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Mutazione del gene Lipa in PED-LIPIGEN (soggetti pediatrici FH)

Prevalenza e tasso di mutazione del gene Lipa in soggetti LIPIGEN con diagnosi clinica di FH

L'ipercolesterolemia familiare (FH) è una malattia autosomica dominante monogenica nota anche come ipercolesterolemia autosomica dominante (ADH) che porta a livelli notevolmente aumentati di lipoproteine ​​a bassa densità (LDL) e colesterolo totale associati a xantomi tendinei, xantelasma, arco corneale, aterosclerosi prematura e a un aumentato rischio di malattia coronarica (CAD) e infarto del miocardio.

L'FH è principalmente causata da mutazioni nei geni che codificano per le proteine ​​che influenzano l'assorbimento epatico del colesterolo LDL compreso il gene del recettore per le LDL (LDLR) o il gene che codifica per l'unica apolipoproteina delle LDL, l'apolipoproteina B (APOB) o il gene che codifica per una proteasi che regola i livelli di LDLR Sulla membrana cellulare il gene Lysosomal Acid Lipase A (LIPA) codifica per l'enzima Lysosomal Acid Lipase (LAL) responsabile dell'idrolisi degli esteri del colesterolo e dei trigliceridi che vengono consegnati ai lisosomi. Le mutazioni in LIPA che inattivano completamente il LAL sono la causa molecolare della malattia di Wolman, una malattia dell'infanzia rapidamente letale, mentre le mutazioni in LIPA che determinano un'attività enzimatica residua del LAL sono responsabili di un disturbo caratterizzato da un fenotipo meno grave noto come malattia da accumulo di esteri del colesterolo (CESD). I pazienti con CESD di solito mostrano un fenotipo caratterizzato da malattia epatica e iperlipidemia mista con livelli elevati di LDL-C e trigliceridi (TG) e livelli ridotti di HDL-C.

Una presentazione fenotipica più ampia per le mutazioni con perdita di funzione in LIPA suggerisce che le mutazioni LIPA possono essere prese in considerazione in pazienti con FH apparentemente monogenica in cui le mutazioni nei geni candidati noti non sono rilevabili.

Il progetto ha lo scopo di valutare la prevalenza e il tasso di mutazione del gene LIPA in soggetti con diagnosi clinica di FH e già caratterizzati geneticamente nei quali non sono state identificate mutazioni patogene nei geni candidati noti. L'analisi sarà eseguita su circa 250 soggetti pediatrici FH e le mutazioni causali putative saranno anche testate per la co-segregazione nelle famiglie disponibili nei membri affetti e non affetti.

Panoramica dello studio

Stato

Reclutamento

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

La lipasi acida lisosomiale (LAL) è codificata dal gene LIPA situato sul cromosoma 10q23.3-q23 e consiste di 10 esoni. LIPA mRNA (messanger RiboNucleic Acid) (numero di accesso GenBank NM_000235) è lungo 2782 bp e codifica una proteina matura di 375 residui (numero di accesso GenBank NP_000226). Il sequenziamento di tutti i 10 esoni del gene LIPA consisterà in 10 reazioni di amplificazione PCR (Polymerase Chain Reaction) (per i 10 esoni e il promotore prossimale) seguite da 20 reazioni di sequenza (sequenziamento diretto e inverso) con primer appropriati progettati per includere l'introne -confini dell'esone. Questa analisi verrà eseguita su circa 250 soggetti pediatrici FH come specificato nella descrizione del progetto.

Il lavoro di sequenziamento sarà eseguito sfruttando 2 DNA Sequencer automatizzati a 8 capillari (3500 Genetic Analyzer, Thermo Fisher Scientific, Monza, Italia) attualmente disponibili nei laboratori delle Unità coinvolte nel progetto.

In caso di identificazione di varianti di sequenza non segnalate, la presenza di queste mutazioni sarà valutata in un campione di almeno 100 soggetti normolipidemici della popolazione, al fine di definire se i cambiamenti nucleotidici sono variazioni di sequenza rare (con un presunto effetto funzionale) o rappresentano polimorfismi comuni. In caso di riscontro di varianti rare nelle regioni codificanti, verrà eseguita un'analisi in silico utilizzando due diversi software (Polyphen, http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/ e Panther, http://www.pantherdb.org/) per prevedere il presunto ruolo dannoso delle mutazioni sulla proteina. In caso di varianti introniche, verrà applicato il software Automated Splice Site Analysis (https://www.splice.uwo.ca/).

