HYPOCHOL: генетически обоснованная стратегия для выявления новых мишеней в метаболизме холестерина (HYPOCHOL)

Цель состоит в том, чтобы набрать 400 субъектов: 200 взрослых субъектов с семейной гипобеталипопротеинемией (FHBL) (показательные случаи) плюс 200 дополнительных родственных субъектов по крайней мере в 10 больших информативных семьях FHBL, в которых нет известных мутаций в генах FHBL.

Уход за пациентом изменен: у пациента будет анкета госпитальной тревоги и депрессии (HAD) (с акцентом на депрессивный синдром), пищевой дневник и некоторые дополнительные анализы крови (включая генетический анализ).

Одной из основных проблем при наборе пациентов с FHBL является тот факт, что они бессимптомны и что их врачи общей практики не определяют FHBL как серьезное заболевание.

Шаг 1. Исключение мутаций в выбранных генах-кандидатах В качестве первого подхода к скринингу генов-кандидатов и исключению пациентов с известными мутациями исследователи разработали индивидуальный дизайн на основе технологии Haloplex™ (Agilent® Technologies) для выполнения высокопроизводительного секвенирования кодирующих областей 10 гены, в том числе ранее описанные в FHBL (аполипопротеин B (APOB), пропротеинконвертаза субтилизин/кексин типа 9 (PCSK9)), микросомальный белок-переносчик триглицеридов (MTP или ABL), ретенционная болезнь хиломикронов (CMRD), связанная с секрецией, родственная Ras ГТФаза (ген SARA2), а также 6 дополнительных генов-кандидатов в метаболизме холестерина (рецептор липопротеинов низкой плотности (LDLR), сортилин (SORT1), индуцибельный деградер рецептора ЛПНП (IDOL), белок-переносчик эфира холестерина (CETP), аполипопротеин E ( ApoE) и ангиопоэтиноподобный белок 3 (ANGTPL3)). Все набранные индексные случаи (n = 200) будут генотипированы, чтобы выбрать только тех, у кого нет мутаций в ранее описанных генах, что составляет примерно 50% нашей когорты индексных случаев.

Шаг 2. Выявление информативных семей и секвенирование экзома У пациентов без выявленных мутаций исследователи проведут семейный скрининг для выявления других случаев FHBL среди родственников пробанда. Анализ параметров липидов плазмы натощак (общий холестерин (ТС), холестерин липопротеинов высокой плотности (ЛПВП-Х), липопротеинов низкой плотности (ЛПНП-Х) и триглицеридов (ТГ)) будет проводиться для каждого родственного. Пораженные субъекты будут определяться по спонтанному уровню холестерина ЛПНП <80 мг/дл и/или апоВ <50 мг/дл. Напротив, у здоровых субъектов уровень ХС-ЛПНП > 80 мг/дл и/или уровень апоВ > 50 мг/дл.

Для больших семей исследователи затем объединят секвенирование всего экзома и анализ сцепления, чтобы идентифицировать любой новый генетический вариант, который, вероятно, объясняет FHBL. В зависимости от родословной семьи полноэкзомное секвенирование (WES) будет проводиться у 2–5 пациентов в семье. Все родственники будут генотипированы для анализа сцепления.

Параллельно с этим генетическим подходом будет проведен региональный эпидемиологический анализ для выявления некоторых географических кластеров с высокой распространенностью заболевания, как это было разработано в проекте под названием VaCaRMe (для сосудистых и сердечных, респираторных и метаболических заболеваний).

Дополнительная цель, основанная на исчерпывающем фенотипировании пациентов с FHBL, состоит в том, чтобы исследовать безопасность очень низкого уровня LDL-C и провести некоторые корреляции генотип-фенотип у пациентов с FHBL».