HYPOCHOL: En genetisk baseret strategi til at identificere nye mål i kolesterolmetabolisme (HYPOCHOL)

Målet er at rekruttere 400 forsøgspersoner: 200 voksne forsøgspersoner med familiær hypobetalipoproteinæmi (FHBL) (indekstilfælde) plus 200 yderligere beslægtede forsøgspersoner i mindst 10 store informative FHBL-familier, hvor der ikke er nogen kendt mutation i FHBL-gener.

Patientbehandlingen er ændret: patienten vil have et hospitalsangst og depression (HAD) spørgeskema (fokus på depressivt syndrom), en maddagbog og nogle yderligere blodanalyser (inklusive genetisk analyse).

Et af de vigtigste spørgsmål for at rekruttere FHBL-patienter er det faktum, at de er asymptomatiske, og at FHBL ikke er identificeret som en alvorlig sygdom af deres almene læger.

Trin 1. Udelukkelse af mutationer i udvalgte kandidatgener Som en første tilgang til at screene kandidatgener og udelukke patienter med kendte mutationer, udviklede efterforskerne et brugerdefineret design baseret på Haloplex™-teknologien (Agilent® Technologies) til at udføre high-throughput-sekventering af de kodende regioner på 10 gener, herunder dem, der tidligere er beskrevet i FHBL (apolipoprotein B (APOB), Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9)), mikrosomalt triglyceridoverførselsprotein (MTP eller ABL), chylomikronretentionssygdom (CMRD), sekretionsassocieret, Ras-relateret GTPase (SARA2-gen), samt 6 yderligere kandidatgener i kolesterolmetabolisme (low density lipoprotein-receptor (LDLR), Sortilin (SORT1), Inducible Degrader of LDL-receptoren (IDOL), Cholesteryl ester transfer protein (CETP), Apolipoprotein E ( ApoE) og angiopoietin-lignende protein 3 (ANGTPL3)). Alle de rekrutterede indekstilfælde (n=200) vil blive genotypebestemt til kun at udvælge dem uden mutationer i tidligere beskrevne gener, hvilket er cirka 50% af vores indekstilfælde-kohorte.

Trin-2. Identifikation af informative familier og exome-sekventering Hos patienter uden identificerede mutationer vil efterforskerne udføre en familiær screening for at identificere andre tilfælde af FHBL blandt proband-slægtninge. En analyse af fastende plasmalipidparametre (totalkolesterol (TC), højdensitetslipoproteinkolesterol (HDL-C), lavdensitetslipoproteiner (LDL-C) og triglycerider (TG)) vil blive udført for hver relaterede. Berørte forsøgspersoner vil blive bestemt af en spontan LDL-C < 80 mg/dl og/eller apoB < 50 mg/dl. I modsætning hertil vil ikke-ramte forsøgspersoner vise LDL-C > 80 mg/dl og/eller apoB > 50 mg/dl.

For store familier vil efterforskerne derefter kombinere hel-eksom-sekventering og koblingsanalyse for at identificere enhver ny genetisk variant, der sandsynligvis forklarer FHBL. Afhængigt af familiens stamtavle vil hel-eksom-sekventering (WES) blive udført på 2 til 5 patienter pr. familie. Alle slægtninge vil blive genotypet til koblingsanalyse.

Parallelt med denne genetiske tilgang vil der blive udført en regional epidemiologisk analyse for at identificere nogle geografiske klynger med en høj forekomst af sygdommen, som udviklet i projektet kaldet VaCaRMe (for Vascular and Cardiac, Respiratory and Metabolic overcome diseases)

Et yderligere mål, baseret på en udtømmende fænotypning af FHBL-patienter, er at undersøge sikkerheden ved meget lavt LDL-C og at udføre nogle genotype-fænotype-korrelationer hos patienter med FHBL-population."