- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT03984149
Mutazione del gene Lipa in PED-LIPIGEN (soggetti pediatrici FH)
Prevalenza e tasso di mutazione del gene Lipa in soggetti LIPIGEN con diagnosi clinica di FH
L'ipercolesterolemia familiare (FH) è una malattia autosomica dominante monogenica nota anche come ipercolesterolemia autosomica dominante (ADH) che porta a livelli notevolmente aumentati di lipoproteine a bassa densità (LDL) e colesterolo totale associati a xantomi tendinei, xantelasma, arco corneale, aterosclerosi prematura e a un aumentato rischio di malattia coronarica (CAD) e infarto del miocardio.
L'FH è principalmente causata da mutazioni nei geni che codificano per le proteine che influenzano l'assorbimento epatico del colesterolo LDL compreso il gene del recettore per le LDL (LDLR) o il gene che codifica per l'unica apolipoproteina delle LDL, l'apolipoproteina B (APOB) o il gene che codifica per una proteasi che regola i livelli di LDLR Sulla membrana cellulare il gene Lysosomal Acid Lipase A (LIPA) codifica per l'enzima Lysosomal Acid Lipase (LAL) responsabile dell'idrolisi degli esteri del colesterolo e dei trigliceridi che vengono consegnati ai lisosomi. Le mutazioni in LIPA che inattivano completamente il LAL sono la causa molecolare della malattia di Wolman, una malattia dell'infanzia rapidamente letale, mentre le mutazioni in LIPA che determinano un'attività enzimatica residua del LAL sono responsabili di un disturbo caratterizzato da un fenotipo meno grave noto come malattia da accumulo di esteri del colesterolo (CESD). I pazienti con CESD di solito mostrano un fenotipo caratterizzato da malattia epatica e iperlipidemia mista con livelli elevati di LDL-C e trigliceridi (TG) e livelli ridotti di HDL-C.
Una presentazione fenotipica più ampia per le mutazioni con perdita di funzione in LIPA suggerisce che le mutazioni LIPA possono essere prese in considerazione in pazienti con FH apparentemente monogenica in cui le mutazioni nei geni candidati noti non sono rilevabili.
Il progetto ha lo scopo di valutare la prevalenza e il tasso di mutazione del gene LIPA in soggetti con diagnosi clinica di FH e già caratterizzati geneticamente nei quali non sono state identificate mutazioni patogene nei geni candidati noti. L'analisi sarà eseguita su circa 250 soggetti pediatrici FH e le mutazioni causali putative saranno anche testate per la co-segregazione nelle famiglie disponibili nei membri affetti e non affetti.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
La lipasi acida lisosomiale (LAL) è codificata dal gene LIPA situato sul cromosoma 10q23.3-q23 e consiste di 10 esoni. LIPA mRNA (messanger RiboNucleic Acid) (numero di accesso GenBank NM_000235) è lungo 2782 bp e codifica una proteina matura di 375 residui (numero di accesso GenBank NP_000226). Il sequenziamento di tutti i 10 esoni del gene LIPA consisterà in 10 reazioni di amplificazione PCR (Polymerase Chain Reaction) (per i 10 esoni e il promotore prossimale) seguite da 20 reazioni di sequenza (sequenziamento diretto e inverso) con primer appropriati progettati per includere l'introne -confini dell'esone. Questa analisi verrà eseguita su circa 250 soggetti pediatrici FH come specificato nella descrizione del progetto.
Il lavoro di sequenziamento sarà eseguito sfruttando 2 DNA Sequencer automatizzati a 8 capillari (3500 Genetic Analyzer, Thermo Fisher Scientific, Monza, Italia) attualmente disponibili nei laboratori delle Unità coinvolte nel progetto.
In caso di identificazione di varianti di sequenza non segnalate, la presenza di queste mutazioni sarà valutata in un campione di almeno 100 soggetti normolipidemici della popolazione, al fine di definire se i cambiamenti nucleotidici sono variazioni di sequenza rare (con un presunto effetto funzionale) o rappresentano polimorfismi comuni. In caso di riscontro di varianti rare nelle regioni codificanti, verrà eseguita un'analisi in silico utilizzando due diversi software (Polyphen, http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/ e Panther, http://www.pantherdb.org/) per prevedere il presunto ruolo dannoso delle mutazioni sulla proteina. In caso di varianti introniche, verrà applicato il software Automated Splice Site Analysis (https://www.splice.uwo.ca/).
