Lipa-genmutatie in PED-LIPIGEN (pediatrische FH-proefpersonen)
Prevalentie en mutatiesnelheid van Lipa-gen bij LIPIGEN-proefpersonen met klinische diagnose van FH
Familiale hypercholesterolemie (FH) is een monogene autosomaal dominante ziekte, ook bekend als autosomaal dominante hypercholesterolemie - ADH) die leidt tot dramatisch verhoogde niveaus van lipoproteïne met lage dichtheid (LDL) en totaal cholesterol geassocieerd met peesxanthomas, xanthelasma, corneale arcus, premature atherosclerose en tot een verhoogd risico op coronaire hartziekte (CAD) en een hartinfarct.
FH wordt voornamelijk veroorzaakt door mutaties in genen die coderen voor eiwitten die de opname van LDL-cholesterol in de lever beïnvloeden, waaronder het LDL-receptor (LDLR)-gen of het gen dat codeert voor het enige apolipoproteïne van LDL, het apolipoproteïne B (APOB) of het gen dat codeert voor een protease dat LDLR-niveaus reguleert op het celmembraan Het lysosomale zure lipase A (LIPA)-gen codeert voor het lysosomale zure lipase (LAL)-enzym dat verantwoordelijk is voor het hydrolyseren van cholesterolesters en triglyceriden die aan lysosomen worden afgegeven. Mutaties in LIPA die LAL volledig inactiveren, zijn de moleculaire oorzaak van de ziekte van Wolman, een snel dodelijke kinderziekte, terwijl mutaties in LIPA die resulteren in resterende enzymatische activiteit van LAL verantwoordelijk zijn voor een aandoening die wordt gekenmerkt door een minder ernstig fenotype dat bekend staat als cholesterolesterstapelingsziekte. (CESD). Patiënten met CESD vertonen meestal een fenotype gekenmerkt door leverziekte en gemengde hyperlipidemie met verhoogde niveaus van LDL-C en triglyceriden (TG) en verlaagde HDL-C-niveaus.
Een bredere fenotypische presentatie van functieverliesmutaties in LIPA suggereert dat LIPA-mutaties kunnen worden overwogen bij patiënten met ogenschijnlijk monogene FH bij wie mutaties in de bekende kandidaatgenen niet detecteerbaar zijn.
Het project is gericht op het evalueren van de prevalentie en de mutatiesnelheid van het LIPA-gen bij proefpersonen met een klinische diagnose van FH en reeds genetisch gekarakteriseerd bij wie pathogene mutaties in de bekende kandidaatgenen niet zijn geïdentificeerd. De analyse zal worden uitgevoerd bij ongeveer 250 pediatrische patiënten met FH en vermoedelijke oorzakelijke mutaties zullen ook worden getest op co-segregatie in beschikbare families bij getroffen en niet-aangetaste leden.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Lysosomale zure lipase (LAL) wordt gecodeerd door het LIPA-gen op chromosoom 10q23.3-q23 en bestaat uit 10 exonen. LIPA mRNA (messenger RiboNucleic Acid) (GenBank toegangsnummer NM_000235) is 2782 bp lang en codeert voor een volwassen eiwit van 375 residuen (GenBank toegangsnummer NP_000226). De sequentiebepaling van alle 10 exons van het LIPA-gen zal bestaan uit 10 PCR (Polymerase Chain Reaction) amplificatiereacties (voor de 10 exons en de proximale promotor) gevolgd door 20 sequentiereacties (voorwaartse en achterwaartse sequentiebepaling) met geschikte primers die zijn ontworpen om de intron op te nemen -exon grenzen. Deze analyse zal worden uitgevoerd bij ongeveer 250 pediatrische patiënten met FH, zoals gespecificeerd in de projectbeschrijving.
Het sequencingwerk zal worden uitgevoerd gebruikmakend van 2 geautomatiseerde 8 capillairen geautomatiseerde DNA Sequencer (3500 Genetic Analyzer, Thermo Fisher Scientific, Monza, Italië) die momenteel beschikbaar is in het laboratorium van de eenheden die bij het project betrokken zijn.
In het geval van identificatie van niet-gerapporteerde sequentievarianten, zal de aanwezigheid van deze mutaties worden beoordeeld in een steekproef van ten minste 100 normolipidemische proefpersonen van de populatie, om te bepalen of de nucleotideveranderingen zeldzame sequentievariaties zijn (met een vermeend functioneel effect) of vertegenwoordigen gemeenschappelijke polymorfismen. In het geval van het vinden van zeldzame varianten in de coderende regio's, zal een in silico-analyse worden uitgevoerd met behulp van twee verschillende software (Polyphen, http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/ en Panther, http://www.pantherdb.org/) om de vermeende schadelijke rol van de mutaties op het eiwit te voorspellen. Bij intronic-varianten wordt de specifiek ontworpen software Automated Splice Site Analysis toegepast (https://www.splice.uwo.ca/).
