Genetiske og telomere egenskaber ved blødt vævssarkom af høj grad

Mål

Efterforskerne planlægger en 2-årig pilotobservationsundersøgelse for at:

• Identificer og kvantificer cirkulerende celle-fee DNA (cfDNA) i tilfælde af blødt vævssarkom (STS)
• Undersøg Telomere Maintenance Mechanisms (TMM) i STS'er.
• Brug TMM-associerede genetiske mutationer til at identificere og kvantificere tumorafledt cfDNA i STS'er på tidspunktet for tumorresektion og under opfølgningen
• Spor de tumorafledte cfDNA-karakteristika ovenfor over tid og korreler med kliniske resultater for at identificere potentielle STS-biomarkører. Hypoteser Baseret på fund i andre kræftformer antages det, at plasma-cfDNA vil kunne påvises i tilfælde af STS. I betragtning af den nøglerolle, telomerlængdevedligeholdelse spiller i udvikling af kræftceller, antager efterforskerne også, at TMM-associerede mutationer vil være til stede i tumorafledt cfDNA, fungere som stabile markører for STS-væv og derfor øges i koncentration, når lokalt tilbagefald eller metastatisk sygdom forekommer.

Tumorafledt cfDNA-identifikation I månederne 0-3 vil der blive udviklet følsomme assays til at målrette kendte tumorspecifikke mutationer. Ved at bruge disse på retrospektivt indsamlet væv vil efterforskerne verificere, at cfDNA kan påvises (og kvantificeres) i plasma fra patienter med STS'er.

Analyse af TMM'er i STS-væv I månederne 3-12 vil tumorprøver fra hver prospektivt rekrutteret prøve blive analyseret for at fastslå, hvilken TMM der er aktiveret i STS'er. Telomerase- og ALT-aktivitet vil hver blive vurderet ved offentliggjorte laboratorieteknikker.

Kvantificering og karakterisering af TMM-associerede mutationer/tumorafledt cfDNA I 10-12 måneder vil kvantitative polymerasekædereaktionsbaserede assays blive udviklet for at identificere de TMM-associerede mutationer, der er fundet at være mest udbredt i STS'er. I månederne 12-22 vil disse assays blive brugt til at identificere og kvantificere disse TMM-associerede mutationer (og derfor også tumorafledt cfDNA) i plasmaprøverne taget fra hver prospektivt rekrutteret patient på tidspunktet for operationen og under opfølgningen.

Korrelation af cfDNA-karakteristika med klinisk udfald I månederne 22-24 vil cfDNA-koncentration, tumorafledt cfDNA-koncentration og de genetiske karakteristika for begge blive korreleret med klinisk resultatmål, herunder lokalt recidiv, metastatisk recidiv og død for at bestemme disse karakteristikas potentiale som fremtidige biomarkører .

Patientrekruttering / prøveindsamling Patienter vil blive rekrutteret gennem East Midlands Sarcoma Service. Prøver, der allerede er tilgængelige, vil blive indsamlet fra 2 kilder for at verificere, at cfDNA kan påvises i STS'er: For det første vil 20 patienter med metastatisk sygdom blive bedt om at give samtykke til retrospektiv analyse af deres tumorvæv, der allerede er arkiveret efter histologisk analyse. En blodprøve vil også blive indsamlet fra disse patienter til analyse. For det andet vil hver STS-prøve, der allerede er lagret i Nottingham Health Science Biobank, (Nottingham City Hospital) med en tilhørende plasmaprøve, der også er lagret (15 på tidspunktet for skrivning), blive analyseret.

For efterforskerne vil den resterende analyse mellem måneder 0-22 patienter med ikke-metastatiske højgradige STS'er, der gennemgår en planlagt resektion lokalt, blive kontaktet for at deltage. 2013-tal tyder på, at over 100 patienter vil være berettiget til inklusion. Tumorvæv, blod og upåvirket muskel og spyt (2 kilder til kontrol-DNA) vil blive opsamlet på tidspunktet for resektion. Gentagne blodprøver vil blive indsamlet 3 månedligt indtil slutningen af ​​rekrutteringen.