Définir des biomarqueurs micro-ARN circulants pour le diagnostic précoce et le pronostic du sepsis (miRNA-Sepsis)

Une cohorte d'observation prospective de patients tout au long du continuum de la septicémie au service des urgences de l'hôpital universitaire national (ED) sera inscrite avec des témoins non infectieux. Les échantillons de sang total seront immédiatement séparés en plasma et sérum pour stockage au dépôt de tissus. Ceux qui sont ensuite admis en division générale, en haute dépendance (HD) ou en unité de soins intensifs (USI) verront leurs 2e et 3e échantillons obtenus à 24-48 heures et 48-72 heures respectivement. Les 2ème et 3ème échantillons seront utilisés comme marqueurs pronostiques (Objectif #2). Les patients qui sortent directement de l'urgence seront suivis pour toute récidive clinique de leur maladie dans les 28 jours afin d'assurer l'exactitude diagnostique du premier échantillon de biomarqueurs extraits.

Les échantillons seront traités par lots via le flux de travail de profilage des miARN en circulation comprenant les phases de pré-analyse, d'analyse, de traitement et d'analyse des données. Ce profilage de miARN basé sur qPCR a un rapport fonctionnalité / échantillon beaucoup plus petit, permettant ainsi une sélection directe séquentielle globale pour combiner de manière optimale une multitude de fonctionnalités avec des forces de prédiction complémentaires pour former le panel de biomarqueurs qui a le moins de composants et la puissance de classification maximisée (ROC ASC). La mesure de la robustesse du panneau à l'aide de bruits générés par calcul et la validation avec un plus grand ensemble d'échantillons en aveugle seront effectuées.

L'objectif final sera évalué en mesurant les concentrations de cytokines sécrétées, de chimiokines et d'espèces réactives de l'oxygène après synthèse et transfection du panel de miARN nouvellement dérivés dans des monocytes et des lignées cellulaires monocytaires.