Circulerende micro-RNA-biomarkers definiëren voor de vroege diagnose en prognose van sepsis (miRNA-Sepsis)

Een prospectief observationeel cohort van patiënten langs het gehele sepsis-continuüm op de afdeling spoedeisende hulp van het National University Hospital (ED) zal worden ingeschreven, samen met niet-infectieuze controles. Volbloedmonsters worden onmiddellijk gescheiden in plasma en serum voor opslag in de Tissue Repository. Degenen die vervolgens worden opgenomen op de algemene afdeling, de hoge afhankelijkheid (HD) of de intensive care (ICU) zullen hun 2e en 3e monster krijgen na respectievelijk 24-48 uur en 48-72 uur. De 2e en 3e monsters zullen worden gebruikt als prognostische markers (Doelstelling #2). Patiënten die direct uit de SEH worden ontslagen, worden binnen 28 dagen gevolgd op eventuele klinische herhaling van hun ziekte om de diagnostische nauwkeurigheid van het eerste monster biomarkers dat wordt geëxtraheerd te waarborgen.

Monsters zullen batchgewijs worden verwerkt via de circulerende miRNA-profileringsworkflow, bestaande uit de pre-analyse, analyse en gegevensverwerking en analysefasen. Deze op qPCR gebaseerde miRNA-profilering heeft een veel kleinere kenmerk-tot-monsterverhouding, waardoor een wereldwijde sequentiële voorwaartse selectie mogelijk is om een ​​groot aantal kenmerken optimaal te combineren met complementaire voorspellingssterkten om het biomarker-paneel te vormen met het minste aantal componenten en het maximale classificatievermogen (ROC). AUC). Robuustheidsmeting van het paneel met behulp van door computers gegenereerde ruis en validatie met een grotere set geblindeerde monsters zal worden uitgevoerd.

Het einddoel zal worden beoordeeld door de concentraties van uitgescheiden cytokines, chemokines en reactieve zuurstofspecies te meten na synthese en transfectie van het nieuw verkregen miRNA-panel in monocyten en monocytische cellijnen.