Definiowanie krążących biomarkerów mikro-RNA do wczesnej diagnozy i prognozowania sepsy (miRNA-Sepsis)

Prospektywna obserwacyjna kohorta pacjentów z całego kontinuum posocznicy w National University Hospital Emergency Department (SOR) zostanie włączona wraz z niezakaźnymi kontrolami. Próbki krwi pełnej zostaną natychmiast rozdzielone na osocze i surowicę do przechowywania w Repozytorium Tkanek. Ci, którzy zostaną następnie przyjęci na oddział ogólny, oddział intensywnej terapii (HD) lub oddział intensywnej terapii (ICU), otrzymają drugą i trzecią próbkę odpowiednio po 24-48 godzinach i 48-72 godzinach. Druga i trzecia próbka zostaną użyte jako markery prognostyczne (Cel nr 2). Pacjenci wypisani bezpośrednio z SOR będą śledzeni pod kątem jakiegokolwiek klinicznego nawrotu choroby w ciągu 28 dni, aby zapewnić dokładność diagnostyczną pierwszej próbki biomarkerów, które są pobierane.

Próbki będą przetwarzane wsadowo za pośrednictwem przepływu pracy profilowania miRNA w obiegu, obejmującego fazy przedanalityczne, analityczne oraz przetwarzania i analizy danych. To profilowanie miRNA oparte na qPCR ma znacznie mniejszy stosunek cech do próbek, co umożliwia globalną sekwencyjną selekcję do przodu w celu optymalnego połączenia wielu cech z uzupełniającymi się mocami przewidywania w celu utworzenia panelu biomarkerów, który ma najmniejszą liczbę składników i zmaksymalizował moc klasyfikacji (ROC AUC). Przeprowadzony zostanie pomiar odporności panelu przy użyciu szumów generowanych komputerowo i walidacja z większym zestawem zaślepionych próbek.

Ostateczny cel zostanie oceniony poprzez pomiar stężeń wydzielanych cytokin, chemokin i reaktywnych form tlenu po syntezie i transfekcji nowo powstałego panelu miRNA do monocytów i monocytowych linii komórkowych.