Генетические и теломерные характеристики сарком мягких тканей высокой степени злокачественности

Цели

Исследователи планируют двухлетнее пилотное обсервационное исследование, чтобы:

• Идентификация и количественная оценка циркулирующей клеточной ДНК (вкДНК) в случаях саркомы мягких тканей (СМТ)
• Исследовать механизмы поддержания теломер (TMM) в STS.
• Используйте генетические мутации, связанные с ТММ, для идентификации и количественного определения вкДНК опухоли в STS во время резекции опухоли и на протяжении всего периода наблюдения.
• Отслеживайте указанные выше характеристики вкДНК, полученные из опухоли, с течением времени и коррелируйте с клиническим исходом для выявления потенциальных биомаркеров СТС. Гипотезы На основании данных, полученных при других видах рака, предполагается, что вкДНК плазмы будет обнаруживаться в случаях СТС. Учитывая ключевую роль поддержания длины теломер в развитии раковых клеток, исследователи также предполагают, что мутации, связанные с ТММ, будут присутствовать во вкДНК, полученной из опухоли, действовать как стабильные маркеры ткани STS и, следовательно, увеличиваться в концентрации по мере возникновения местного рецидива или метастатического заболевания.

Идентификация вкДНК, полученной из опухоли. Через 0-3 месяца будут разработаны чувствительные анализы для обнаружения известных опухолеспецифических мутаций. Используя их на ретроспективно собранных тканях, исследователи подтвердят, что вкДНК может быть обнаружена (и определена количественно) в плазме пациентов с СТС.

Анализ ТММ в ткани СТС Через 3–12 месяцев образцы опухоли из каждого потенциально набранного образца будут проанализированы, чтобы установить, какой ТММ активируется в СТС. Активность теломеразы и АЛТ будет оцениваться с помощью опубликованных лабораторных методик.

Количественная оценка и характеристика мутаций, связанных с ТММ / вкДНК, полученной из опухоли. Через 10-12 месяцев будут разработаны количественные анализы на основе полимеразной цепной реакции для выявления мутаций, связанных с ТММ, которые оказались наиболее распространенными в STS. Через 12-22 месяца эти анализы будут использоваться для идентификации и количественной оценки этих мутаций, связанных с ТММ (и, следовательно, вкДНК, происходящей из опухоли) в образцах плазмы, взятых у каждого предполагаемого набранного пациента во время операции и в течение последующего наблюдения.

Корреляция характеристик вкДНК с клиническим исходом Через 22-24 месяца концентрация вкДНК, концентрация вкДНК, полученной из опухоли, и генетические характеристики обоих будут коррелировать с показателем клинического исхода, включая локальный рецидив, метастатический рецидив и смерть, чтобы определить потенциал этих характеристик в качестве будущих биомаркеров. .

Набор пациентов/сбор образцов Пациенты будут набираться через Службу саркомы Ист-Мидлендс. Уже имеющиеся образцы будут собраны из 2 источников, чтобы убедиться, что вкДНК может быть обнаружена в STS: сначала 20 пациентов с метастатическим заболеванием попросят дать согласие на ретроспективный анализ их опухолевой ткани, уже заархивированной после гистологического анализа. У этих пациентов также будет взят один образец крови для анализа. Во-вторых, будет проанализирован каждый образец STS, уже хранящийся в Ноттингемском биобанке медицинских наук (Ноттингемская городская больница) с сопроводительным образцом плазмы (15 на момент написания).

Для оставшегося анализа исследователям между месяцами 0-22 будут предложены для участия пациенты с неметастатическими высокодифференцированными STS, подвергающиеся плановой резекции на месте. Данные за 2013 год предполагают, что более 100 пациентов будут иметь право на включение. Опухолевая ткань, кровь, непораженные мышцы и слюна (2 источника контрольной ДНК) будут собраны во время резекции. Повторные образцы крови будут собираться 3 раза в месяц до окончания набора.