Gyermekek akut súlyos betegségeinek biomarkerei (BASIC)

Ez egy prospektív kohorsz vizsgálat, amely klinikai adatok és biológiai minták gyűjtését foglalja magában. A betegeken semmilyen beavatkozást nem végeznek.

Mintavétel A vér- és vizeletmintákat két időpontban veszik. Lehetőség szerint széklet- és toroktamponokat is gyűjtenek.

1. időpont: A CATS-csapat stabilizálása során (első érintkezés intenzív terápiás csoporttal) A CATS-csapat a rutin mintavétel során mintákat gyűjt, a következő sorrendben rangsorolva: DNS (2 ml); RNS (2 ml); Szérum (2 ml); Plazma (2 ml) és vizelet (10 ml).

2. időpont: A PICU felvételét követő 24-48 órán belül A résztvevő PICU kutatócsoportja a rutin mintavétel során mintákat gyűjt, a következő sorrendben rangsorolva: DNS (2 ml); RNS (2 ml); Szérum (2 ml); Plazma (2 ml) és vizelet (10 ml). Ezenkívül a PICU-n széklet- és toroktamponmintákat vesznek.

A 10 kg-nál kisebb súlyú csecsemőknél az egyes időpontokban gyűjtött teljes vérmennyiséget 0,8 ml/ttkg-ra korlátozzuk, összhangban az MCRN Clinical Trials Guidelines, 2008. július 25-i irányelveivel.

Ezenkívül székletmintákat vesznek a PICU-ba való belépéskor (1. nap) és 24-48 órával a PICU-ba való felvétel után. Ha a széklet nem áll rendelkezésre, anális tampont vesznek mikrobiológiai elemzés céljából. Az SCFA-t az első rendelkezésre álló székletmintán mérik.

A minták szállítása, feldolgozása és tárolása A mintákat a CATS csapata hűtődobozokban (4°C) szállítja a befogadó PICU-hoz. A minták feldolgozása és tárolása abban a kórházban történik, ahol a beteget felveszik. A feldolgozás magában foglalja a minta anonimizálását egy egyedi vizsgálati szám generálásával, amelyet a későbbiekben a mintákra való összes hivatkozáshoz használunk.

Klinikai adatgyűjtés Egy szabványos esetjelentési formanyomtatványt és adatgyűjtési kézikönyvet készítenek definíciókkal és szabályokkal. Az adatokat minden egység kutatói gyűjtik. A klinikai adatok lefedik a beteg útjának kulcsfontosságú szakaszait – az intenzív terápiás beutaló és szállítás, a PICU lefolyása és kimenetele. Elvégezzük a beteg részletes klinikai fenotípusát, beleértve a PICU beutalás/bevétel okát (fertőzés, trauma, neurológiai, szív-, légúti és egyéb), a betegség súlyosságát (PIM-2 pontszám), a szervi elégtelenség súlyosságát (PELOD) és az eredményt. a PICU-ból való elbocsátáskor (halál, súlyos rokkantság). Felismerve, hogy a PICU-elbocsátás rövid távú eredménye nem feltétlenül a legjelentősebb eredmény a szülők/gondozók számára, vagy nem ad pontos képet a gyermekek hosszú távú kimeneteléről, a szülők/gondozók beleegyezését is kérni fogjuk, hogy a PICU után 1 évvel kapcsolatba léphessenek velük. rövid kérdőívek kitöltése a gyermek funkcionális állapotának és életminőségének felmérésére. A kérdőíveket a szülők preferenciáitól függően telefonon, e-mailben vagy webes úton adjuk ki.

Ahol lehetséges, az erőfeszítések megkettőzésének elkerülése érdekében, a CATS-lekérdezésből és a PICU-bevételből származó klinikai adatokat a gyermek intenzív terápiás nemzeti klinikai auditjától (PICANet, University of Leeds and Leicester) elektronikus kapcsolat útján szerezzük be. Az adatok összekapcsolása a CATS lekérési szám használatával történik a vizsgálati időszak végén. Ezen adatok gyűjtése szabványos eljárás szerint történik - minden adatátvitel (adatigénylés és a teljes adatkészlet visszaküldése) biztonságosan (teljes titkosítással) történik.

Adatelemzés Kezdetben minden információtípust, azaz genetikai, transzkriptomikai, proteomikai, epigenetikai és klinikai információkat külön-külön elemzünk, hogy az első szakaszban azonosítsuk az asszociációkat és összefüggéseket. A differenciális viselkedési és asszociációs mintázatokat különféle statisztikai és bioinformatikai elemzésekkel lehet levezetni, mind egyváltozós, mind többváltozós, a fent leírtak szerint. A második szakaszban az információkat az adattípusok között prediktív modellekké egyesítik. Rendszerbiológiai megközelítést alkalmaznak, amelyben a társszabályozott genetikai, transzkriptomikus, proteomikai és epigenetikai modulok hálózatait építik fel mind az eset-, mind a kontrollcsoportokban. Az esetek és vezérlők között eltérő hálózati kapcsolatokat az eredmény előrejelzőjeként azonosítják.