Mutazioni causali presunte saranno anche testate per co-segregazione nelle famiglie disponibili in membri affetti e non affetti.
Al fine di testare l'effetto delle varianti sull'attività enzimatica, l'attività LAL sarà valutata con la tecnica del dry blood spot (DBS) utilizzando gli inibitori Lalistat 2 in portatori e non portatori di queste mutazioni appartenenti alle famiglie disponibili.
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Alberico L Catapano
- Email: alberico.catapano@unimi.it
Backup dei contatti dello studio
- Nome: Alessia Tincani
- Numero di telefono: +39026173276
- Email: catapano.centroatero@gmail.com
Luoghi di studio
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-
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Modena, Italia
- Reclutamento
- Laboratorio di biochimica delle lipoproteine - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOMEDICHE
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Contatto:
- Patrizia M. Tarugi
- Email: patriziamaria.tarugi@unimore.it
-
Palermo, Italia
- Reclutamento
- Centro Di Riferimento Regionale Per La Prevenzione, Diagnosi E Cura Delle Malattie Rare Del Metabolismo
-
Contatto:
- Maurizio Averna
- Email: maurizio.averna@unipa.it
-
Roma, Italia
- Reclutamento
- Centro Per L'Arteriosclerosi Dipartimento Di Medicina Interna E Specialità Mediche
-
Contatto:
- Marcello Arca
- Email: marcello.arca@uniroma1.it
-
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Mi
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Cinisello Balsamo, Mi, Italia
- Reclutamento
- CENTRO PER LO STUDIO DELL'ATEROSCLEROSI - Ospedale Bassini
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Contatto:
- Alberico L Catapano
- Email: alberico.catapano@unimi.it
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Soggetti pediatrici (<18 anni) con diagnosi clinica di FH e senza mutazioni patogene identificate nei geni candidati noti.
Criteri di esclusione:
- Soggetti con diagnosi clinica di FH con mutazioni patogene identificate nei geni candidati noti.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Altro
- Prospettive temporali: Retrospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Pazienti pediatrici FH
1000 pazienti pediatrici FH diagnosticati clinicamente (età <18 anni) inclusi nel database LIPIGEN (Lipid TransPort Disorders italian Genetic Network)
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Studio osservazionale: non c'è intervento.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Prevalenza di pazienti con mutazioni del gene LIPA tra i soggetti FH diagnosticati clinicamente
Lasso di tempo: 2 anni dall'inizio dello studio
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Percentuale di pazienti con almeno una mutazione del gene LIPA tra i soggetti FH diagnosticati clinicamente secondo un punteggio "Dutch Lipid Clinic Network" di 6 o superiore
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2 anni dall'inizio dello studio
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Frequenza di specifiche mutazioni del gene LIPA tra soggetti FH diagnosticati clinicamente
Lasso di tempo: 2 anni dall'inizio dello studio
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Numero di pazienti portatori di mutazioni specifiche del gene LIPA tra i soggetti FH diagnosticati clinicamente per ciascuna mutazione identificata dal sequenziamento di tutti i 10 esoni del gene LIPA.
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2 anni dall'inizio dello studio
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Collaboratori e investigatori
Investigatori
- Direttore dello studio: Maurizio Averna, Fondazione SISA
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- ABRAMOV A, SCHORR S, WOLMAN M. Generalized xanthomatosis with calcified adrenals. AMA J Dis Child. 1956 Mar;91(3):282-6. doi: 10.1001/archpedi.1956.02060020284010. No abstract available.
- Bernstein DL, Hulkova H, Bialer MG, Desnick RJ. Cholesteryl ester storage disease: review of the findings in 135 reported patients with an underdiagnosed disease. J Hepatol. 2013 Jun;58(6):1230-43. doi: 10.1016/j.jhep.2013.02.014. Epub 2013 Feb 26.
- Bertolini S, Pisciotta L, Rabacchi C, Cefalu AB, Noto D, Fasano T, Signori A, Fresa R, Averna M, Calandra S. Spectrum of mutations and phenotypic expression in patients with autosomal dominant hypercholesterolemia identified in Italy. Atherosclerosis. 2013 Apr;227(2):342-8. doi: 10.1016/j.atherosclerosis.2013.01.007. Epub 2013 Jan 19.
