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South-seq : Séquençage de l'acide désoxyribonucléique (ADN) pour les pouponnières néonatales du Sud

20 novembre 2024 mis à jour par: Maria Danila, MD, MSc, MSPH, University of Alabama at Birmingham

South-seq : séquençage de l'ADN pour les pouponnières néonatales du Sud

2 000 nourrissons présentant des signes évocateurs d'une maladie génétique et traités dans une unité néonatale de soins intensifs (USIN) dans laquelle les populations afro-américaines et rurales sont fortement représentées seront inscrits. Le séquençage du génome entier (WGS) sera utilisé pour identifier les variations pathogènes dans l'ADN de ces nourrissons. Les parties prenantes, y compris les parents, les cliniciens et les dirigeants communautaires, seront engagées pour développer du matériel pédagogique adapté à la culture et pour équiper les prestataires non génétiques afin de renvoyer les résultats du WGS. Les parents recevront ces documents via un portail Web, la passerelle génomique, et seront placés dans l'un des deux bras d'un essai randomisé pour comparer l'efficacité de la livraison de résultats WGS assistée par la technologie par des fournisseurs non génétiques par rapport à la livraison de résultats de génétique. conseillers.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Les obstacles à la mise en œuvre généralisée et systématique des soins cliniques basés sur le WGS existent à plusieurs niveaux. Les sondages auprès des cliniciens indiquent un malaise dans leur compréhension de la génomique et leur capacité à communiquer les résultats aux patients, ainsi que des inquiétudes quant au temps nécessaire pour le faire. Les généticiens médicaux et les conseillers en génétique sont concentrés de manière disproportionnée dans les grands centres universitaires, et leur nombre est insuffisant pour supporter le nombre de patients pouvant bénéficier du WGS. Cette limitation aura un effet disproportionné sur les patients des zones rurales et/ou médicalement mal desservies. Par exemple, tous les conseillers en génétique sauf un en Alabama sont basés à Birmingham ou à Huntsville (la seule exception étant à Mobile), ce qui signifie que les 2/3 du sud de l'État, y compris les principales zones rurales mal desservies, ont peu ou pas d'accès local. aux services de conseil génétique.

Ces obstacles sont particulièrement apparents dans les soins néonatals. Pour les parents de nouveau-nés malades, leurs premières interactions avec le système de santé ont lieu à l'USIN. La formation en néonatologie met traditionnellement l'accent sur les soins intensifs et peut négliger la communication, une étude rapportant que 93 % des boursiers ont déclaré que leur formation dans ce domaine devrait être améliorée. Il y a un manque particulier de formation en médecine néonatale génomique, avec peu de conférences didactiques, de séances de jeux de rôle, d'expériences simulées ou de formation pratique dans des scénarios cliniquement pertinents. Lorsque les nourrissons reçoivent un diagnostic d'anomalies congénitales in utero, la consultation prénatale avec des sous-spécialistes peut prêter à confusion pour les maladies génétiques avec un éventail de causes et de résultats, et des informations incohérentes fournies par différents prestataires, par exemple, le néonatologiste et le chirurgien pédiatrique.

Une prémisse centrale sous-jacente à la proposition est que les prestataires de soins de santé non génétiques, y compris ceux en dehors des centres médicaux universitaires, peuvent être habilités à utiliser les tests WGS dans leurs pratiques. Il existe de nombreux précédents pour la mise en œuvre de technologies complexes dans les soins primaires : les pédiatres, les internistes et les médecins de famille utilisent régulièrement des technologies d'imagerie avancées sans une compréhension approfondie de la technologie sous-jacente. Apporter la médecine génomique compatible WGS aux prestataires de soins de santé communautaires nécessite, au moins, des critères simples pour identifier les patients susceptibles d'en bénéficier, un processus de consentement convivial, des rapports de laboratoire clairement rédigés, des supports d'éducation des patients facilement accessibles, un accès immédiat à l'assistance médicale des généticiens et des conseillers en génétique, et une formation de base sur la manière dont le WGS peut être appliqué de manière routinière. Les chercheurs de l'étude cherchent à démontrer que, si ces facteurs sont fournis, le WGS peut être effectué et les résultats pertinents renvoyés par les prestataires de soins néonatals, et que l'expérience du patient sera au moins égale à celle obtenue avec l'approche traditionnelle du face à face. être conseillé par un généticien ou un conseiller en génétique.

