Lasten akuutin vakavan sairauden biomarkkerit (BASIC)

Tämä on prospektiivinen kohorttitutkimus, joka sisältää kliinisten tietojen ja biologisten näytteiden keräämisen. Potilaille ei tehdä interventioita.

Näytteenotto Veri- ja virtsanäytteet otetaan kahdessa vaiheessa. Myös uloste- ja kurkkunäppäimet kerätään mahdollisuuksien mukaan.

Aikapiste 1: CATS-tiimin stabiloinnin aikana (ensimmäinen kosketus tehohoitotiimiin) CATS-tiimi kerää näytteitä rutiininäytteenoton aikana, priorisoimalla seuraavassa järjestyksessä: DNA (2 ml); RNA (2 ml); seerumi (2 ml); Plasma (2 ml) ja virtsa (10 ml).

Aikapiste 2: 24-48 tunnin sisällä PICU:n saapumisesta Osallistuvan PICU:n tutkimusryhmä kerää näytteitä rutiininäytteenoton aikana, priorisoimalla seuraavassa järjestyksessä: DNA (2 ml); RNA (2 ml); seerumi (2 ml); Plasma (2 ml) ja virtsa (10 ml). Lisäksi PICU:ssa otetaan näytteitä ulosteesta ja kurkusta.

Alle 10 kg painavilla pikkulapsilla rajoitamme kullakin aikapisteellä kerätyn veren kokonaismäärän 0,8 ml:aan/kg ruumiinpainoa MCRN:n kliinisten tutkimusten ohjeiden mukaisesti, 25. heinäkuuta 2008.

Lisäksi ulostenäytteet otetaan PICU:lle saapumisen yhteydessä (päivä 1) ja 24-48 tuntia PICU:n saapumisen jälkeen. Jos ulostetta ei ole saatavilla, otetaan peräaukon pyyhkäisy mikrobiologista analyysiä varten. SCFA mitataan ensimmäisestä saatavilla olevasta ulostenäytteestä.

Näytteiden kuljetus, käsittely ja varastointi CATS-tiimi kuljettaa näytteet vastaanottaville PICU-yksiköille kylmälaatikoissa (4°C). Näytteiden käsittely ja varastointi tapahtuu sairaalassa, johon potilas otetaan. Käsittely sisältää näytteen anonymisoinnin luomalla yksilöllisen tutkimusnumeron, jota käytetään kaikkiin näytteisiin viitattaessa myöhemmin.

Kliinisen tiedon keruu Tuotetaan standardoitu tapausraporttilomake ja tiedonkeruukäsikirja määritelmillä ja säännöillä. Tiedot keräävät kunkin yksikön tutkimushenkilöstö. Kliiniset tiedot kattavat potilaan polun avainvaiheet - tehohoidon lähetteen ja kuljetuksen, PICU-kulun ja lopputuloksen. Teemme potilaan yksityiskohtaisen kliinisen fenotyypin määrityksen, mukaan lukien PICU-lähetteen/pääsyn syy (infektio, trauma, neurologinen, sydän-, hengitystie- ja muut), sairauden vakavuus (PIM-2-pistemäärä), elimen vajaatoiminnan vakavuus (PELOD) ja lopputulos. kotiuttamisen yhteydessä PICU:sta (kuolema, vakava vamma). Koska PICU:n kotiutuksen lyhytaikainen tulos ei välttämättä ole mielekkäin tulos vanhemmille/hoitajille tai se ei anna tarkkaa kuvaa pitkän aikavälin tuloksista lapsilla, pyydämme myös vanhemmilta/hoitajilta suostumuksen, että heihin otetaan yhteyttä vuoden kuluttua PICU:sta. pääsy lyhyisiin kyselyihin lapsen toimintakyvyn ja elämänlaadun arvioimiseksi. Kyselyt vastataan joko puhelimitse, sähköpostitse tai web-pohjaisesti vanhempien toiveiden mukaan.

Päällekkäisten ponnistelujen välttämiseksi kliiniset tiedot CATS-hausta ja PICU-pääsystä hankitaan sähköisen linkin kautta lasten tehohoidon kansallisesta kliinisestä auditoinnista (PICANet, Leedsin yliopisto ja Leicester). Tietojen linkitys suoritetaan CATS-hakunumerolla tutkimusjakson lopussa. Näiden tietojen kerääminen tapahtuu vakiomenettelyn mukaisesti - kaikki tiedonsiirrot (tietopyynnöt ja täyden tietojoukon palauttaminen) suoritetaan turvallisesti (täydellä salauksella).

Tietojen analysointi Aluksi jokainen informaatiotyyppi, eli geneettinen, transkriptominen, proteominen, epigeneettinen ja kliininen, analysoidaan erikseen assosiaatioiden ja korrelaatioiden tunnistamiseksi ensimmäisessä vaiheessa. Differentiaaliset käyttäytymis- ja assosiaatiomallit johdetaan erilaisilla tilastollisilla ja bioinformaattisilla analyyseillä, sekä yksi- että monimuuttuja-analyyseillä, kuten edellä on kuvattu. Toisessa vaiheessa tiedot yhdistetään eri tietotyypeistä ennustaviksi malleiksi. Järjestelmäbiologian lähestymistapaa käytetään, jossa sekä tapaus- että kontrollikohorteissa rakennetaan yhteissäädeltyjen geneettisten, transkriptomisten, proteomisten ja epigeneettisten moduulien verkostoja. Verkkoyhteydet, jotka ovat erilaisia ​​tapausten ja kontrollien välillä, tunnistetaan lopputuloksen "ennusteiksi".