- Burke JA, Schubert WK. Deficient activity of hepatic acid lipase in cholesterol ester storage disease. Science. 1972 Apr 21;176(4032):309-10. doi: 10.1126/science.176.4032.309.
- Futema M, Plagnol V, Li K, Whittall RA, Neil HA, Seed M; Simon Broome Consortium, Bertolini S, Calandra S, Descamps OS, Graham CA, Hegele RA, Karpe F, Durst R, Leitersdorf E, Lench N, Nair DR, Soran H, Van Bockxmeer FM; UK10K Consortium, Humphries SE. Whole exome sequencing of familial hypercholesterolaemia patients negative for LDLR/APOB/PCSK9 mutations. J Med Genet. 2014 Aug;51(8):537-44. doi: 10.1136/jmedgenet-2014-102405. Epub 2014 Jul 1.
- Hamilton J, Jones I, Srivastava R, Galloway P. A new method for the measurement of lysosomal acid lipase in dried blood spots using the inhibitor Lalistat 2. Clin Chim Acta. 2012 Aug 16;413(15-16):1207-10. doi: 10.1016/j.cca.2012.03.019. Epub 2012 Mar 29.
- Hopkins PN, Toth PP, Ballantyne CM, Rader DJ; National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. Familial hypercholesterolemias: prevalence, genetics, diagnosis and screening recommendations from the National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. J Clin Lipidol. 2011 Jun;5(3 Suppl):S9-17. doi: 10.1016/j.jacl.2011.03.452. Epub 2011 Apr 3. No abstract available.
- Nordestgaard BG, Chapman MJ, Humphries SE, Ginsberg HN, Masana L, Descamps OS, Wiklund O, Hegele RA, Raal FJ, Defesche JC, Wiegman A, Santos RD, Watts GF, Parhofer KG, Hovingh GK, Kovanen PT, Boileau C, Averna M, Boren J, Bruckert E, Catapano AL, Kuivenhoven JA, Pajukanta P, Ray K, Stalenhoef AF, Stroes E, Taskinen MR, Tybjaerg-Hansen A; European Atherosclerosis Society Consensus Panel. Familial hypercholesterolaemia is underdiagnosed and undertreated in the general population: guidance for clinicians to prevent coronary heart disease: consensus statement of the European Atherosclerosis Society. Eur Heart J. 2013 Dec;34(45):3478-90a. doi: 10.1093/eurheartj/eht273. Epub 2013 Aug 15. Erratum In: Eur Heart J. 2020 Dec 14;41(47):4517.
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- Stitziel NO, Fouchier SW, Sjouke B, Peloso GM, Moscoso AM, Auer PL, Goel A, Gigante B, Barnes TA, Melander O, Orho-Melander M, Duga S, Sivapalaratnam S, Nikpay M, Martinelli N, Girelli D, Jackson RD, Kooperberg C, Lange LA, Ardissino D, McPherson R, Farrall M, Watkins H, Reilly MP, Rader DJ, de Faire U, Schunkert H, Erdmann J, Samani NJ, Charnas L, Altshuler D, Gabriel S, Kastelein JJ, Defesche JC, Nederveen AJ, Kathiresan S, Hovingh GK; National Heart, Lung, and Blood Institute GO Exome Sequencing Project. Exome sequencing and directed clinical phenotyping diagnose cholesterol ester storage disease presenting as autosomal recessive hypercholesterolemia. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2013 Dec;33(12):2909-14. doi: 10.1161/ATVBAHA.113.302426. Epub 2013 Sep 26.
- Talmud PJ, Futema M, Humphries SE. The genetic architecture of the familial hyperlipidaemia syndromes: rare mutations and common variants in multiple genes. Curr Opin Lipidol. 2014 Aug;25(4):274-81. doi: 10.1097/MOL.0000000000000090.
- Williams RR, Hunt SC, Schumacher MC, Hegele RA, Leppert MF, Ludwig EH, Hopkins PN. Diagnosing heterozygous familial hypercholesterolemia using new practical criteria validated by molecular genetics. Am J Cardiol. 1993 Jul 15;72(2):171-6. doi: 10.1016/0002-9149(93)90155-6.
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Prove cliniche su Studio osservazionale
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