A magas fokozatú lágyszöveti szarkómák genetikai és telomer jellemzői

Célok

A kutatók egy 2 éves kísérleti megfigyelési tanulmányt terveznek, hogy:

• A keringő sejtdíj DNS (cfDNS) azonosítása és mennyiségi meghatározása lágyszöveti szarkóma (STS) esetén
• Vizsgálja meg a telomerkarbantartási mechanizmusokat (TMM) az STS-ekben.
• Használjon TMM-hez kapcsolódó genetikai mutációkat a tumor eredetű cfDNS azonosítására és mennyiségi meghatározására az STS-ekben a tumor reszekció idején és a követés során
• Kövesse nyomon a fenti tumoreredetű cfDNS-jellemzőket az idő múlásával, és korrelálja a klinikai eredménnyel, hogy azonosítsa a lehetséges STS biomarkereket. Hipotézisek Más rákos megbetegedések eredményei alapján feltételezhető, hogy STS esetén kimutatható lesz a plazma cfDNS. Tekintettel arra, hogy a telomerhossz fenntartása kulcsszerepet játszik a rákos sejtek fejlődésében, a kutatók azt is feltételezik, hogy a TMM-hez kapcsolódó mutációk jelen lesznek a tumor eredetű cfDNS-ben, az STS szövet stabil markereiként működnek, és ezért a koncentráció növekedése lokális kiújulás vagy metasztatikus betegség esetén.

Tumoreredetű cfDNS azonosítás Hónapokon belül 0-3 szenzitív tesztet dolgoznak ki az ismert tumorspecifikus mutációk megcélzására. Ezeket retrospektíven gyűjtött szöveteken használva a vizsgálók ellenőrizni fogják, hogy a cfDNS kimutatható (és mennyiségileg meghatározható) az STS-ben szenvedő betegek plazmájában.

TMM-ek analízise STS-szövetben Hónapokon belül 3-12 tumormintát elemeznek minden prospektívan felvett mintából, hogy megállapítsák, melyik TMM aktiválódik STS-ben. A telomeráz és az ALT aktivitást publikált laboratóriumi technikákkal értékelik.

A TMM-hez kapcsolódó mutációk / tumor eredetű cfDNS számszerűsítése és jellemzése 10-12 hónapon belül kvantitatív polimeráz láncreakción alapuló vizsgálatokat dolgoznak ki az STS-ekben legelterjedtebbnek talált TMM-hez kapcsolódó mutációk azonosítására. A 12-22. hónapban ezeket a vizsgálatokat a TMM-hez kapcsolódó mutációk (és így a tumor eredetű cfDNS) azonosítására és számszerűsítésére fogják használni azokban a plazmamintákban, amelyeket minden potenciálisan toborzott betegtől vettek a műtét idején és a követés során.

A cfDNS-jellemzők összefüggése a klinikai eredménnyel A 22-24. hónapban a cfDNS-koncentrációt, a tumor eredetű cfDNS-koncentrációt és mindkettő genetikai jellemzőit korrelálni kell a klinikai kimenetel mérésével, beleértve a lokális kiújulást, a metasztatikus kiújulást és a halált, hogy meghatározzák ezeknek a jellemzőknek a jövőbeni biomarkerként való potenciálját. .

Betegtoborzás/mintagyűjtés A betegeket az East Midlands Sarcoma Service-n keresztül toborozzák. A már rendelkezésre álló mintákat 2 forrásból gyűjtik annak igazolására, hogy a cfDNS kimutatható-e az STS-ben: Először 20, áttétes betegségben szenvedő betegtől kell beleegyezést kérni a szövettani elemzést követően már archivált daganatszövetük retrospektív elemzéséhez. Ezektől a betegektől egy vérmintát is vesznek elemzés céljából. Másodszor, minden, a Nottingham Health Science Biobank-ban (Nottingham City Hospital) tárolt STS-mintát, valamint a hozzá tartozó, szintén tárolt plazmamintát (az írás idején 15-öt) elemzik.

A hónapok között hátralévő vizsgálók számára 0-22, nem áttétet adó, magas fokú STS-ben szenvedő, helyileg tervezett reszekción áteső beteget keresnek fel a részvételre. A 2013-as adatok szerint több mint 100 beteg lesz jogosult a felvételre. A reszekció során a daganatszövetet, a vért, valamint a nem érintett izmokat és nyálat (a kontroll DNS két forrása) gyűjtik. Az ismételt vérmintákat 3 havonta vesznek a toborzás végéig.