Permettre l'étude du métabolisme dans le cancer du sein grâce à la collecte de biopsies de tissus frais (ENSEMBLE)

Une analyse complète reliant les sous-types de tumeurs mammaires et leur profil génétique au métabolisme tumoral est nécessaire. Les systèmes modèles traditionnels sont inadéquats à cette fin.

1. Les modèles in vitro ne représentent pas un véritable environnement tumoral et font l'objet d'une adaptation prolongée aux conditions de culture cellulaire artificielle.
2. Il existe un besoin de modèles in vivo et ex vivo représentant la diversité du cancer du sein et l'environnement tumoral qui peuvent être utilisés pour prédire et tester les thérapies personnalisées.

L'analyse métabolique des tissus frais (par métabolomique et imagerie par spectrométrie de masse (MSI)) et des tissus cultivés en tant que modèles de xénogreffe dérivés du patient in vivo devrait révéler les relations non perturbées entre les profils génétiques des cellules tumorales, le microenvironnement tumoral et les profils métaboliques des tumeurs. Ces relations devraient fournir de nouvelles cibles pour les thérapies basées sur le métabolisme. Les systèmes expérimentaux requis pour effectuer cette recherche nécessitent des biopsies fraîches du cancer du sein.

ENSEMBLE est une étude de cohorte prospective multicentrique qui vise à répondre à ces enjeux. Des tissus frais de tumeur mammaire seront prélevés sur des participantes consentantes diagnostiquées avec un cancer du sein invasif, pour la recherche translationnelle. Jusqu'à 240 participants seront inscrits sur une période de 36 mois et les données de suivi clinique seront recueillies pendant une période allant jusqu'à 5 ans. Les participants à l'étude subiront une "biopsie de recherche" (biopsie au trocart) pour la recherche translationnelle qui vise à collecter jusqu'à quatre carottes. La procédure est la même que la biopsie percutanée à l'aiguille centrale standard de soins que le patient devra informer de son diagnostic, cependant, comme il s'agit d'une procédure supplémentaire, on l'appelle une «biopsie de recherche». Dans la mesure du possible, des échantillons de biopsie seront prélevés sur la pièce opératoire au moment de la chirurgie primaire. Cependant, lorsqu'un traitement néo-adjuvant est prévu dans le plan de soins d'un patient, ces patients subiront une biopsie percutanée de recherche avant leur chirurgie, réalisée soit en utilisant l'image- conseils ou comme biopsie clinique.

Le matériel tumoral collecté sera divisé : une partie sera immédiatement congelée dans de l'azote liquide et une partie sera conservée au frais. Le matériel sera transporté au laboratoire de réception principal du Francis Crick Institute où une partie de l'échantillon sera immédiatement greffée sur des souris immunodéficientes pour créer un modèle de xénogreffe dérivée du patient (PDX). Les échantillons primaires restants et les échantillons des PDX seront utilisés pour des analyses génomiques, métabolomiques et autres analyses biochimiques.

Les informations sur la démographie des participants, les antécédents médicaux et les caractéristiques de la tumeur seront recueillies lors de l'inscription. Les participants peuvent être suivis jusqu'à 5 ans pour les données sur les résultats cliniques et pour clarifier les informations sur les antécédents médicaux