des esters de cholestérol (CETP), apolipoprotéine E ( ApoE) et Angiopoietin-like Protein 3 (ANGTPL3)). Tous les cas index recrutés (n = 200) seront génotypés pour sélectionner uniquement ceux sans mutations dans les gènes précédemment décrits, soit environ 50 % de notre cohorte de cas index.

Étape 2. Identification des familles informatives et séquençage de l'exome Chez les patients sans mutations identifiées, les investigateurs effectueront un dépistage familial afin d'identifier d'autres cas de FHBL parmi les parents probants. Une analyse des paramètres lipidiques plasmatiques à jeun (cholestérol total (TC), cholestérol des lipoprotéines de haute densité (HDL-C), lipoprotéines de basse densité (LDL-C) et triglycérides (TG)) sera effectuée pour chaque apparenté. Les sujets affectés seront déterminés par un LDL-C spontané < 80 mg/dl et/ou apoB < 50 mg/dl. En revanche, les sujets non affectés afficheront du LDL-C > 80 mg/dl et/ou de l'apoB > 50 mg/dl.

Pour les familles nombreuses, les chercheurs combineront ensuite le séquençage de l'exome entier et l'analyse de liaison pour identifier toute nouvelle variante génétique susceptible d'expliquer le FHBL. Selon le pedigree familial, le séquençage de l'exome entier (WES) sera effectué sur 2 à 5 patients par famille. Tous les parents seront génotypés pour l'analyse de liaison.

En parallèle à cette approche génétique, une analyse épidémiologique régionale sera réalisée pour identifier certains clusters géographiques à forte prévalence de la maladie, tels que développés dans le projet nommé VaCaRMe (pour Vascular and Cardiac, Respiratory and Metabolic over diseases)

Un objectif supplémentaire, basé sur un phénotypage exhaustif des patients FHBL, est d'étudier l'innocuité du LDL-C très faible et d'effectuer certaines corrélations génotype-phénotype chez les patients atteints de FHBL.