IPOCOLLO: una strategia basata sulla genetica per identificare nuovi bersagli nel metabolismo del colesterolo (HYPOCHOL)

L'obiettivo è reclutare 400 soggetti: 200 soggetti adulti con ipobetalipoproteinemia familiare (FHBL) (casi indice) più 200 soggetti correlati aggiuntivi in ​​almeno 10 grandi famiglie FHBL informative, in cui non è nota alcuna mutazione nei geni FHBL.

La cura del paziente viene modificata: il paziente avrà un questionario sull'ansia e la depressione ospedaliera (HAD) (concentrato sulla sindrome depressiva), un diario alimentare e alcune analisi del sangue aggiuntive (inclusa l'analisi genetica).

Uno dei problemi principali per reclutare pazienti FHBL è il fatto che sono asintomatici e che FHBL non è identificato come una malattia grave dai loro medici generici.

Passo 1. Escludendo le mutazioni nei geni candidati selezionati Come primo approccio per vagliare i geni candidati ed escludere i pazienti con mutazioni note, i ricercatori hanno sviluppato un progetto personalizzato basato sulla tecnologia Haloplex™ (Agilent® Technologies) per eseguire il sequenziamento ad alto rendimento delle regioni codificanti di 10 geni, inclusi quelli precedentemente descritti in FHBL (apolipoproteina B (APOB), proproteina convertasi subtilisina/kexina tipo 9 (PCSK9)), proteina microsomiale di trasferimento dei trigliceridi (MTP o ABL), malattia da ritenzione dei chilomicroni (CMRD), secrezione associata, GTPasi correlata a Ras (gene SARA2), oltre a 6 geni candidati aggiuntivi nel metabolismo del colesterolo (recettore delle lipoproteine ​​a bassa densità (LDLR), sortilina (SORT1), degradatore inducibile del recettore LDL (IDOL), proteina di trasferimento dell'estere del colesterolo (CETP), apolipoproteina E ( ApoE) e Angiopoietin-like Protein 3 (ANGTPL3)). Tutti i casi indice reclutati (n=200) saranno genotipizzati per selezionare solo quelli senza mutazioni nei geni precedentemente descritti, che rappresentano circa il 50% della nostra coorte di casi indice.

Passo 2. Identificazione di famiglie informative e sequenziamento dell'esoma Nei pazienti senza mutazioni identificate, gli investigatori condurranno uno screening familiare al fine di identificare altri casi di FHBL tra parenti probandi. Verrà eseguita un'analisi dei parametri lipidici plasmatici a digiuno (colesterolo totale (TC), colesterolo lipoproteico ad alta densità (HDL-C), lipoproteine ​​a bassa densità (LDL-C) e trigliceridi (TG)) per ciascun correlato. I soggetti affetti saranno determinati da un LDL-C spontaneo < 80 mg/dl e/o apoB < 50 mg/dl. Al contrario, i soggetti non affetti mostreranno LDL-C > 80 mg/dl e/o apoB > 50 mg/dl.

Per le famiglie numerose, i ricercatori combineranno quindi il sequenziamento dell'intero esoma e l'analisi del collegamento per identificare qualsiasi nuova variante genetica che probabilmente spieghi FHBL. A seconda del pedigree familiare, verrà eseguito il sequenziamento dell'intero esoma (WES) su 2-5 pazienti per famiglia. Tutti i parenti saranno genotipizzati per l'analisi di linkage.

Parallelamente a questo approccio genetico, verrà eseguita un'analisi epidemiologica regionale per identificare alcuni cluster geografici con un'elevata prevalenza della malattia, come sviluppato nel progetto denominato VaCaRMe (per le malattie vascolari e cardiache, respiratorie e metaboliche superate)

Un ulteriore obiettivo, basato su un'esauriente fenotipizzazione dei pazienti FHBL, è quello di studiare la sicurezza di LDL-C molto basso e di eseguire alcune correlazioni genotipo-fenotipo nei pazienti con popolazione FHBL".