Grafikus modellezést fognak használni az összetett hálózatok megjelenítésére. Komoly statisztikai elemzésekre lesz szükség a legbefolyásosabb kapcsolatok azonosításához, amelyek eltávolítása után a legnagyobb hatással lesznek a hálózati topológiára. A modelleket finomítják, újraértékelik, validálják és replikálják a különböző betegségcsoportokban, amíg el nem érik a lehető legjobb mintaosztályozást. A matematikai és statisztikai csoport szakértelme lehetővé teszi a biológiai információ több rétegének összekapcsolását a DNS-től a fenotípusig egy hálózati rendszerbiológiai megközelítésben.

Mintanagyság Formális mintanagyság-számításra nincs lehetőség, de minden érdeklődési csoportba minimális számú pácienst veszünk fel. Célunk, hogy megfelelő számú pácienst vonjunk be a vizsgálatba, akiknek különböző okai vannak az intenzív terápiás felvételnek (érdekcsoportonként 50-80 beteg).

A vizsgálat időtartama A betegek toborzása 24 hónapon keresztül történik, 6 hónapos átfutási idővel a személyzet képzésére és 6 hónapos átfutási idővel a betegek nyomon követésére és az adatbázisok kitöltésére.

Beteg toborzás A vizsgálatban részt vevő jogosult betegeket a CATS intenzív terápiás szállítócsapatának egészségügyi és ápolói személyzete veszi fel a szállítás során.

Hozzájárulási eljárás A szülők/gondviselők halasztott írásos beleegyezését kérjük, amint gyermekük állapota stabilizálódik, általában a PICU felvételét követő 24-48 órán belül. A hozzájárulási folyamatot betegtájékoztatók támogatják. Ennek a megközelítésnek számos precedense van a sürgősségi kutatásban, beleértve a gyermek intenzív ellátást is. A halasztott beleegyezés támogatását sürgős életveszélyes helyzetekben a legújabb EU-rendelet a klinikai vizsgálatokról (2013) is biztosítja.

A halasztott beleegyezés kérésének fő okai ebben a tanulmányban:

1. Klinikai: A gyermekek sürgősségi intenzív ellátása olyan sürgős helyzetet jelent, ahol az életmentő kezelést nem lehet elhalasztani, és a PICU-ba történő szállítást gyorsan kell elvégezni. Ezenkívül a szülők/gondviselők nem lehetnek jelen a stabilizálás időpontjában, hogy megvitassák a beleegyezésüket.
2. Gyakorlati szempont: A mentőautó szűkös helye miatt a szállításhoz további munkatárs felvétele pusztán kutatási hozzájárulás miatt nem kivitelezhető. A CATS szolgáltatás 24 órás jellege és az a tény, hogy egyszerre több szállítás is előfordul, szintén nem teszi lehetővé az elkötelezett kutatószemélyzet alkalmazását.
3. Módszertani: A teljes tájékozott beleegyezés megszerzésének nehézségei szelekciós torzítást eredményezhetnek. Ezenkívül, ha a vizsgálati mintákat nem veszik a kritikus betegség korai szakaszában, a kezelések (például folyadékok vagy inotrópok) megkezdése előtt, a kritikus betegség robusztus biomarkereinek származtatása hibás lehet. Módszertani kérdések ugyan nem szolgálhatnak érvként az adatok felvétele mellett, ha a kutatási alanyok kifejezetten megtagadják a beleegyezésüket, etikailag azonban indokolttá teszik a hozzájárulás felvétele előtt gyűjtött minták vagy adatok felvételét, és ha a hozzájárulás kifejezett megtagadása nem létezik.
4. Etikai: A sürgősségi helyzetben a tájékozott beleegyezés megszerzésének nehézségei miatt a legbetegebb betegek gyakran anekdotikus orvosi gyakorlatnak vannak kitéve. Lehet, hogy etikátlan dolog megtagadni a beteg gyerekektől a kritikus betegségek legmegbízhatóbb tudományos megértésen alapuló új kutatások és terápiás stratégiák előnyeit, és ez az, amit tanulmányunk előmozdítani kíván.

Ha a szülők/gondviselők nem akarnak hozzájárulni, vagy nem tudnak hozzájárulni, vagy a személyzet nem tud kapcsolatba lépni a szülőkkel/gondviselőkkel, a mintákat eldobjuk, és nem gyűjtünk klinikai adatokat.