Биомаркеры острого тяжелого заболевания у детей (BASIC)

Это проспективное когортное исследование, включающее сбор клинических данных и биологических образцов. Никаких вмешательств на пациентах производиться не будет.

Сбор проб Образцы крови и мочи будут собираться в двух временных точках. Если возможно, также будут взяты мазки кала и горла.

Момент времени 1: Во время стабилизации командой CATS (первый контакт с бригадой интенсивной терапии) Команда CATS будет собирать образцы во время обычного отбора проб в следующем порядке: ДНК (2 мл); РНК (2 мл); Сыворотка (2 мл); Плазма (2 мл) и моча (10 мл).

Момент времени 2: В течение 24–48 часов после поступления в ОРИТ. Исследовательская группа в участвующем ОРИТ будет собирать образцы во время обычного отбора проб в следующем порядке: ДНК (2 мл); РНК (2 мл); Сыворотка (2 мл); Плазма (2 мл) и моча (10 мл). Кроме того, в отделении интенсивной терапии будут взяты образцы кала и мазка из горла.

У младенцев с массой тела менее 10 кг мы ограничим общий объем крови, собираемый в каждый момент времени, до 0,8 мл/кг массы тела в соответствии с Руководством по клиническим испытаниям MCRN от 25 июля 2008 г.

Кроме того, образцы фекалий будут собираться при поступлении в PICU (день 1) и через 24-48 часов после поступления в PICU. Если фекалии недоступны, будет взят анальный мазок для микробиологического анализа. КЖК будут измеряться в первом доступном образце фекалий.

Транспортировка, обработка и хранение проб Пробы будут транспортироваться командой CATS в приемные отделения интенсивной терапии в холодильниках (4°C). Обработка и хранение образцов будет происходить в больнице, куда поступил пациент. Обработка будет включать анонимизацию образца путем создания уникального номера исследования, который впоследствии будет использоваться для всех ссылок на образцы.

Сбор клинических данных Будет подготовлена ​​стандартизированная форма отчета о болезни и руководство по сбору данных с определениями и правилами. Данные будут собираться исследовательским персоналом в каждом подразделении. Клинические данные будут охватывать ключевые этапы пути пациента — направление в отделение интенсивной терапии и транспортировку, курс в отделении интенсивной терапии и исход. Мы проведем подробное клиническое фенотипирование пациента, включая причину направления/госпитализации в отделение интенсивной терапии (инфекция, травма, неврологическая, сердечная, респираторная и др.), тяжесть заболевания (оценка PIM-2), тяжесть органной недостаточности (PELOD) и исход при выписке из ОРИТ (смерть, тяжелая инвалидность). Признавая, что краткосрочный исход при выписке из ОРИТ может быть не самым значимым исходом для родителей/опекунов или давать точную картину долгосрочного исхода у детей, мы также будем запрашивать согласие родителей/опекунов на то, чтобы с ними связались через 1 год после ОРИТ. допуск к заполнению кратких анкет для оценки функционального состояния и качества жизни ребенка. Анкеты будут проводиться либо по телефону, либо по электронной почте, либо через Интернет, в зависимости от предпочтений родителей.

По возможности, во избежание дублирования усилий, клинические данные из поиска CATS и поступления в отделение интенсивной терапии будут получены посредством электронной связи от национального клинического аудита педиатрической интенсивной терапии (PICANet, Университет Лидса и Лестера). Связывание данных будет осуществляться с использованием номера поиска CATS в конце периода исследования. Сбор этих данных будет проходить по стандартной процедуре — любая передача данных (запросы данных и возврат полного набора данных) будет выполняться безопасно (с полным шифрованием).

