Genetische und Telomer-Eigenschaften hochwertiger Weichteilsarkome

Ziele

Die Forscher planen eine zweijährige Pilot-Beobachtungsstudie, um:

• Identifizieren und quantifizieren Sie zirkulierende zellfreie DNA (cfDNA) bei Weichteilsarkomen (STS)
• Untersuchen Sie Telomere Maintenance Mechanisms (TMM) in STSs.
• Verwenden Sie TMM-assoziierte genetische Mutationen, um aus dem Tumor stammende cfDNA in STS zum Zeitpunkt der Tumorresektion und während der gesamten Nachsorge zu identifizieren und zu quantifizieren
• Verfolgen Sie die oben genannten tumorabgeleiteten cfDNA-Merkmale über die Zeit und korrelieren Sie sie mit dem klinischen Ergebnis, um potenzielle STS-Biomarker zu identifizieren. Hypothesen Basierend auf Erkenntnissen bei anderen Krebsarten wird angenommen, dass Plasma-cfDNA in Fällen von STS nachweisbar sein wird. Angesichts der Schlüsselrolle, die die Aufrechterhaltung der Telomerlänge bei der Entwicklung von Krebszellen spielt, gehen die Forscher auch davon aus, dass TMM-assoziierte Mutationen in der von Tumoren stammenden cfDNA vorhanden sein werden, als stabile Marker für STS-Gewebe fungieren und daher in der Konzentration zunehmen, wenn ein lokales Rezidiv oder eine metastatische Erkrankung auftritt.

Von Tumoren abgeleitete cfDNA-Identifizierung In den Monaten 0–3 werden empfindliche Assays entwickelt, die auf bekannte tumorspezifische Mutationen abzielen. Anhand dieser retrospektiv entnommenen Gewebe werden die Forscher überprüfen, ob cfDNA im Plasma von Patienten mit STS nachgewiesen (und quantifiziert) werden kann.

Analyse von TMMs in STS-Gewebe In den Monaten 3 bis 12 werden Tumorproben von jeder prospektiv rekrutierten Probe analysiert, um festzustellen, welches TMM in STSs aktiviert ist. Die Telomerase- und ALT-Aktivität wird jeweils anhand veröffentlichter Labortechniken bewertet.

Quantifizierung und Charakterisierung von TMM-assoziierten Mutationen / von Tumoren abgeleiteter cfDNA. In den Monaten 10 bis 12 werden quantitative Polymerase-Kettenreaktions-basierte Tests entwickelt, um die TMM-assoziierten Mutationen zu identifizieren, die bei STS am häufigsten vorkommen. In den Monaten 12 bis 22 werden diese Tests verwendet, um diese TMM-assoziierten Mutationen (und damit auch die aus dem Tumor stammende cfDNA) in den Plasmaproben zu identifizieren und zu quantifizieren, die jedem potenziell rekrutierten Patienten zum Zeitpunkt der Operation und während der gesamten Nachuntersuchung entnommen werden.

Korrelation der cfDNA-Merkmale mit dem klinischen Ergebnis In den Monaten 22 bis 24 werden die cfDNA-Konzentration, die tumorabgeleitete cfDNA-Konzentration und die genetischen Eigenschaften beider mit dem klinischen Ergebnismaß, einschließlich lokalem Rezidiv, metastatischem Rezidiv und Tod, korreliert, um das Potenzial dieser Merkmale als zukünftige Biomarker zu bestimmen .

Patientenrekrutierung / Probenentnahme Die Patienten werden über den East Midlands Sarcoma Service rekrutiert. Bereits verfügbare Proben werden aus zwei Quellen gesammelt, um zu überprüfen, ob cfDNA in STS nachgewiesen werden kann: Zunächst werden 20 Patienten mit metastasierender Erkrankung um ihre Zustimmung zur retrospektiven Analyse ihres bereits nach histologischer Analyse archivierten Tumorgewebes gebeten. Von diesen Patienten wird auch eine Blutprobe zur Analyse entnommen. Zweitens wird jede bereits in der Nottingham Health Science Biobank (Nottingham City Hospital) gelagerte STS-Probe zusammen mit einer ebenfalls gelagerten begleitenden Plasmaprobe (15 zum Zeitpunkt des Schreibens) analysiert.

Für die verbleibende Analyse der Forscher zwischen den Monaten 0 und 22 werden Patienten mit nicht metastasiertem hochgradigem STS, die sich vor Ort einer geplanten Resektion unterziehen, zur Teilnahme angesprochen. Zahlen aus dem Jahr 2013 deuten darauf hin, dass über 100 Patienten für die Aufnahme in Frage kommen. Tumorgewebe, Blut sowie nicht betroffene Muskeln und Speichel (2 Kontroll-DNA-Quellen) werden zum Zeitpunkt der Resektion gesammelt. Bis zum Ende der Rekrutierung werden alle drei Monate wiederholt Blutproben entnommen.