Afin de comparer la fourniture de résultats WGS assistée par la technologie par des prestataires de soins de santé formés au conseil génétique formel par des conseillers en génétique (norme de soins), une série d'enquêtes a été développée et sera complétée en ligne à l'aide de la plateforme/site Web Genome Gateway développé pour cet essai . Les points temporels de l'enquête sont l'inscription (prélèvement d'échantillons chez le nourrisson/le candidat), le retour des résultats (ROR) (environ 2 à 3 mois après l'inscription lorsque les résultats du WGS sont disponibles), le counseling 1 mois après le ROR, 4 mois après -Counseling ROR et 4,5 mois de counseling post-ROR.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Réel)

477

Phase

  • N'est pas applicable

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

    • Alabama
      • Birmingham, Alabama, États-Unis, 35294
        • University of Alabama at Birmingham/Children's of Alabama
    • Louisiana
      • Baton Rouge, Louisiana, États-Unis, 70895
        • Woman's Hospital
    • Mississippi
      • Jackson, Mississippi, États-Unis, 39216
        • University of Mississippi Medical Center

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Oui

La description

Critère d'intégration:

  • Parents/soignant/tuteur d'un nouveau-né (probant) qui répond aux critères d'inclusion dans l'objectif spécifique 1
  • Le parent ou le soignant/tuteur est disposé à participer et à répondre aux sondages

Critère d'exclusion:

  • Proband a des résultats secondaires de WGS
  • Le parent ou le tuteur n'est pas disponible pour participer et répondre aux sondages
  • Le parent ou la personne qui s'occupe de l'enfant a besoin de services d'interprétation linguistique/de documents traduits

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Recherche sur les services de santé
  • Répartition: Randomisé
  • Modèle interventionnel: Affectation parallèle
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Comparateur placebo: Conseiller en génétique
Norme de soins. Les parents/soignants des nouveau-nés inscrits à SouthSeq recevront des conseils sur les résultats du séquençage du génome entier (WGS) de leur enfant de la part des conseillers en génétique
Norme de soins
Expérimental: Prestataire de soins de santé formé
Les prestataires de soins de santé (par exemple, les néonatologistes et les infirmières praticiennes en néonatologie) recevront une formation pour fournir avec compétence les résultats du séquençage du génome entier aux parents/soignants des nouveau-nés inscrits à SouthSeq
Néonatologistes et infirmières praticiennes en néonatologie qui reçoivent une formation pour fournir des résultats de séquençage du génome entier

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Évaluer l'autonomisation parentale à l'aide de l'échelle de résultats du conseil génétique (GCOS)
Délai: 3 mois après le prélèvement des échantillons
Collecté après retour des résultats du séquençage du génome entier à l'aide du GCOS. Le GCOS est une échelle de résultats de conseil en 24 éléments permettant d'évaluer l'autonomisation parentale à travers des questions portant sur cinq concepts : contrôle décisionnel, contrôle cognitif, contrôle comportemental, régulation émotionnelle et orientation future. Chacun des 24 items reçoit une réponse sur une échelle de type Likert en 7 points : Fortement en désaccord (1), En désaccord (2), Légèrement en désaccord (3), Ni d'accord ni en désaccord (4), Plutôt d'accord (5), D'accord (6) et tout à fait d’accord (7). Fourchette de scores possibles pour ceux qui terminent tous les éléments : 24-168. Des scores plus élevés sont meilleurs.
3 mois après le prélèvement des échantillons

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Évaluer les incertitudes parentales à l'aide des perceptions parentales des incertitudes du séquençage génomique (PUGS)
Délai: 3 mois après le prélèvement des échantillons
Collecté après retour des résultats du séquençage du génome entier à l'aide du PUGS. PUGS est une échelle de 8 éléments permettant d'évaluer les incertitudes dans trois domaines : clinique, affectif et évaluatif. Chacune des questions reçoit une réponse sur une échelle de type Likert en 5 points : Très incertain (1) à très certain (5). Fourchette de scores possibles pour ceux qui terminent tous les éléments : 8-40. Des scores plus élevés représentent plus de certitude.
3 mois après le prélèvement des échantillons
Évaluer l'utilité personnelle à l'aide de l'échelle d'utilité personnelle parentale (PrU)
Délai: 3 mois après le prélèvement des échantillons
Collecté après retour des résultats du séquençage du génome entier à l'aide du PrU. Cette mesure est composée de 17 items répondus sur une échelle de type Likert en 7 points : Pas du tout utile (1), Un peu utile (2), Plutôt utile (3), Neutre (4), Utile (5), Très utile (6) et Extrêmement utile (7). Fourchette de scores possibles pour ceux qui terminent tous les éléments : 17-119. Des scores plus élevés sont meilleurs.
3 mois après le prélèvement des échantillons

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

15 avril 2019

Achèvement primaire (Réel)

1 mai 2022

Achèvement de l'étude (Réel)

31 décembre 2023

Dates d'inscription aux études

Première soumission

13 février 2019

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

13 février 2019

Première publication (Réel)

15 février 2019

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

13 décembre 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

20 novembre 2024

Dernière vérification

1 novembre 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Autres numéros d'identification d'étude

  • IRB-300000328
  • U01HG007301 (Subvention/contrat des NIH des États-Unis)

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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