Анализ данных Первоначально каждый тип информации, то есть генетическая, транскриптомная, протеомная, эпигенетическая, клиническая, будет анализироваться отдельно для выявления ассоциаций и корреляций на первом этапе. Дифференциальное поведение и паттерны ассоциации будут получены с помощью различных статистических и биоинформационных анализов, как одномерных, так и многомерных, как описано выше. На втором этапе информация будет объединяться по типам данных в прогностические модели. Будет использован подход системной биологии, в котором будут построены сети совместно регулируемых генетических, транскриптомных, протеомных и эпигенетических модулей как в контрольной, так и в контрольной когортах. Сетевые соединения, которые будут различаться между случаями и средствами контроля, будут идентифицированы как «предикторы» результата.

Графическое моделирование будет использоваться для визуализации этих сложных сетей. Потребуется тщательный статистический анализ для выявления наиболее влиятельных соединений, удаление которых окажет наибольшее влияние на топологию сети. Модели будут уточняться, переоцениваться, проверяться и воспроизводиться для различных групп заболеваний до тех пор, пока не будет достигнута наилучшая возможная классификация вне выборки. Опыт математической и статистической группы даст возможность связать несколько уровней биологической информации от ДНК до фенотипа в рамках подхода сетевой системной биологии.

Размер выборки Формальные расчеты размера выборки невозможны, но мы будем набирать минимальное количество пациентов в каждой представляющей интерес группе. Мы стремимся набрать в исследование достаточное количество пациентов с различными причинами для поступления в реанимацию (50-80 пациентов на интересующую группу).

Продолжительность исследования Набор пациентов будет осуществляться в течение 24 месяцев, с 6-месячным начальным временем для обучения персонала и 6-месячным начальным временем для последующего наблюдения за пациентами и заполнения баз данных.

Набор пациентов Подходящие пациенты будут набраны для участия в исследовании во время транспортировки медицинским и сестринским персоналом из транспортной бригады интенсивной терапии CATS.

Процедура получения согласия Мы будем запрашивать отложенное информированное согласие родителей/опекунов, как только состояние их ребенка стабилизируется, обычно в течение 24–48 часов после поступления в отделение интенсивной терапии. Процесс получения согласия будет сопровождаться информационными листовками для пациентов. Есть несколько прецедентов такого подхода в исследованиях неотложной помощи, в том числе в педиатрической интенсивной терапии. Поддержка отложенного согласия в неотложных угрожающих жизни ситуациях также обеспечивается последним Регламентом ЕС о клинических испытаниях (2013 г.).

Основными причинами для получения отложенного согласия в этом исследовании являются:

1. Клинические: неотложная транспортировка детей в отделение интенсивной терапии представляет собой неотложную ситуацию, когда жизненно важное лечение нельзя откладывать и необходимо быстро доставить ребенка в отделение интенсивной терапии. Кроме того, родители/опекуны могут не присутствовать во время стабилизации для обсуждения согласия.
2. Практичность: Взять дополнительного сотрудника для перевозки исключительно для согласия на исследование невозможно из-за ограниченного пространства в машине скорой помощи. Круглосуточный характер услуги CATS и тот факт, что несколько транспортов происходят одновременно, также делают нецелесообразным наличие специального исследовательского персонала.
3. Методология: трудности с получением полного информированного согласия могут привести к систематической ошибке отбора. Кроме того, если образцы для исследования не берутся на ранней стадии критического заболевания, до начала лечения (например, жидкостей или инотропов), получение надежных биомаркеров критического заболевания может быть ошибочным. Хотя методологические вопросы не могут служить аргументом для включения данных, когда субъекты исследования прямо отказывают в согласии, они действительно являются этически обоснованными аргументами для включения образцов или данных, собранных до того, как согласие было получено, и когда такого явного отказа в согласии не существует.
4. Этические: Из-за трудностей получения информированного согласия в экстренной ситуации самые тяжелые пациенты часто подвергаются анекдотической медицинской практике. Отказывать больным детям в преимуществах новых исследований и терапевтических стратегий, основанных на наиболее надежном научном понимании критических заболеваний, может быть неэтично, и именно на это направлено наше исследование.

Если родители/опекуны не желают давать согласие или не могут его дать, или персонал не может связаться с родителями/опекунами, образцы будут утилизированы, а клинические данные собраны не будут.