Möjliggör studie av metabolism i bröstcancer genom insamling av biopsier av färska vävnader (ENSEMBLE)

Omfattande analys som kopplar samman brösttumörsubtyper och deras genetiska profil med tumörmetabolism krävs. Traditionella modellsystem är otillräckliga för detta ändamål.

1. In vitro-modeller representerar inte en sann tumörmiljö och är föremål för långvarig anpassning till artificiella cellodlingsförhållanden.
2. Det finns ett behov av in vivo och ex vivo-modeller som representerar bröstcancermångfald och tumörmiljö som kan användas för att förutsäga och testa de personliga terapierna.

Metabolisk analys av färska vävnader (genom metabolomik och masspektrometrisk avbildning (MSI)) och vävnader som odlats som patienthärledda xenograftmodeller in vivo bör avslöja de opåverkade förhållandena mellan genetiska profiler hos tumörceller, tumörmikromiljö och metaboliska profiler för tumörer. Dessa relationer bör ge nya mål för metabolismbaserade terapier. De experimentella systemen som krävs för att utföra denna forskning kräver färska bröstcancerbiopsier.

ENSEMBLE är en prospektiv multicenter kohortstudie som syftar till att ta itu med dessa frågor. Färsk brösttumörvävnad kommer att samlas in från kvinnliga deltagare med samtycke som diagnostiserats med invasiv bröstcancer, för translationell forskning. Upp till 240 deltagare kommer att registreras under en 36-månadersperiod och klinisk uppföljningsdata kommer att samlas in i upp till 5 år. Studiedeltagare kommer att genomgå en "forskningsbiopsi" (kärnbiopsi) för translationell forskning som syftar till att samla in upp till fyra kärnor. Proceduren är densamma som standarden för vård perkutan kärnnålsbiopsi som patienten måste informera om sin diagnos, men eftersom det är ett tilläggsförfarande kallas det en "forskningsbiopsi". Där det är möjligt kommer biopsiprover att tas från det operativa provet vid tidpunkten för den primära operationen, men där neoadjuvant terapi planeras i en patients vårdplan, kommer dessa patienter att genomgå en perkutan forskningsbiopsi före operationen, utförd antingen med bild- vägledning eller som en klinisk biopsi.

Uppsamlat tumörmaterial kommer att delas: en del kommer omedelbart att frysas i flytande kväve och en del kommer att hållas färsk. Materialet kommer att transporteras till det primära mottagande laboratoriet vid Francis Crick Institute där en del av provet omedelbart kommer att ympas in i immundefekta möss för att skapa en patient-derived xenograft (PDX) modell. De återstående primärproverna och proverna från PDX:er kommer att användas för genomiska, metabolomiska och andra biokemiska analyser.

Information om deltagarnas demografi, sjukdomshistoria och tumöregenskaper kommer att samlas in vid registreringen. Deltagare kan följas upp i upp till 5 år för kliniska utfallsdata och för att förtydliga information om sjukdomshistoria