HYPOCHOL: En genetiskt baserad strategi för att identifiera nya mål i kolesterolmetabolism (HYPOCHOL)

Målet är att rekrytera 400 försökspersoner: 200 vuxna försökspersoner med familjär hypobetalipoproteinemi (FHBL) (indexfall) plus 200 ytterligare relaterade försökspersoner i minst 10 stora informativa FHBL-familjer, där det inte finns någon känd mutation i FHBL-gener.

Patientvården är modifierad: patienten kommer att ha ett frågeformulär för sjukhusångest och depression (fokus på depressivt syndrom), en matdagbok och ytterligare en blodanalys (inklusive genetisk analys).

En av de viktigaste frågorna för att rekrytera FHBL-patienter är det faktum att de är asymtomatiska och att FHBL inte identifieras som en allvarlig sjukdom av deras allmänna läkare.

Steg 1. Exkludera mutationer i utvalda kandidatgener Som ett första tillvägagångssätt för att screena kandidatgener och utesluta patienter med kända mutationer, utvecklade utredarna en anpassad design baserad på Haloplex™-teknologin (Agilent® Technologies) för att utföra högkapacitetssekvensering av de kodande regionerna på 10 gener, inklusive de som tidigare beskrivits i FHBL (apolipoprotein B (APOB), proproteinkonvertas subtilisin/kexin typ 9 (PCSK9)), mikrosomalt triglyceridöverföringsprotein (MTP eller ABL), kylomikronretentionssjukdom (CMRD), sekretionsassocierad, Ras-relaterat GTPas (SARA2-genen), samt 6 ytterligare kandidatgener i kolesterolmetabolism (lågdensitetslipoproteinreceptor (LDLR), Sortilin (SORT1), Inducerbar Degrader av LDL-receptorn (IDOL), Kolesterylesteröverföringsprotein (CETP), Apolipoprotein E ( ApoE) och angiopoietinliknande protein 3 (ANGTPL3)). Alla de rekryterade indexfallen (n=200) kommer att genotypas för att endast välja de utan mutationer i tidigare beskrivna gener, vilket är ungefär 50% av vår indexfallskohort.

Steg 2. Identifiering av informativa familjer och exomsekvensering Hos patienter utan identifierade mutationer kommer utredarna att genomföra en familjär screening för att identifiera andra fall av FHBL bland probandsläktingar. En analys av fastande plasmalipidparametrar (totalkolesterol (TC), högdensitetslipoproteinkolesterol (HDL-C), lågdensitetslipoproteiner (LDL-C) och triglycerider (TG)) kommer att utföras för varje relaterad. Drabbade försökspersoner kommer att bestämmas av en spontan LDL-C < 80 mg/dl och/eller apoB < 50 mg/dl. Däremot kommer icke-påverkade försökspersoner att visa LDL-C > 80 mg/dl och/eller apoB > 50 mg/dl.

För stora familjer kommer utredarna sedan kombinera helexomsekvensering och länkanalys för att identifiera någon ny genetisk variant som sannolikt förklarar FHBL. Beroende på familjens stamtavla kommer helexomsekvensering (WES) att utföras på 2 till 5 patienter per familj. Alla släktingar kommer att genotypas för länkanalys.

Parallellt med detta genetiska tillvägagångssätt kommer en regional epidemiologisk analys att utföras för att identifiera några geografiska kluster med en hög förekomst av sjukdomen, som utvecklats i projektet med namnet VaCaRMe (för vaskulära och hjärt-, respiratoriska och metaboliska övervinna sjukdomar)

Ett ytterligare syfte, baserat på en uttömmande fenotypning av FHBL-patienter, är att undersöka säkerheten för mycket låg LDL-C och att utföra vissa genotyp-fenotyp-korrelationer hos patienter med FHBL-population."