Caratteristiche genetiche e dei telomeri dei sarcomi dei tessuti molli di alto grado

Obiettivi

I ricercatori pianificano uno studio osservazionale pilota di 2 anni per:

• Identificare e quantificare il DNA a carico di cellule circolanti (cfDNA) nei casi di sarcoma dei tessuti molli (STS)
• Indagare sui meccanismi di mantenimento dei telomeri (TMM) negli STS.
• Utilizzare le mutazioni genetiche associate alla TMM per identificare e quantificare il cfDNA derivato dal tumore negli STS al momento della resezione del tumore e durante il follow-up
• Tracciare nel tempo le caratteristiche del cfDNA derivato dal tumore e correlarle con l'esito clinico per identificare potenziali biomarcatori di STS Ipotesi Sulla base dei risultati in altri tumori, si ipotizza che il cfDNA plasmatico sarà rilevabile nei casi di STS. Dato il ruolo chiave svolto dal mantenimento della lunghezza dei telomeri nello sviluppo delle cellule tumorali, i ricercatori ipotizzano anche che le mutazioni associate alla TMM saranno presenti nel cfDNA derivato dal tumore, agiranno come marcatori stabili del tessuto STS e quindi aumenteranno la concentrazione quando si verifica una recidiva locale o una malattia metastatica.

Identificazione del cfDNA derivato dal tumore Nei mesi 0-3 saranno sviluppati test sensibili per individuare le mutazioni specifiche del tumore note. Utilizzando questi su tessuti raccolti in modo retrospettivo, i ricercatori verificheranno che il cfDNA può essere rilevato (e quantificato) nel plasma di pazienti con STS.

Analisi dei TMM nel tessuto STS Nei mesi 3-12 verranno analizzati campioni tumorali da ogni campione reclutato in modo prospettico per stabilire quale TMM è attivato nei STS. L'attività della telomerasi e dell'ALT sarà valutata mediante tecniche di laboratorio pubblicate.

Quantificazione e caratterizzazione delle mutazioni associate alla TMM / cfDNA derivato dal tumore Nei mesi 10-12 verranno sviluppati saggi quantitativi basati sulla reazione a catena della polimerasi per identificare le mutazioni associate alla TMM che risultano essere più prevalenti nelle STS. Nei mesi 12-22 questi saggi saranno utilizzati per identificare e quantificare queste mutazioni associate al TMM (e quindi anche il cfDNA derivato dal tumore) nei campioni di plasma prelevati da ogni paziente reclutato in modo prospettico al momento dell'intervento chirurgico e durante il follow-up.

Correlazione delle caratteristiche del cfDNA con l'esito clinico Nei mesi 22-24 la concentrazione di cfDNA, la concentrazione di cfDNA derivata dal tumore e le caratteristiche genetiche di entrambi saranno correlate con la misura dell'esito clinico, inclusa la recidiva locale, la recidiva metastatica e la morte per determinare il potenziale di queste caratteristiche come futuri biomarcatori .

Reclutamento dei pazienti / raccolta dei campioni I pazienti verranno reclutati tramite l'East Midlands Sarcoma Service. I campioni già disponibili saranno raccolti da 2 fonti per verificare che il cfDNA possa essere rilevato negli STS: in primo luogo, a 20 pazienti con malattia metastatica verrà chiesto di dare il consenso per l'analisi retrospettiva del loro tessuto tumorale già archiviato a seguito dell'analisi istologica. Verrà prelevato anche un campione di sangue da questi pazienti per l'analisi. In secondo luogo, verrà analizzato ogni campione di STS già conservato presso la Nottingham Health Science Biobank, (Nottingham City Hospital) con un campione di plasma di accompagnamento anch'esso conservato (15 al momento della scrittura).

Per i ricercatori, l'analisi rimanente tra i mesi 0-22 verrà contattata per partecipare ai pazienti con STS di alto grado non metastatici sottoposti a resezione pianificata localmente. I dati del 2013 suggeriscono che oltre 100 pazienti saranno idonei per l'inclusione. Il tessuto tumorale, il sangue, il muscolo non affetto e la saliva (2 fonti di DNA di controllo) saranno raccolti al momento della resezione. I campioni di sangue ripetuti verranno raccolti 3 mensilmente fino alla fine del reclutamento.