Caractéristiques génétiques et télomériques des sarcomes des tissus mous de haut grade

Objectifs

Les chercheurs prévoient une étude observationnelle pilote de 2 ans pour :

• Identifier et quantifier l'ADN cellulaire circulant (cfDNA) dans les cas de sarcome des tissus mous (STS)
• Étudier les mécanismes de maintenance des télomères (TMM) dans les STS.
• Utiliser les mutations génétiques associées au TMM pour identifier et quantifier le cfDNA dérivé de la tumeur dans les STS au moment de la résection tumorale et tout au long du suivi
• Suivez les caractéristiques du cfDNA dérivées de la tumeur ci-dessus au fil du temps et corrélez-les avec les résultats cliniques pour identifier les biomarqueurs potentiels du STS. Compte tenu du rôle clé que joue le maintien de la longueur des télomères dans le développement des cellules cancéreuses, les chercheurs émettent également l'hypothèse que des mutations associées au TMM seront présentes dans l'ADNc dérivé de la tumeur, agiront comme des marqueurs stables du tissu STS et, par conséquent, augmenteront la concentration en cas de récidive locale ou de maladie métastatique.

Identification du cfDNA dérivé de la tumeur Dans les mois 0 à 3, des tests sensibles pour cibler les mutations connues spécifiques à la tumeur seront développés. En les utilisant sur des tissus collectés rétrospectivement, les chercheurs vérifieront que le cfDNA peut être détecté (et quantifié) dans le plasma de patients atteints de STS.

Analyse des TMM dans le tissu STS Dans les mois 3 à 12, des échantillons de tumeurs de chaque échantillon recruté de manière prospective seront analysés pour déterminer quel TMM est activé dans les STS. L'activité de la télomérase et de l'ALT sera évaluée chacune par des techniques de laboratoire publiées.

Quantification et caractérisation des mutations associées au TMM / cfDNA dérivé de la tumeur Au cours des mois 10 à 12, des tests quantitatifs basés sur la réaction en chaîne de la polymérase seront développés pour identifier les mutations associées au TMM qui se sont avérées les plus répandues dans les STS. Au cours des mois 12 à 22, ces tests seront utilisés pour identifier et quantifier ces mutations associées à la TMM (et donc également le cfDNA dérivé de la tumeur) dans les échantillons de plasma prélevés sur chaque patient recruté de manière prospective au moment de la chirurgie et tout au long du suivi.

Corrélation des caractéristiques du cfDNA avec les résultats cliniques Au cours des mois 22 à 24, la concentration de cfDNA, la concentration de cfDNA dérivée de la tumeur et les caractéristiques génétiques des deux seront corrélées avec la mesure des résultats cliniques, y compris la récidive locale, la récidive métastatique et le décès, afin de déterminer le potentiel de ces caractéristiques en tant que futurs biomarqueurs .

Recrutement des patients / prélèvement d'échantillons Les patients seront recrutés par l'intermédiaire du East Midlands Sarcoma Service. Les échantillons déjà disponibles seront collectés à partir de 2 sources pour vérifier que le cfDNA peut être détecté dans les STS : dans un premier temps, 20 patients atteints d'une maladie métastatique seront invités à donner leur consentement pour une analyse rétrospective de leur tissu tumoral déjà archivé suite à une analyse histologique. Un échantillon de sang sera également prélevé sur ces patients pour analyse. Deuxièmement, chaque échantillon STS déjà stocké dans la biobanque des sciences de la santé de Nottingham (hôpital de la ville de Nottingham) accompagné d'un échantillon de plasma également stocké (15 au moment de la rédaction) sera analysé.

Pour les investigateurs restant à analyser entre les mois 0 et 22, les patients atteints de STS de haut grade non métastatiques subissant une résection planifiée localement seront approchés pour participer. Les chiffres de 2013 suggèrent que plus de 100 patients seront éligibles pour l'inclusion. Le tissu tumoral, le sang, les muscles et la salive non affectés (2 sources d'ADN de contrôle) seront prélevés au moment de la résection. Des échantillons de sang répétés seront prélevés tous les 3 mois jusqu'à la fin du recrutement.