Vermoedelijke oorzakelijke mutaties zullen ook worden getest op co-segregatie in beschikbare families in getroffen en niet-aangetaste leden.
Om het effect van varianten op de enzymactiviteit te testen, zal de LAL-activiteit worden getest met de dried blood spot (DBS)-techniek met behulp van de remmers Lalistat 2 bij dragers en niet-dragers van deze mutaties die behoren tot beschikbare verwanten.
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Alberico L Catapano
- E-mail: alberico.catapano@unimi.it
Studie Contact Back-up
- Naam: Alessia Tincani
- Telefoonnummer: +39026173276
- E-mail: catapano.centroatero@gmail.com
Studie Locaties
-
-
-
Modena, Italië
- Werving
- Laboratorio di biochimica delle lipoproteine - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOMEDICHE
-
Contact:
- Patrizia M. Tarugi
- E-mail: patriziamaria.tarugi@unimore.it
-
Palermo, Italië
- Werving
- Centro Di Riferimento Regionale Per La Prevenzione, Diagnosi E Cura Delle Malattie Rare Del Metabolismo
-
Contact:
- Maurizio Averna
- E-mail: maurizio.averna@unipa.it
-
Roma, Italië
- Werving
- Centro Per L'Arteriosclerosi Dipartimento Di Medicina Interna E Specialità Mediche
-
Contact:
- Marcello Arca
- E-mail: marcello.arca@uniroma1.it
-
-
Mi
-
Cinisello Balsamo, Mi, Italië
- Werving
- CENTRO PER LO STUDIO DELL'ATEROSCLEROSI - Ospedale Bassini
-
Contact:
- Alberico L Catapano
- E-mail: alberico.catapano@unimi.it
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Pediatrische proefpersonen (<18 jaar oud) met een klinische diagnose van FH en zonder geïdentificeerde pathogene mutaties in de bekende kandidaatgenen.
Uitsluitingscriteria:
- Proefpersonen met een klinische diagnose van FH met geïdentificeerde pathogene mutaties in de bekende kandidaatgenen.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Ander
- Tijdsperspectieven: Retrospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
FH pediatrische patiënten
1000 klinisch gediagnosticeerde pediatrische FH-patiënten (leeftijd <18 jaar) opgenomen in de LIPIGEN-database (Lipid TransPort Disorders italian Genetic Network)
|
Observationeel onderzoek: er is geen interventie.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Prevalentie van patiënten met mutaties van het LIPA-gen onder klinisch gediagnosticeerde FH-patiënten
Tijdsspanne: 2 jaar vanaf het begin van de studie
|
Percentage patiënten met ten minste één mutatie van het LIPA-gen onder klinisch gediagnosticeerde FH-proefpersonen volgens een "Dutch Lipid Clinic Network"-score van 6 of hoger
|
2 jaar vanaf het begin van de studie
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Frequentie van specifieke mutaties van het LIPA-gen bij klinisch gediagnosticeerde FH-patiënten
Tijdsspanne: 2 jaar vanaf het begin van de studie
|
Aantal patiënten met specifieke mutaties van het LIPA-gen onder klinisch gediagnosticeerde FH-patiënten voor elke mutatie geïdentificeerd door sequentiebepaling van alle 10 exons van het LIPA-gen.
|
2 jaar vanaf het begin van de studie
|
Medewerkers en onderzoekers
Onderzoekers
- Studie directeur: Maurizio Averna, Fondazione SISA
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- ABRAMOV A, SCHORR S, WOLMAN M. Generalized xanthomatosis with calcified adrenals. AMA J Dis Child. 1956 Mar;91(3):282-6. doi: 10.1001/archpedi.1956.02060020284010. No abstract available.
- Bernstein DL, Hulkova H, Bialer MG, Desnick RJ. Cholesteryl ester storage disease: review of the findings in 135 reported patients with an underdiagnosed disease. J Hepatol. 2013 Jun;58(6):1230-43. doi: 10.1016/j.jhep.2013.02.014. Epub 2013 Feb 26.
- Bertolini S, Pisciotta L, Rabacchi C, Cefalu AB, Noto D, Fasano T, Signori A, Fresa R, Averna M, Calandra S. Spectrum of mutations and phenotypic expression in patients with autosomal dominant hypercholesterolemia identified in Italy. Atherosclerosis. 2013 Apr;227(2):342-8. doi: 10.1016/j.atherosclerosis.2013.01.007. Epub 2013 Jan 19.
- Burke JA, Schubert WK. Deficient activity of hepatic acid lipase in cholesterol ester storage disease. Science. 1972 Apr 21;176(4032):309-10. doi: 10.1126/science.176.4032.309.
