HYPOCHOL: En genetisk basert strategi for å identifisere nye mål i kolesterolmetabolisme (HYPOCHOL)

Målet er å rekruttere 400 forsøkspersoner: 200 voksne individer med familiær hypobetalipoproteinemi (FHBL) (indekstilfeller) pluss 200 ytterligere relaterte individer i minst 10 store informative FHBL-familier, der det ikke er kjent mutasjon i FHBL-gener.

Pasientbehandlingen er modifisert: Pasienten vil ha et spørreskjema om sykehusangst og depresjon (HAD) (fokus på depressivt syndrom), en matdagbok og litt ekstra blodanalyse (inkludert genetisk analyse).

Et av hovedproblemene for å rekruttere FHBL-pasienter er det faktum at de er asymptomatiske og at FHBL ikke er identifisert som en alvorlig sykdom av deres allmennleger.

Trinn 1. Ekskludering av mutasjoner i utvalgte kandidatgener Som en første tilnærming for å screene kandidatgener og ekskludere pasienter med kjente mutasjoner, utviklet etterforskerne et tilpasset design basert på Haloplex™-teknologien (Agilent® Technologies) for å utføre sekvensering med høy gjennomstrømning av kodende regioner på 10 gener, inkludert de som tidligere er beskrevet i FHBL (apolipoprotein B (APOB), Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9)), mikrosomalt triglyseridoverføringsprotein (MTP eller ABL), chylomikronretensjonssykdom (CMRD), sekresjonsassosiert, Ras-relatert GTPase (SARA2-gen), samt 6 ekstra kandidatgener i kolesterolmetabolisme (lavdensitetslipoproteinreseptor (LDLR), Sortilin (SORT1), Inducible Degrader of LDL-reseptoren (IDOL), Cholesteryl ester transfer protein (CETP), Apolipoprotein E ( ApoE) og angiopoietinlignende protein 3 (ANGTPL3)). Alle de rekrutterte indekstilfellene (n=200) vil bli genotypet for å velge bare de uten mutasjoner i tidligere beskrevne gener, og er omtrent 50 % av vår indekstilfelleskohort.

Steg 2. Identifisering av informative familier og eksomsekvensering Hos pasienter uten identifiserte mutasjoner vil etterforskerne gjennomføre en familiær screening for å identifisere andre tilfeller av FHBL blant proband-slektninger. En analyse av fastende plasmalipidparametre (totalkolesterol (TC), høydensitetslipoproteinkolesterol (HDL-C), lavdensitetslipoproteiner (LDL-C) og triglyserider (TG)) vil bli utført for hver relatert. Berørte personer vil bli bestemt av en spontan LDL-C < 80 mg/dl og/eller apoB < 50 mg/dl. I motsetning til dette vil ikke-påvirkede forsøkspersoner vise LDL-C > 80 mg/dl og/eller apoB > 50 mg/dl.

For store familier vil etterforskerne deretter kombinere heleksom-sekvensering og koblingsanalyse for å identifisere enhver ny genetisk variant som sannsynligvis forklarer FHBL. Avhengig av familiens stamtavle, vil heleksomsekvensering (WES) bli utført på 2 til 5 pasienter per familie. Alle slektninger vil bli genotypet for koblingsanalyse.

Parallelt med denne genetiske tilnærmingen vil det bli utført en regional epidemiologisk analyse for å identifisere noen geografiske klynger med høy forekomst av sykdommen, som utviklet i prosjektet kalt VaCaRMe (for vaskulære og hjerte-, respiratoriske og metabolske overvinne sykdommer)

Et tilleggsmål, basert på en uttømmende fenotyping av FHBL-pasienter, er å undersøke sikkerheten til svært lav LDL-C og å utføre noen genotype-fenotype-korrelasjoner hos pasienter med FHBL-populasjon."