HYPOCHOL: Genetyczna strategia identyfikacji nowych celów w metabolizmie cholesterolu (HYPOCHOL)

Celem jest rekrutacja 400 osób: 200 osób dorosłych z rodzinną hipobetalipoproteinemią (FHBL) (przypadki indeksowe) plus 200 dodatkowych spokrewnionych osób w co najmniej 10 dużych informacyjnych rodzinach FHBL, w których nie ma znanej mutacji w genach FHBL.

Opieka nad pacjentem jest zmodyfikowana: pacjent będzie miał kwestionariusz szpitalnego lęku i depresji (HAD) (z naciskiem na zespół depresyjny), dzienniczek żywieniowy i dodatkowe badania krwi (w tym analizę genetyczną).

Jedną z głównych kwestii związanych z rekrutacją pacjentów z FHBL jest fakt, że są oni bezobjawowi i że FHBL nie jest identyfikowana przez lekarzy ogólnych jako poważna choroba.

Krok 1. Wykluczanie mutacji w wybranych genach kandydujących Jako pierwsze podejście do przeszukiwania genów kandydujących i wykluczania pacjentów ze znanymi mutacjami, badacze opracowali niestandardowy projekt oparty na technologii Haloplex™ (Agilent® Technologies) w celu przeprowadzenia wysokowydajnego sekwencjonowania regionów kodujących 10 geny, w tym te opisane wcześniej w FHBL (apolipoproteina B (APOB), konwertaza probiałkowa subtylizyna/keksyna typu 9 (PCSK9)), mikrosomalne białko przenoszące triglicerydy (MTP lub ABL), choroba retencji chylomikronów (CMRD), związana z sekrecją, GTPaza związana z Ras (gen SARA2), a także 6 dodatkowych genów kandydujących w metabolizmie cholesterolu (receptor lipoprotein o niskiej gęstości (LDLR), sortilina (SORT1), indukowalny degradator receptora LDL (IDOL), białko przenoszące estry cholesterolu (CETP), apolipoproteina E ( ApoE) i białko podobne do angiopoetyny 3 (ANGTPL3)). Wszystkie zwerbowane przypadki indeksu (n = 200) zostaną genotypowane w celu wybrania tylko tych bez mutacji we wcześniej opisanych genach, co stanowi około 50% naszej kohorty przypadków indeksu.

Krok 2. Identyfikacja rodzin informacyjnych i sekwencjonowanie egzomu U pacjentów bez zidentyfikowanych mutacji badacze przeprowadzą rodzinne badanie przesiewowe w celu zidentyfikowania innych przypadków FHBL wśród krewnych probandów. Analiza parametrów lipidowych osocza na czczo (cholesterolu całkowitego (TC), cholesterolu lipoprotein o wysokiej gęstości (HDL-C), lipoprotein o małej gęstości (LDL-C) i triglicerydów (TG)) zostanie przeprowadzona dla każdego spokrewnionego. Osoby dotknięte chorobą zostaną określone na podstawie spontanicznego LDL-C < 80 mg/dl i/lub apoB < 50 mg/dl. Natomiast osoby zdrowe będą wykazywać LDL-C > 80 mg/dl i/lub apoB > 50 mg/dl.

W przypadku dużych rodzin badacze połączą następnie sekwencjonowanie całego egzomu i analizę powiązań, aby zidentyfikować każdy nowy wariant genetyczny, który prawdopodobnie wyjaśnia FHBL. W zależności od rodowodu rodziny, sekwencjonowanie całego egzomu (WES) zostanie przeprowadzone u 2 do 5 pacjentów na rodzinę. Wszyscy krewni zostaną poddani genotypowaniu do analizy powiązań.

Równolegle do tego podejścia genetycznego zostanie przeprowadzona regionalna analiza epidemiologiczna w celu zidentyfikowania niektórych klastrów geograficznych o wysokiej częstości występowania choroby, zgodnie z projektem o nazwie VaCaRMe (w przypadku przezwyciężenia chorób naczyniowych i sercowych, oddechowych i metabolicznych).

Dodatkowym celem, opartym na wyczerpującym fenotypowaniu pacjentów z FHBL, jest zbadanie bezpieczeństwa bardzo niskiego LDL-C i wykonanie pewnych korelacji genotyp-fenotyp u pacjentów z populacją FHBL”.