Biomarqueurs des maladies graves aiguës chez les enfants (BASIC)

Il s'agit d'une étude de cohorte prospective impliquant le recueil de données cliniques et d'échantillons biologiques. Aucune intervention ne sera effectuée sur les patients.

Prélèvement d'échantillons Des échantillons de sang et d'urine seront prélevés à deux moments. Des prélèvements de selles et de gorge seront également collectés si possible.

Moment 1 : Lors de la stabilisation par l'équipe CATS (premier contact avec une équipe de soins intensifs) L'équipe CATS prélèvera des échantillons lors des prélèvements de routine, priorisés dans l'ordre suivant : ADN (2 ml) ; ARN (2 ml); Sérum (2 ml); Plasma (2 ml) et Urine (10 ml).

Délai 2 : Dans les 24 à 48 heures suivant l'admission à l'USIP L'équipe de recherche de l'USIP participante prélèvera des échantillons lors d'un échantillonnage de routine, classés par ordre de priorité dans l'ordre suivant : ADN (2 ml) ; ARN (2 ml); Sérum (2 ml); Plasma (2 ml) et Urine (10 ml). De plus, des échantillons de selles et de gorge seront prélevés à l'USIP.

Chez les nourrissons de moins de 10 kg, nous limiterons le volume sanguin total prélevé à chaque instant à 0,8 ml/kg de poids corporel, conformément aux directives du MCRN sur les essais cliniques, 25 juillet 2008.

De plus, des échantillons fécaux seront prélevés lors de l'admission à l'USIP (jour 1) et 24 à 48 heures après l'admission à l'USIP. Si les matières fécales ne sont pas disponibles, un écouvillon anal sera prélevé pour analyse microbiologique. SCFA sera mesuré sur le premier échantillon fécal disponible.

Transport, traitement et stockage des échantillons Les échantillons seront transportés par l'équipe CATS vers les USIP d'admission dans des glacières (4°C). Le traitement et le stockage des échantillons auront lieu à l'hôpital où le patient est admis. Le traitement comprendra l'anonymisation de l'échantillon en générant un numéro d'étude unique, qui sera utilisé pour toutes les références aux échantillons par la suite.

Collecte des données cliniques Un formulaire de rapport de cas standardisé et un manuel de collecte des données avec des définitions et des règles seront produits. Les données seront recueillies par le personnel de recherche de chaque unité. Les données cliniques couvriront les étapes clés du parcours du patient - référence et transport en réanimation, parcours et résultat en USIP. Nous effectuerons un phénotypage clinique détaillé du patient, y compris la raison de la référence/admission à l'USIP (infection, traumatisme, neurologique, cardiaque, respiratoire et autre), la gravité de la maladie (score PIM-2), la gravité de la défaillance d'organe (PELOD) et le résultat à la sortie de l'USIP (décès, invalidité grave). Reconnaissant que le résultat à court terme à la sortie de l'USIP peut ne pas être le résultat le plus significatif pour les parents/tuteurs, ou fournir une image précise des résultats à long terme chez les enfants, nous demanderons également le consentement des parents/tuteurs pour être contacté 1 an après l'USIP l'admission à remplir de courts questionnaires pour évaluer l'état fonctionnel et la qualité de vie de l'enfant. Les questionnaires seront administrés soit par téléphone, par courriel ou par Internet, selon la préférence des parents.

Dans la mesure du possible, afin d'éviter la duplication des efforts, les données cliniques de la récupération du CATS et de l'admission à l'USIP seront obtenues par liaison électronique à partir de l'audit clinique national des soins intensifs pédiatriques (PICAnet, Université de Leeds et Leicester). Le couplage des données sera effectué à l'aide du numéro d'extraction CATS, à la fin de la période d'étude. La collecte de ces données suivra une procédure standard - tout transfert de données (demandes de données et retour de l'ensemble de données complet) sera effectué en toute sécurité (avec cryptage complet).

Analyse des données Dans un premier temps, chaque type d'information, c'est-à-dire génétique, transcriptomique, protéomique, épigénétique, clinique sera analysé séparément pour identifier les associations et corrélations dans un premier temps. Les modèles de comportement et d'association différentiels seront dérivés de diverses analyses statistiques et bioinformatiques, à la fois univariées et multivariées, comme décrit ci-dessus. Dans un deuxième temps, les informations seront combinées à travers les types de données dans des modèles prédictifs. Une approche de biologie des systèmes sera employée dans laquelle des réseaux de modules génétiques, transcriptomiques, protéomiques et épigénétiques co-régulés seront construits dans les cohortes de cas et de contrôle. Les connexions réseau qui seront différentes entre les cas et les témoins seront identifiées comme des "prédicteurs" du résultat.