- Futema M, Plagnol V, Li K, Whittall RA, Neil HA, Seed M; Simon Broome Consortium, Bertolini S, Calandra S, Descamps OS, Graham CA, Hegele RA, Karpe F, Durst R, Leitersdorf E, Lench N, Nair DR, Soran H, Van Bockxmeer FM; UK10K Consortium, Humphries SE. Whole exome sequencing of familial hypercholesterolaemia patients negative for LDLR/APOB/PCSK9 mutations. J Med Genet. 2014 Aug;51(8):537-44. doi: 10.1136/jmedgenet-2014-102405. Epub 2014 Jul 1.
- Hamilton J, Jones I, Srivastava R, Galloway P. A new method for the measurement of lysosomal acid lipase in dried blood spots using the inhibitor Lalistat 2. Clin Chim Acta. 2012 Aug 16;413(15-16):1207-10. doi: 10.1016/j.cca.2012.03.019. Epub 2012 Mar 29.
- Hopkins PN, Toth PP, Ballantyne CM, Rader DJ; National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. Familial hypercholesterolemias: prevalence, genetics, diagnosis and screening recommendations from the National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. J Clin Lipidol. 2011 Jun;5(3 Suppl):S9-17. doi: 10.1016/j.jacl.2011.03.452. Epub 2011 Apr 3. No abstract available.
- Nordestgaard BG, Chapman MJ, Humphries SE, Ginsberg HN, Masana L, Descamps OS, Wiklund O, Hegele RA, Raal FJ, Defesche JC, Wiegman A, Santos RD, Watts GF, Parhofer KG, Hovingh GK, Kovanen PT, Boileau C, Averna M, Boren J, Bruckert E, Catapano AL, Kuivenhoven JA, Pajukanta P, Ray K, Stalenhoef AF, Stroes E, Taskinen MR, Tybjaerg-Hansen A; European Atherosclerosis Society Consensus Panel. Familial hypercholesterolaemia is underdiagnosed and undertreated in the general population: guidance for clinicians to prevent coronary heart disease: consensus statement of the European Atherosclerosis Society. Eur Heart J. 2013 Dec;34(45):3478-90a. doi: 10.1093/eurheartj/eht273. Epub 2013 Aug 15. Erratum In: Eur Heart J. 2020 Dec 14;41(47):4517.
- Patrick AD, Lake BD. Deficiency of an acid lipase in Wolman's disease. Nature. 1969 Jun 14;222(5198):1067-8. doi: 10.1038/2221067a0. No abstract available.
- Risk of fatal coronary heart disease in familial hypercholesterolaemia. Scientific Steering Committee on behalf of the Simon Broome Register Group. BMJ. 1991 Oct 12;303(6807):893-6. doi: 10.1136/bmj.303.6807.893.
- Stitziel NO, Fouchier SW, Sjouke B, Peloso GM, Moscoso AM, Auer PL, Goel A, Gigante B, Barnes TA, Melander O, Orho-Melander M, Duga S, Sivapalaratnam S, Nikpay M, Martinelli N, Girelli D, Jackson RD, Kooperberg C, Lange LA, Ardissino D, McPherson R, Farrall M, Watkins H, Reilly MP, Rader DJ, de Faire U, Schunkert H, Erdmann J, Samani NJ, Charnas L, Altshuler D, Gabriel S, Kastelein JJ, Defesche JC, Nederveen AJ, Kathiresan S, Hovingh GK; National Heart, Lung, and Blood Institute GO Exome Sequencing Project. Exome sequencing and directed clinical phenotyping diagnose cholesterol ester storage disease presenting as autosomal recessive hypercholesterolemia. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2013 Dec;33(12):2909-14. doi: 10.1161/ATVBAHA.113.302426. Epub 2013 Sep 26.
- Talmud PJ, Futema M, Humphries SE. The genetic architecture of the familial hyperlipidaemia syndromes: rare mutations and common variants in multiple genes. Curr Opin Lipidol. 2014 Aug;25(4):274-81. doi: 10.1097/MOL.0000000000000090.
- Williams RR, Hunt SC, Schumacher MC, Hegele RA, Leppert MF, Ludwig EH, Hopkins PN. Diagnosing heterozygous familial hypercholesterolemia using new practical criteria validated by molecular genetics. Am J Cardiol. 1993 Jul 15;72(2):171-6. doi: 10.1016/0002-9149(93)90155-6.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Verwacht)
Studie voltooiing (Verwacht)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- LIPIGEN-002
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
IPD-tijdsbestek voor delen
IPD-toegangscriteria voor delen
IPD delen Ondersteunend informatietype
- Leerprotocool
- Statistisch Analyse Plan (SAP)
- Formulier voor geïnformeerde toestemming (ICF)
- Klinisch onderzoeksrapport (CSR)
- Analytische code
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .