Mutation du gène Lipa dans PED-LIPIGEN (sujets FH pédiatriques)
Prévalence et taux de mutation du gène Lipa chez les sujets LIPIGEN avec un diagnostic clinique d'HF
L'hypercholestérolémie familiale (HF) est une maladie monogénique autosomique dominante également connue sous le nom d'hypercholestérolémie autosomique dominante (ADH) qui entraîne une augmentation spectaculaire des taux de lipoprotéines de basse densité (LDL) et de cholestérol total associés aux xanthomes tendineux, au xanthélasma, à l'arc cornéen, à l'athérosclérose prématurée et à un risque accru de maladie coronarienne (CAD) et d'infarctus du myocarde.
L'HF est principalement causée par des mutations dans les gènes codant pour les protéines affectant l'absorption hépatique du cholestérol LDL, notamment le gène du récepteur LDL (LDLR) ou le gène codant pour la seule apolipoprotéine des LDL, l'apolipoprotéine B (APOB), ou le gène codant pour une protéase régulant les niveaux de LDLR. sur la membrane cellulaire, le gène de la lipase acide lysosomale A (LIPA) code pour l'enzyme lipase acide lysosomale (LAL) responsable de l'hydrolyse des esters de cholestérol et des triglycérides qui sont délivrés aux lysosomes. Les mutations de LIPA qui inactivent complètement LAL sont la cause moléculaire de la maladie de Wolman, une maladie rapidement mortelle de la petite enfance, tandis que les mutations de LIPA qui entraînent une activité enzymatique résiduelle de LAL sont responsables d'un trouble caractérisé par un phénotype moins sévère connu sous le nom de maladie de stockage des esters de cholestérol. (CESD). Les patients atteints de CESD présentent généralement un phénotype caractérisé par une maladie hépatique et une hyperlipidémie mixte avec des taux élevés de LDL-C et de triglycérides (TG) et une diminution des taux de HDL-C.
Une présentation phénotypique plus large des mutations de perte de fonction dans LIPA suggère que les mutations LIPA peuvent être envisagées chez les patients atteints de FH apparemment monogénique chez qui les mutations des gènes candidats connus ne sont pas détectables.
Le projet vise à évaluer la prévalence et le taux de mutation du gène LIPA chez des sujets ayant un diagnostic clinique d'HF et déjà génétiquement caractérisés chez lesquels des mutations pathogènes dans les gènes candidats connus n'ont pas été identifiées. L'analyse sera effectuée sur environ 250 sujets pédiatriques FH et les mutations causales putatives seront également testées pour la co-ségrégation dans les familles disponibles chez les membres affectés et non affectés.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
La lipase acide lysosomale (LAL) est codée par le gène LIPA situé sur le chromosome 10q23.3-q23 et se compose de 10 exons. L'ARNm de LIPA (acide ribonucléique messager) (numéro d'accès GenBank NM_000235) a une longueur de 2782 pb et code pour une protéine mature de 375 résidus (numéro d'accès GenBank NP_000226). Le séquençage des 10 exons du gène LIPA consistera en 10 réactions d'amplification PCR (Polymerase Chain Reaction) (pour les 10 exons et le promoteur proximal) suivies de 20 réactions de séquence (séquençage direct et inverse) avec des amorces appropriées conçues pour inclure l'intron -limites d'exons. Cette analyse sera effectuée sur environ 250 sujets pédiatriques FH, comme spécifié dans la description du projet.
Le travail de séquençage sera effectué à l'aide de 2 séquenceurs d'ADN automatisés à 8 capillaires (analyseur génétique 3500, Thermo Fisher Scientific, Monza, Italie) actuellement disponibles dans le laboratoire des unités impliquées dans le projet.
En cas d'identification de variants de séquence non rapportés, la présence de ces mutations sera évaluée dans un échantillon d'au moins 100 sujets normolipidémiques de la population, afin de définir si les modifications nucléotidiques sont des variations de séquence rares (avec un effet fonctionnel putatif) ou représentent des polymorphismes communs. En cas de découverte de variants rares dans les régions codantes, une analyse in silico sera effectuée en utilisant deux logiciels différents (Polyphen, http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/ et Panther, http://www.pantherdb.org/) pour prédire le rôle préjudiciable putatif des mutations sur la protéine. En cas de variantes introniques, le logiciel spécialement conçu Automated Splice Site Analysis sera appliqué (https://www.splice.uwo.ca/).
Les mutations causales putatives seront également testées pour la co-ségrégation dans les familles disponibles chez les membres affectés et non affectés.
Afin de tester l'effet des variants sur l'activité enzymatique, l'activité LAL sera testée avec la technique des gouttes de sang séché (DBS) en utilisant les inhibiteurs Lalistat 2 chez les porteurs et les non porteurs de ces mutations appartenant à la parenté disponible.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Alberico L Catapano
- E-mail: alberico.catapano@unimi.it
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Alessia Tincani
- Numéro de téléphone: +39026173276
- E-mail: catapano.centroatero@gmail.com
Lieux d'étude
-
-
-
Modena, Italie
- Recrutement
- Laboratorio di biochimica delle lipoproteine - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOMEDICHE
-
Contact:
- Patrizia M. Tarugi
- E-mail: patriziamaria.tarugi@unimore.it
-
Palermo, Italie
- Recrutement
- Centro Di Riferimento Regionale Per La Prevenzione, Diagnosi E Cura Delle Malattie Rare Del Metabolismo
-
Contact:
- Maurizio Averna
- E-mail: maurizio.averna@unipa.it
-
Roma, Italie
- Recrutement
- Centro Per L'Arteriosclerosi Dipartimento Di Medicina Interna E Specialità Mediche
-
Contact:
- Marcello Arca
- E-mail: marcello.arca@uniroma1.it
-
-
Mi
-
Cinisello Balsamo, Mi, Italie
- Recrutement
- CENTRO PER LO STUDIO DELL'ATEROSCLEROSI - Ospedale Bassini
-
Contact:
- Alberico L Catapano
- E-mail: alberico.catapano@unimi.it
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Sujets pédiatriques (<18 ans) avec un diagnostic clinique de FH et sans mutations pathogènes identifiées dans les gènes candidats connus.
Critère d'exclusion:
- Sujets avec un diagnostic clinique de FH avec des mutations pathogènes identifiées dans les gènes candidats connus.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Autre
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
|
Patients pédiatriques FH
1 000 patients pédiatriques atteints d'HF cliniquement diagnostiqués (âge <18 ans) inclus dans la base de données LIPIGEN (Lipid TransPort Disorders italian Genetic Network)
|
Étude observationnelle : Il n'y a pas d'intervention.
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Prévalence des patients porteurs de mutations du gène LIPA parmi les sujets FH diagnostiqués cliniquement
Délai: 2 ans à compter du début de l'étude
|
Pourcentage de patients présentant au moins une mutation du gène LIPA parmi les sujets FH diagnostiqués cliniquement selon un score "Dutch Lipid Clinic Network" de 6 ou plus
|
2 ans à compter du début de l'étude
|
Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Fréquence des mutations spécifiques du gène LIPA chez les sujets FH diagnostiqués cliniquement
Délai: 2 ans à compter du début de l'étude
|
Nombre de patients porteurs de mutations spécifiques du gène LIPA parmi les sujets FH diagnostiqués cliniquement pour chaque mutation identifiée par séquençage des 10 exons du gène LIPA.
|
2 ans à compter du début de l'étude
|
Collaborateurs et enquêteurs
Les enquêteurs
- Directeur d'études: Maurizio Averna, Fondazione SISA
Publications et liens utiles
Publications générales
- ABRAMOV A, SCHORR S, WOLMAN M. Generalized xanthomatosis with calcified adrenals. AMA J Dis Child. 1956 Mar;91(3):282-6. doi: 10.1001/archpedi.1956.02060020284010. No abstract available.
- Bernstein DL, Hulkova H, Bialer MG, Desnick RJ. Cholesteryl ester storage disease: review of the findings in 135 reported patients with an underdiagnosed disease. J Hepatol. 2013 Jun;58(6):1230-43. doi: 10.1016/j.jhep.2013.02.014. Epub 2013 Feb 26.
- Bertolini S, Pisciotta L, Rabacchi C, Cefalu AB, Noto D, Fasano T, Signori A, Fresa R, Averna M, Calandra S. Spectrum of mutations and phenotypic expression in patients with autosomal dominant hypercholesterolemia identified in Italy. Atherosclerosis. 2013 Apr;227(2):342-8. doi: 10.1016/j.atherosclerosis.2013.01.007. Epub 2013 Jan 19.
- Burke JA, Schubert WK. Deficient activity of hepatic acid lipase in cholesterol ester storage disease. Science. 1972 Apr 21;176(4032):309-10. doi: 10.1126/science.176.4032.309.
