Umožnění studia metabolismu u rakoviny prsu prostřednictvím odběru biopsií čerstvých tkání (ENSEMBLE)

Vyžaduje se komplexní analýza spojující podtypy nádorů prsu a jejich genetický profil s metabolismem nádoru. Tradiční modelové systémy jsou pro tento účel nedostatečné.

1. Modely in vitro nepředstavují skutečné prostředí nádoru a jsou předmětem dlouhodobé adaptace na podmínky umělé buněčné kultury.
2. Existuje potřeba modelů in vivo a ex vivo představujících rozmanitost rakoviny prsu a prostředí nádoru, které lze použít pro predikci a testování personalizovaných terapií.

Metabolická analýza čerstvých tkání (metabolomikou a zobrazením hmotnostní spektrometrie (MSI)) a tkání pěstovaných jako modely xenoimplantátů odvozených od pacientů in vivo by měla odhalit nenarušené vztahy mezi genetickými profily nádorových buněk, nádorovým mikroprostředím a metabolickými profily nádorů. Tyto vztahy by měly poskytnout nové cíle pro terapie založené na metabolismu. Experimentální systémy potřebné k provedení tohoto výzkumu vyžadují čerstvé biopsie rakoviny prsu.

ENSEMBLE je prospektivní multicentrická kohortová studie, která si klade za cíl tyto problémy řešit. Čerstvá tkáň nádoru prsu bude odebrána od souhlasných účastnic s diagnostikovanou invazivní rakovinou prsu pro translační výzkum. Během 36měsíčního období bude zapsáno až 240 účastníků a data klinického sledování budou shromažďována po dobu až 5 let. Účastníci studie podstoupí „výzkumnou biopsii“ (core biopsie) pro translační výzkum, jehož cílem je shromáždit až čtyři jádra. Postup je stejný jako u standardní péče perkutánní biopsie jádrové jehly, kterou bude muset pacient informovat o své diagnóze, ale jelikož se jedná o další postup, nazývá se „výzkumná biopsie“. Všude tam, kde to bude možné, budou odebrány bioptické vzorky z operačního vzorku v době primárního chirurgického zákroku, avšak tam, kde je v plánu péče o pacienta plánována neoadjuvantní terapie, podstoupí tito pacienti před operací výzkumnou perkutánní biopsii, provedenou buď pomocí zobrazení vedení nebo jako klinická biopsie.

Odebraný nádorový materiál bude rozdělen: část se okamžitě zmrazí v tekutém dusíku a část se ponechá čerstvá. Materiál bude transportován do primární přijímající laboratoře v Institutu Francise Cricka, kde bude část vzorku okamžitě naroubována do imunodeficientních myší, aby se vytvořil model xenograftu odvozeného od pacienta (PDX). Zbývající primární vzorky a vzorky z PDX budou použity pro genomické, metabolomické a další biochemické analýzy.

Informace o demografii účastníků, anamnéze a charakteristikách nádoru budou shromážděny při registraci. Účastníci mohou být sledováni po dobu až 5 let pro údaje o klinických výsledcích a pro objasnění informací o anamnéze