Charakterystyka genetyczna i telomerowa mięsaków tkanek miękkich o wysokim stopniu złośliwości

Celuje

Badacze planują 2-letnie pilotażowe badanie obserwacyjne, aby:

• Zidentyfikuj i oceń ilościowo krążące DNA komórkowe (cfDNA) w przypadkach mięsaka tkanek miękkich (MTM)
• Zbadaj mechanizmy konserwacji telomerów (TMM) w STS.
• Użyj mutacji genetycznych związanych z TMM, aby zidentyfikować i określić ilościowo cfDNA pochodzące z guza w MTM w czasie resekcji guza i podczas obserwacji
• Śledź powyższą charakterystykę cfDNA pochodzącą z guza w czasie i koreluj z wynikami klinicznymi, aby zidentyfikować potencjalne biomarkery STS. Hipotezy Na podstawie wyników badań innych nowotworów wysunięto hipotezę, że cfDNA w osoczu będzie wykrywalny w przypadkach MTM. Biorąc pod uwagę kluczową rolę, jaką odgrywa utrzymanie długości telomerów w rozwoju komórek nowotworowych, badacze stawiają również hipotezę, że mutacje związane z TMM będą obecne w cfDNA pochodzącym z guza, będą działać jako stabilne markery tkanki STS, a zatem będą zwiększać stężenie w przypadku wystąpienia miejscowego nawrotu lub choroby przerzutowej.

Identyfikacja cfDNA pochodzącego z guza W miesiącach 0-3 zostaną opracowane czułe testy ukierunkowane na znane mutacje specyficzne dla nowotworu. Używając ich na retrospektywnie pobranych tkankach, badacze sprawdzą, czy cfDNA można wykryć (i określić ilościowo) w osoczu pacjentów z MTM.

Analiza TMM w tkance STS W miesiącach 3-12 próbek guza z każdej prospektywnie rekrutowanej próbki zostanie przeanalizowanych w celu ustalenia, który TMM jest aktywowany w MTM. Aktywność telomerazy i ALT będzie oceniana za pomocą opublikowanych technik laboratoryjnych.

Kwantyfikacja i charakterystyka mutacji związanych z TMM / cfDNA pochodzących z guza W ciągu 10-12 miesięcy zostaną opracowane ilościowe testy oparte na reakcji łańcuchowej polimerazy w celu identyfikacji mutacji związanych z TMM, które okazały się najbardziej rozpowszechnione w MTM. W miesiącach 12-22 testy te zostaną wykorzystane do identyfikacji i oceny ilościowej tych mutacji związanych z TMM (a zatem także cfDNA pochodzących z guza) w próbkach osocza pobranych od każdego potencjalnie rekrutowanego pacjenta w czasie operacji i podczas obserwacji.

Korelacja cech cfDNA z wynikami klinicznymi W miesiącach 22-24 stężenie cfDNA, stężenie cfDNA pochodzące z guza i cechy genetyczne obu będą skorelowane z miarą wyniku klinicznego, w tym wznowy miejscowej, wznowy przerzutowej i śmierci, aby określić potencjał tych cech jako przyszłych biomarkerów .

Rekrutacja pacjentów / pobieranie próbek Pacjenci będą rekrutowani za pośrednictwem East Midlands Sarcoma Service. Dostępne już próbki zostaną pobrane z 2 źródeł w celu sprawdzenia, czy cfDNA można wykryć w MTM: Najpierw 20 pacjentów z chorobą przerzutową zostanie poproszonych o wyrażenie zgody na retrospektywną analizę ich tkanki nowotworowej już zarchiwizowanej po analizie histologicznej. Od tych pacjentów zostanie również pobrana jedna próbka krwi do analizy. Po drugie, każda próbka STS już przechowywana w Nottingham Health Science Biobank (Nottingham City Hospital) wraz z towarzyszącą próbką osocza również przechowywaną (15 w momencie pisania) zostanie przeanalizowana.

W przypadku pozostałych analiz badaczy do udziału w badaniu zostaną zaproszeni pacjenci z MTM o wysokim stopniu złośliwości bez przerzutów, poddawani planowanej miejscowej resekcji. Dane z 2013 roku sugerują, że ponad 100 pacjentów będzie kwalifikować się do włączenia. Tkanka guza, krew i nienaruszone mięśnie i ślina (2 źródła kontrolnego DNA) zostaną zebrane w czasie resekcji. Powtórne próbki krwi będą pobierane co 3 miesiące do końca rekrutacji.