- Futema M, Plagnol V, Li K, Whittall RA, Neil HA, Seed M; Simon Broome Consortium, Bertolini S, Calandra S, Descamps OS, Graham CA, Hegele RA, Karpe F, Durst R, Leitersdorf E, Lench N, Nair DR, Soran H, Van Bockxmeer FM; UK10K Consortium, Humphries SE. Whole exome sequencing of familial hypercholesterolaemia patients negative for LDLR/APOB/PCSK9 mutations. J Med Genet. 2014 Aug;51(8):537-44. doi: 10.1136/jmedgenet-2014-102405. Epub 2014 Jul 1.
- Hamilton J, Jones I, Srivastava R, Galloway P. A new method for the measurement of lysosomal acid lipase in dried blood spots using the inhibitor Lalistat 2. Clin Chim Acta. 2012 Aug 16;413(15-16):1207-10. doi: 10.1016/j.cca.2012.03.019. Epub 2012 Mar 29.
- Hopkins PN, Toth PP, Ballantyne CM, Rader DJ; National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. Familial hypercholesterolemias: prevalence, genetics, diagnosis and screening recommendations from the National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. J Clin Lipidol. 2011 Jun;5(3 Suppl):S9-17. doi: 10.1016/j.jacl.2011.03.452. Epub 2011 Apr 3. No abstract available.
- Nordestgaard BG, Chapman MJ, Humphries SE, Ginsberg HN, Masana L, Descamps OS, Wiklund O, Hegele RA, Raal FJ, Defesche JC, Wiegman A, Santos RD, Watts GF, Parhofer KG, Hovingh GK, Kovanen PT, Boileau C, Averna M, Boren J, Bruckert E, Catapano AL, Kuivenhoven JA, Pajukanta P, Ray K, Stalenhoef AF, Stroes E, Taskinen MR, Tybjaerg-Hansen A; European Atherosclerosis Society Consensus Panel. Familial hypercholesterolaemia is underdiagnosed and undertreated in the general population: guidance for clinicians to prevent coronary heart disease: consensus statement of the European Atherosclerosis Society. Eur Heart J. 2013 Dec;34(45):3478-90a. doi: 10.1093/eurheartj/eht273. Epub 2013 Aug 15. Erratum In: Eur Heart J. 2020 Dec 14;41(47):4517.
- Patrick AD, Lake BD. Deficiency of an acid lipase in Wolman's disease. Nature. 1969 Jun 14;222(5198):1067-8. doi: 10.1038/2221067a0. No abstract available.
- Risk of fatal coronary heart disease in familial hypercholesterolaemia. Scientific Steering Committee on behalf of the Simon Broome Register Group. BMJ. 1991 Oct 12;303(6807):893-6. doi: 10.1136/bmj.303.6807.893.
- Stitziel NO, Fouchier SW, Sjouke B, Peloso GM, Moscoso AM, Auer PL, Goel A, Gigante B, Barnes TA, Melander O, Orho-Melander M, Duga S, Sivapalaratnam S, Nikpay M, Martinelli N, Girelli D, Jackson RD, Kooperberg C, Lange LA, Ardissino D, McPherson R, Farrall M, Watkins H, Reilly MP, Rader DJ, de Faire U, Schunkert H, Erdmann J, Samani NJ, Charnas L, Altshuler D, Gabriel S, Kastelein JJ, Defesche JC, Nederveen AJ, Kathiresan S, Hovingh GK; National Heart, Lung, and Blood Institute GO Exome Sequencing Project. Exome sequencing and directed clinical phenotyping diagnose cholesterol ester storage disease presenting as autosomal recessive hypercholesterolemia. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2013 Dec;33(12):2909-14. doi: 10.1161/ATVBAHA.113.302426. Epub 2013 Sep 26.
- Talmud PJ, Futema M, Humphries SE. The genetic architecture of the familial hyperlipidaemia syndromes: rare mutations and common variants in multiple genes. Curr Opin Lipidol. 2014 Aug;25(4):274-81. doi: 10.1097/MOL.0000000000000090.
- Williams RR, Hunt SC, Schumacher MC, Hegele RA, Leppert MF, Ludwig EH, Hopkins PN. Diagnosing heterozygous familial hypercholesterolemia using new practical criteria validated by molecular genetics. Am J Cardiol. 1993 Jul 15;72(2):171-6. doi: 10.1016/0002-9149(93)90155-6.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Anticipé)
Achèvement de l'étude (Anticipé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- LIPIGEN-002
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Description du régime IPD
Délai de partage IPD
Critères d'accès au partage IPD
Type d'informations de prise en charge du partage d'IPD
- Protocole d'étude
- Plan d'analyse statistique (PAS)
- Formulaire de consentement éclairé (ICF)
- Rapport d'étude clinique (CSR)
- Code analytique
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .