高级别软组织肉瘤的遗传和端粒特征

宗旨

研究人员计划进行一项为期 2 年的试点观察研究，以：

• 在软组织肉瘤 (STS) 病例中识别和量化循环细胞游离 DNA (cfDNA)
• 研究 STS 中的端粒维持机制 (TMM)。
• 使用 TMM 相关基因突变在肿瘤切除时和整个随访过程中识别和量化 STS 中肿瘤衍生的 cfDNA
• 随着时间的推移跟踪上述肿瘤衍生的 cfDNA 特征，并与临床结果相关联，以确定潜在的 STS 生物标志物 假设 基于其他癌症的发现，假设在 STS 病例中可检测到血浆 cfDNA。 鉴于端粒长度维持在癌细胞发展中的关键作用，研究人员还假设 TMM 相关突变将存在于肿瘤衍生的 cfDNA 中，作为 STS 组织的稳定标志物，因此随着局部复发或转移性疾病的发生浓度增加。

肿瘤衍生的 cfDNA 鉴定 在 0-3 个月内，将开发针对已知肿瘤特异性突变的灵敏检测。 在回顾性收集的组织上使用这些，研究人员将验证是否可以在 STS 患者的血浆中检测（和量化）cfDNA。

STS 组织中 TMM 的分析 在 3-12 个月的时间里，来自每个预期招募样本的肿瘤样本将被分析以确定哪个 TMM 在 STS 中被激活。 端粒酶和 ALT 活性将分别通过已公布的实验室技术进行评估。

TMM 相关突变/肿瘤衍生 cfDNA 的定量和表征 在 10-12 个月内，将开发基于定量聚合酶链反应的测定法，以鉴定在 STS 中发现的最普遍的 TMM 相关突变。 在第 12 至 22 个月，这些检测将用于识别和量化血浆样本中的这些 TMM 相关突变（以及肿瘤衍生的 cfDNA），这些样本是在手术时和整个随访过程中从每位预期招募的患者身上采集的。

cfDNA 特征与临床结果的相关性 在 22-24 个月内，cfDNA 浓度、肿瘤来源的 cfDNA 浓度和两者的遗传特征将与临床结果指标相关联，包括局部复发、转移复发和死亡，以确定这些特征作为未来生物标志物的潜力.

患者招募/样本采集 患者将通过东米德兰兹肉瘤服务中心招募。 将从 2 个来源收集已经可用的样本，以验证是否可以在 STS 中检测到 cfDNA：首先，将要求 20 名转移性疾病患者同意对组织学分析后已存档的肿瘤组织进行回顾性分析。 还将从这些患者身上采集一份血样进行分析。 其次，将对已存储在诺丁汉健康科学生物库（诺丁汉市医院）中的每个 STS 样本以及随附的血浆样本（在撰写本文时为 15 个）进行分析。

对于在 0-22 个月之间进行计划性切除术的非转移性高级别 STS 患者的剩余分析，将联系他们参与。 2013 年的数据表明将有超过 100 名患者符合入选条件。 肿瘤组织、血液和未受影响的肌肉和唾液（对照 DNA 的 2 个来源）将在切除时收集。 将每 3 个月收集一次重复血样，直至招募结束。