Umożliwienie badania metabolizmu w raku piersi poprzez pobieranie biopsji świeżych tkanek (ENSEMBLE)

Konieczna jest kompleksowa analiza łącząca podtypy guzów piersi i ich profil genetyczny z metabolizmem guza. Tradycyjne systemy modelowe nie nadają się do tego celu.

1. Modele in vitro nie reprezentują prawdziwego środowiska nowotworu i podlegają przedłużonej adaptacji do warunków sztucznej hodowli komórkowej.
2. Istnieje zapotrzebowanie na modele in vivo i ex vivo reprezentujące różnorodność raka piersi i środowisko guza, które można wykorzystać do przewidywania i testowania spersonalizowanych terapii.

Analiza metaboliczna świeżych tkanek (metodą metabolomiki i obrazowania metodą spektrometrii mas (MSI)) oraz tkanek wyhodowanych jako modele ksenoprzeszczepów pochodzących od pacjentów in vivo powinna ujawnić niezakłócone relacje między profilami genetycznymi komórek nowotworowych, mikrośrodowiskiem guza i profilami metabolicznymi nowotworów. Relacje te powinny zapewnić nowe cele dla terapii opartych na metabolizmie. Systemy eksperymentalne wymagane do przeprowadzenia tych badań wymagają świeżych biopsji raka piersi.

ENSEMBLE to prospektywne, wieloośrodkowe badanie kohortowe, którego celem jest rozwiązanie tych problemów. Świeża tkanka guza piersi zostanie pobrana od uczestniczących w badaniu kobiet, u których zdiagnozowano inwazyjnego raka piersi, w celu przeprowadzenia badań translacyjnych. Do 240 uczestników zostanie zapisanych w okresie 36 miesięcy, a dane z obserwacji klinicznej będą gromadzone przez okres do 5 lat. Uczestnicy badania zostaną poddani „biopsji badawczej” (biopsji rdzeniowej) w celu przeprowadzenia badań translacyjnych, których celem jest zebranie do czterech rdzeni. Procedura jest taka sama jak standardowa procedura przezskórnej biopsji gruboigłowej, którą pacjent będzie musiał poinformować o swojej diagnozie, jednak ponieważ jest to procedura dodatkowa, nazywana jest „biopsją badawczą”. Tam, gdzie to możliwe, próbki biopsyjne będą pobierane z materiału operacyjnego w czasie pierwotnego zabiegu chirurgicznego, jednak jeśli w planie opieki nad pacjentem planowana jest terapia neoadiuwantowa, pacjenci ci zostaną poddani przezskórnej biopsji badawczej przed operacją, wykonywanej przy użyciu obrazowania wskazówek lub jako biopsja kliniczna.

Pobrany materiał guza zostanie podzielony: część zostanie natychmiast zamrożona w ciekłym azocie, a część zachowana w świeżości. Materiał zostanie przetransportowany do głównego laboratorium odbiorczego w Instytucie Francisa Cricka, gdzie część próbki zostanie natychmiast wszczepiona myszom z niedoborem odporności w celu stworzenia modelu heteroprzeszczepu pochodzącego od pacjenta (PDX). Pozostałe próbki pierwotne i próbki z PDX zostaną wykorzystane do analiz genomicznych, metabolomicznych i innych analiz biochemicznych.

Podczas rejestracji zostaną zebrane informacje dotyczące danych demograficznych uczestników, historii medycznej i charakterystyki guza. Uczestnicy mogą być obserwowani przez okres do 5 lat w celu uzyskania danych dotyczących wyników klinicznych i wyjaśnienia informacji na temat historii medycznej