Mutazioni causali presunte saranno anche testate per co-segregazione nelle famiglie disponibili in membri affetti e non affetti.

Al fine di testare l'effetto delle varianti sull'attività enzimatica, l'attività LAL sarà valutata con la tecnica del dry blood spot (DBS) utilizzando gli inibitori Lalistat 2 in portatori e non portatori di queste mutazioni appartenenti alle famiglie disponibili.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

1000

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

      • Modena, Italia
        • Reclutamento
        • Laboratorio di biochimica delle lipoproteine - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOMEDICHE
        • Contatto:
      • Palermo, Italia
        • Reclutamento
        • Centro Di Riferimento Regionale Per La Prevenzione, Diagnosi E Cura Delle Malattie Rare Del Metabolismo
        • Contatto:
      • Roma, Italia
        • Reclutamento
        • Centro Per L'Arteriosclerosi Dipartimento Di Medicina Interna E Specialità Mediche
        • Contatto:
    • Mi
      • Cinisello Balsamo, Mi, Italia
        • Reclutamento
        • CENTRO PER LO STUDIO DELL'ATEROSCLEROSI - Ospedale Bassini
        • Contatto:

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Non più vecchio di 18 anni (Bambino, Adulto)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Pazienti pediatrici FH con diagnosi clinica (età <18 anni) inclusi nel database Lipid TransPort Disorders Italian Genetic Network (LIPIGEN), già caratterizzati geneticamente.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Soggetti pediatrici (<18 anni) con diagnosi clinica di FH e senza mutazioni patogene identificate nei geni candidati noti.

Criteri di esclusione:

  • Soggetti con diagnosi clinica di FH con mutazioni patogene identificate nei geni candidati noti.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Altro
  • Prospettive temporali: Retrospettiva

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Pazienti pediatrici FH
1000 pazienti pediatrici FH diagnosticati clinicamente (età <18 anni) inclusi nel database LIPIGEN (Lipid TransPort Disorders italian Genetic Network)
Studio osservazionale: non c'è intervento.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Prevalenza di pazienti con mutazioni del gene LIPA tra i soggetti FH diagnosticati clinicamente
Lasso di tempo: 2 anni dall'inizio dello studio
Percentuale di pazienti con almeno una mutazione del gene LIPA tra i soggetti FH diagnosticati clinicamente secondo un punteggio "Dutch Lipid Clinic Network" di 6 o superiore
2 anni dall'inizio dello studio

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Frequenza di specifiche mutazioni del gene LIPA tra soggetti FH diagnosticati clinicamente
Lasso di tempo: 2 anni dall'inizio dello studio
Numero di pazienti portatori di mutazioni specifiche del gene LIPA tra i soggetti FH diagnosticati clinicamente per ciascuna mutazione identificata dal sequenziamento di tutti i 10 esoni del gene LIPA.
2 anni dall'inizio dello studio

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Direttore dello studio: Maurizio Averna, Fondazione SISA

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Pubblicazioni generali

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

1 settembre 2017

Completamento primario (Anticipato)

1 luglio 2023

Completamento dello studio (Anticipato)

1 luglio 2023

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

21 maggio 2019

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

11 giugno 2019

Primo Inserito (Effettivo)

12 giugno 2019

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

29 luglio 2022

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

28 luglio 2022

Ultimo verificato

1 luglio 2022

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

Descrizione del piano IPD

Su preventiva richiesta di collaborazione scientifica

Periodo di condivisione IPD

Per tre anni dalla fine dello studio

Criteri di accesso alla condivisione IPD

Su preventiva richiesta di collaborazione scientifica

Tipo di informazioni di supporto alla condivisione IPD

  • Protocollo di studio
  • Piano di analisi statistica (SAP)
  • Modulo di consenso informato (ICF)
  • Relazione sullo studio clinico (CSR)
  • Codice analitico

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Studio osservazionale

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