Características genéticas y teloméricas de los sarcomas de tejido blando de alto grado

Objetivos

Los investigadores planean un estudio observacional piloto de 2 años para:

• Identifique y cuantifique el ADN circulante libre de células (cfDNA) en casos de sarcoma de tejido blando (STS)
• Investigar los mecanismos de mantenimiento de los telómeros (TMM) en los STS.
• Use mutaciones genéticas asociadas a TMM para identificar y cuantificar cfDNA derivado de tumor en STS en el momento de la resección del tumor y durante el seguimiento
• Realice un seguimiento de las características de cfDNA derivadas del tumor mencionadas anteriormente a lo largo del tiempo y correlacione con el resultado clínico para identificar posibles biomarcadores de STS. Dado el papel clave que desempeña el mantenimiento de la longitud de los telómeros en el desarrollo de las células cancerosas, los investigadores también plantean la hipótesis de que las mutaciones asociadas con TMM estarán presentes en el ADN sin células derivado del tumor, actuarán como marcadores estables del tejido STS y, por lo tanto, aumentarán su concentración a medida que se produzca una recurrencia local o una enfermedad metastásica.

Identificación de cfDNA derivado de tumores En los meses 0-3 se desarrollarán ensayos sensibles para detectar mutaciones específicas de tumores conocidas. Usando estos en tejidos recolectados retrospectivamente, los investigadores verificarán que el cfDNA se puede detectar (y cuantificar) en el plasma de pacientes con STB.

Análisis de TMM en tejido STS En los meses 3-12, se analizarán muestras tumorales de cada muestra reclutada prospectivamente para establecer qué TMM se activa en STS. La actividad de la telomerasa y la ALT se evaluará mediante técnicas de laboratorio publicadas.

Cuantificación y caracterización de mutaciones asociadas a TMM / cfDNA derivado de tumor En los meses 10-12, se desarrollarán ensayos cuantitativos basados ​​en la reacción en cadena de la polimerasa para identificar las mutaciones asociadas a TMM que son más prevalentes en STS. En los meses 12 a 22, estos ensayos se utilizarán para identificar y cuantificar estas mutaciones asociadas con TMM (y, por lo tanto, también cfDNA derivado del tumor) en las muestras de plasma tomadas de cada paciente prospectivamente reclutado en el momento de la cirugía y durante el seguimiento.

Correlación de las características de cfDNA con el resultado clínico En los meses 22-24, la concentración de cfDNA, la concentración de cfDNA derivada del tumor y las características genéticas de ambos se correlacionarán con la medida del resultado clínico, incluida la recurrencia local, la recurrencia metastásica y la muerte para determinar el potencial de estas características como futuros biomarcadores. .

Reclutamiento de pacientes/recolección de muestras Los pacientes serán reclutados a través del Servicio de Sarcoma de East Midlands. Las muestras ya disponibles se recolectarán de 2 fuentes para verificar que cfDNA se puede detectar en STS: en primer lugar, se pedirá a 20 pacientes con enfermedad metastásica que den su consentimiento para el análisis retrospectivo de su tejido tumoral ya archivado después del análisis histológico. También se recolectará una muestra de sangre de estos pacientes para su análisis. En segundo lugar, se analizarán todas las muestras de STS ya almacenadas en el Biobanco de Ciencias de la Salud de Nottingham (Hospital de la ciudad de Nottingham) con una muestra de plasma adjunta también almacenada (15 en el momento de escribir este artículo).

Para el análisis restante de los investigadores entre los meses 0 y 22, se invitará a participar a los pacientes con STB de alto grado no metastásico que se sometan a una resección planificada localmente. Las cifras de 2013 sugieren que más de 100 pacientes serán elegibles para su inclusión. El tejido tumoral, la sangre y el músculo y la saliva no afectados (2 fuentes de ADN de control) se recolectarán en el momento de la resección. Se recolectarán muestras de sangre repetidas 3 veces al mes hasta el final del reclutamiento.