Definiera cirkulerande mikro-RNA-biomarkörer för tidig diagnos och prognos av sepsis (miRNA-Sepsis)

Prospektiv observationskohort av patienter längs hela sepsiskontinuumet på National University Hospital Emergency Department (ED) kommer att registreras tillsammans med icke-infektionskontroller. Helblodsprover kommer omedelbart att separeras i plasma och serum för förvaring i vävnadsförvaret. De som därefter läggs in på allmän avdelning, högt beroende (HD) eller intensivvårdsavdelning (ICU) kommer att få sina 2:a och 3:e prover tagna vid 24-48 timmar respektive 48-72 timmar. Det andra och tredje provet kommer att användas som prognostiska markörer (Mål #2). Patienter som skrivs ut direkt från akuten kommer att spåras för eventuella kliniska återfall av sin sjukdom inom 28 dagar för att säkerställa den diagnostiska noggrannheten för det första provet av biomarkörer som extraheras.

Proverna kommer att batchbearbetas via det cirkulerande miRNA-profileringsarbetsflödet som består av föranalys-, analys- och databearbetnings- och analysfaserna. Denna qPCR-baserade miRNA-profilering har mycket mindre funktion till prov-förhållande, vilket gör det möjligt för ett globalt sekventiellt framåtval för att optimalt kombinera en mängd funktioner med kompletterande förutsägelsestyrkor för att bilda biomarkörspanelen som har det minsta antalet komponenter och den maximerade klassificeringskraften (ROC) AUC). Panelens robusthetsmätning med beräkningsgenererade brus och validering med en större uppsättning blindade prover kommer att utföras.

Det slutliga målet kommer att bedömas genom att mäta koncentrationerna av utsöndrade cytokiner, kemokiner och reaktiva syrearter efter syntes och transfektion av den nyligen härledda miRNA-panelen till monocyter och monocytiska cellinjer.