Graafista mallintamista käytetään näiden monimutkaisten verkkojen visualisointiin. Vaikuttavimpien yhteyksien tunnistamiseksi, jotka poistamisen jälkeen niillä olisi suurin vaikutus verkon topologiaan, tarvitaan raskasta tilastollista analyysiä. Malleja jalostetaan, arvioidaan uudelleen, validoidaan ja toistetaan eri tautiryhmissä, kunnes paras mahdollinen näyteluokitus saavutetaan. Matemaattisen ja tilastollisen ryhmän asiantuntemus antaa kyvyn linkittää useita biologisen tiedon kerroksia DNA:sta fenotyyppiin verkkosysteemibiologian lähestymistapaan.

Otoskoko Ei virallisia otoskoon laskelmia ole mahdollista, mutta rekrytoimme vähimmäismäärän potilaita kustakin kiinnostavasta ryhmästä. Pyrimme saamaan tutkimukseen riittävän määrän potilaita eri syistä tehohoitoon (50-80 potilasta kohderyhmää kohden).

Tutkimuksen kesto Potilaiden rekrytointi tapahtuu 24 kuukauden aikana, jolloin henkilöstön koulutukseen on varattu kuusi kuukautta ja potilaiden seurantaan ja tietokantojen täydentämiseen kuusi kuukautta.

Potilaiden rekrytointi Kelpoiset potilaat rekrytoidaan tutkimukseen kuljetuksen aikana CATS-tehohoidon kuljetustiimin lääkintä- ja hoitohenkilökunnan toimesta.

Suostumusmenettely Pyydämme vanhemmilta/huoltajilta lykättyä kirjallista suostumusta, kun lapsen tila on vakiintunut, yleensä 24–48 tunnin kuluessa PICU:n saapumisesta. Suostumusprosessia tukevat potilastiedotteet. Tälle lähestymistavalle on useita ennakkotapauksia hätätutkimuksessa, myös lasten tehohoidossa. Tukea lykättyyn suostumukseen kiireellisissä henkeä uhkaavissa tilanteissa tarjotaan myös EU:n viimeisimmän kliinisiä tutkimuksia koskevan asetuksen (2013) kautta.

Tärkeimmät syyt lykätyn suostumuksen hakemiseen tässä tutkimuksessa ovat:

1. Kliininen: Lasten ensihoidon tehohoitokuljetukset ovat kiireellinen tilanne, jossa hengenpelastushoitoa ei voida viivyttää ja kuljetus PICU:lle on toteutettava nopeasti. Lisäksi vanhemmat/huoltajat eivät välttämättä ole paikalla vakauttamishetkellä keskustelemassa suostumuksesta.
2. Käytännöllinen: Lisähenkilöstön ottaminen kuljetukseen pelkästään tutkimuslupaa varten ei ole mahdollista ambulanssin rajallisen tilan vuoksi. CATS-palvelun 24/7-luonne ja useiden kuljetusten samanaikainen esiintyminen tekee myös omistautuneen tutkimushenkilöstön pitämisen epäkäytännöllistä.
3. Metodologiset: Vaikeudet saada täysi tietoinen suostumus voivat johtaa valintaharhaan. Lisäksi, jos tutkimusnäytteitä ei oteta kriittisen sairauden varhaisessa vaiheessa, ennen hoitojen (kuten nesteiden tai inotrooppisten) aloittamista, kriittisen sairauden vahvojen biomarkkereiden johtaminen voi olla puutteellista. Vaikka metodologiset seikat eivät voi perustella tietojen sisällyttämistä, kun tutkittavat nimenomaisesti kieltävät suostumuksensa, se antaa eettisesti pätevän perusteen ottaa mukaan näytteet tai tiedot, jotka on kerätty ennen suostumuksen antamista, ja jos tällaista nimenomaista suostumuksen epäämistä ei ole olemassa.
4. Eettinen: Tietoisen suostumuksen saaminen hätätilanteessa on vaikeaa, joten sairaimmat potilaat joutuvat usein anekdoottisten lääketieteellisten käytäntöjen kohteeksi. Saattaa olla epäeettistä kieltää sairailta lapsilta uusien tutkimusten ja terapeuttisten strategioiden hyödyt, jotka perustuvat vakaimpaan tieteelliseen ymmärrykseen kriittisistä sairauksista, mitä tutkimuksemme pyrkii edistämään.

Jos vanhemmat/huoltajat eivät halua suostua tai eivät voi antaa suostumusta tai henkilökunta ei saa yhteyttä vanhempiin/huoltajiin, näytteet hylätään eikä kliinisiä tietoja kerätä.