La modélisation graphique sera utilisée pour visualiser ces réseaux complexes. Une analyse statistique approfondie sera nécessaire pour identifier les connexions les plus influentes qui, une fois supprimées, auraient le plus grand impact sur la topologie du réseau. Les modèles seront affinés, réévalués, validés et reproduits dans les différentes cohortes de maladies jusqu'à ce que la meilleure classification possible hors échantillon soit obtenue. L'expertise du groupe mathématique et statistique fournira la capacité de relier les multiples couches d'informations biologiques de l'ADN au phénotype dans une approche de biologie des systèmes en réseau.

Taille de l'échantillon Aucun calcul formel de la taille de l'échantillon n'est possible, mais nous recruterons un nombre minimum de patients dans chaque groupe d'intérêt. Notre objectif est de recruter un nombre adéquat de patients avec différentes raisons d'admission en soins intensifs dans l'étude (50 à 80 patients par groupe d'intérêt).

Durée de l'étude Le recrutement des patients se déroulera sur une période de 24 mois, avec un délai de 6 mois pour la formation du personnel et un délai de 6 mois pour le suivi des patients et la constitution des bases de données.

Recrutement des patients Les patients éligibles seront recrutés pour l'étude pendant le transport par le personnel médical et infirmier de l'équipe de transport en soins intensifs CATS.

Procédure de consentement Nous demanderons le consentement éclairé écrit différé des parents/tuteurs une fois que l'état de leur enfant se sera stabilisé, généralement dans les 24 à 48 heures suivant l'admission à l'USIP. Le processus de consentement sera appuyé par des feuillets d'information destinés aux patients. Il existe plusieurs précédents pour cette approche dans la recherche d'urgence, y compris en soins intensifs pédiatriques. La prise en charge du consentement différé dans les situations d'urgence mettant la vie en danger est également fournie par le dernier règlement de l'UE sur les essais cliniques (2013).

Les principales raisons de solliciter un consentement différé dans cette étude sont :

1. Clinique : Le transport d'urgence d'enfants en soins intensifs représente une situation d'urgence où un traitement vital ne peut être retardé et où le transport vers une USIP doit être entrepris rapidement. De plus, les parents/tuteurs peuvent ne pas être présents au moment de la stabilisation pour discuter du consentement.
2. Pratique : Prendre un membre du personnel supplémentaire pour le transport uniquement pour le consentement à la recherche n'est pas possible en raison de l'espace limité dans l'ambulance. La nature 24 heures sur 24, 7 jours sur 7 du service CATS et le fait que plusieurs transports se produisent simultanément rendent également impossible la présence d'un personnel de recherche dédié.
3. Méthodologique : les difficultés à obtenir un consentement éclairé complet peuvent entraîner l'introduction d'un biais de sélection. De plus, si les échantillons d'étude ne sont pas prélevés à un stade précoce de la maladie grave, avant que les traitements (tels que les fluides ou les inotropes) ne soient initiés, la dérivation de biomarqueurs robustes de la maladie grave peut être erronée. Bien que les questions méthodologiques ne puissent fournir un argument pour inclure des données lorsque les sujets de la recherche refusent expressément leur consentement, cela constitue un argument éthiquement valable pour inclure des échantillons ou des données collectées avant que le consentement n'ait été recueilli, et lorsqu'un tel refus explicite de consentement n'existe pas.
4. Éthique : En raison des difficultés à obtenir un consentement éclairé en situation d'urgence, les patients les plus malades sont souvent soumis à une pratique médicale anecdotique. Il peut être contraire à l'éthique de refuser aux enfants malades les avantages de nouvelles recherches et stratégies thérapeutiques basées sur la compréhension scientifique la plus solide des maladies graves, ce que notre étude vise à faire progresser.

Si les parents/tuteurs ne souhaitent pas donner leur consentement ou sont incapables de le faire, ou si le personnel est incapable d'entrer en contact avec les parents/tuteurs, les échantillons seront jetés et aucune donnée clinique ne sera recueillie.