Mutação do gene Lipa em PED-LIPIGEN (indivíduos pediátricos com HF)
Prevalência e taxa de mutação do gene Lipa em indivíduos LIPIGEN com diagnóstico clínico de HF
A Hipercolesterolemia Familiar (HF) é uma doença monogênica autossômica dominante também conhecida como Hipercolesterolemia Autossômica Dominante - ADH) que leva a níveis dramaticamente elevados de Lipoproteína de Baixa Densidade (LDL) e colesterol total associada a xantomas de tendão, xantelasma, arco corneano, aterosclerose prematura e a aumento do risco de doença arterial coronariana (DAC) e infarto do miocárdio.
A HF é causada principalmente por mutações em genes que codificam proteínas que afetam a captação hepática de colesterol LDL, incluindo o gene do receptor de LDL (LDLR) ou o gene que codifica a única apolipoproteína de LDL, a apolipoproteína B (APOB), ou o gene que codifica uma protease que regula os níveis de LDLR na membrana celular, o gene da lipase ácida lisossômica A (LIPA) codifica a enzima lipase ácida lisossômica (LAL) responsável por hidrolisar ésteres de colesterol e triglicerídeos que são entregues aos lisossomos. Mutações em LIPA que inativam completamente LAL são a causa molecular da doença de Wolman, uma doença rapidamente letal da infância, enquanto mutações em LIPA que resultam em atividade enzimática residual de LAL são responsáveis por um distúrbio caracterizado por um fenótipo menos grave conhecido como doença de armazenamento de éster de colesterol (CESD). Os pacientes com CESD geralmente apresentam um fenótipo caracterizado por doença hepática e hiperlipidemia mista com níveis elevados de LDL-C e triglicerídeos (TG) e níveis reduzidos de HDL-C.
Uma apresentação fenotípica mais ampla para mutações de perda de função em LIPA sugere que mutações de LIPA podem ser consideradas em pacientes com HF aparentemente monogênica, nos quais mutações nos genes candidatos conhecidos não são detectáveis.
O projeto visa avaliar a prevalência e a taxa de mutação do gene LIPA em indivíduos com diagnóstico clínico de HF e já geneticamente caracterizados nos quais não foram identificadas mutações patogênicas nos genes candidatos conhecidos. A análise será realizada em cerca de 250 indivíduos pediátricos com HF e as mutações causais putativas também serão testadas para co-segregação em famílias disponíveis em membros afetados e não afetados.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
A lipase ácida lisossômica (LAL) é codificada pelo gene LIPA localizado no cromossomo 10q23.3-q23 e consiste em 10 éxons. O mRNA de LIPA (mensageiro do ácido ribonucleico) (número de acesso do GenBank NM_000235) tem 2782 pb de comprimento e codifica uma proteína madura de 375 resíduos (número de acesso do GenBank NP_000226). O sequenciamento de todos os 10 éxons do gene LIPA consistirá em 10 reações de amplificação por PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) (para os 10 éxons e o promotor proximal) seguidas de 20 reações de sequência (sequenciamento direto e reverso) com primers apropriados projetados para incluir o íntron -limites de éxon. Esta análise será realizada em cerca de 250 pacientes pediátricos de HF, conforme especificado na descrição do projeto.
O trabalho de sequenciamento será realizado aproveitando-se de 2 Sequenciadores de DNA automatizados de 8 capilares (3500 Genetic Analyzer, Thermo Fisher Scientific, Monza, Itália) atualmente disponíveis no laboratório das Unidades envolvidas no projeto.
No caso de identificação de variantes de sequência não relatadas, a presença dessas mutações será avaliada em uma amostra de pelo menos 100 indivíduos normolipidêmicos da população, a fim de definir se as alterações nucleotídicas são variações raras de sequência (com efeito funcional putativo) ou representam polimorfismos comuns. No caso de encontrar variantes raras nas regiões codificantes, uma análise in silico será realizada usando dois softwares diferentes (Polyphen, http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/ e Panther, http://www.pantherdb.org/) para prever o suposto papel prejudicial das mutações na proteína. No caso de variantes intrônicas, será aplicado o software Automated Splice Site Analysis (https://www.splice.uwo.ca/) especificamente projetado.
Mutações causais putativas também serão testadas para co-segregação em famílias disponíveis em membros afetados e não afetados.
Para testar o efeito das variantes na atividade da enzima LAL-atividade será testada com a técnica de mancha de sangue seco (DBS) usando os inibidores Lalistat 2 em portadores e não portadores dessas mutações pertencentes à família disponível.
Tipo de estudo
Inscrição (Antecipado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Alberico L Catapano
- E-mail: alberico.catapano@unimi.it
Estude backup de contato
- Nome: Alessia Tincani
- Número de telefone: +39026173276
- E-mail: catapano.centroatero@gmail.com
Locais de estudo
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Modena, Itália
- Recrutamento
- Laboratorio di biochimica delle lipoproteine - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOMEDICHE
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Contato:
- Patrizia M. Tarugi
- E-mail: patriziamaria.tarugi@unimore.it
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Palermo, Itália
- Recrutamento
- Centro Di Riferimento Regionale Per La Prevenzione, Diagnosi E Cura Delle Malattie Rare Del Metabolismo
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Contato:
- Maurizio Averna
- E-mail: maurizio.averna@unipa.it
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Roma, Itália
- Recrutamento
- Centro Per L'Arteriosclerosi Dipartimento Di Medicina Interna E Specialità Mediche
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Contato:
- Marcello Arca
- E-mail: marcello.arca@uniroma1.it
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Mi
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Cinisello Balsamo, Mi, Itália
- Recrutamento
- CENTRO PER LO STUDIO DELL'ATEROSCLEROSI - Ospedale Bassini
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Contato:
- Alberico L Catapano
- E-mail: alberico.catapano@unimi.it
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Indivíduos pediátricos (<18 anos) com diagnóstico clínico de HF e sem mutações patogênicas identificadas nos genes candidatos conhecidos.
Critério de exclusão:
- Indivíduos com diagnóstico clínico de HF com mutações patogênicas identificadas nos genes candidatos conhecidos.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Outro
- Perspectivas de Tempo: Retrospectivo
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
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Pacientes pediátricos HF
1.000 pacientes pediátricos com HF diagnosticados clinicamente (idade <18 anos) incluídos no banco de dados LIPIGEN (Lipid TransPort Disorders italian Genetic Network)
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Estudo observacional: Não há intervenção.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Prevalência de pacientes com mutações do gene LIPA entre indivíduos com HF diagnosticados clinicamente
Prazo: 2 anos desde o início do estudo
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Porcentagem de pacientes com pelo menos uma mutação do gene LIPA entre indivíduos com HF diagnosticados clinicamente de acordo com uma pontuação "Dutch Lipid Clinic Network" de 6 ou mais
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2 anos desde o início do estudo
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Frequência de mutações específicas do gene LIPA entre indivíduos com HF diagnosticados clinicamente
Prazo: 2 anos desde o início do estudo
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Número de pacientes portadores de mutações específicas do gene LIPA entre indivíduos com HF diagnosticados clinicamente para cada mutação identificada pelo sequenciamento de todos os 10 exons do gene LIPA.
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2 anos desde o início do estudo
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Colaboradores e Investigadores
Investigadores
- Diretor de estudo: Maurizio Averna, Fondazione SISA
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- ABRAMOV A, SCHORR S, WOLMAN M. Generalized xanthomatosis with calcified adrenals. AMA J Dis Child. 1956 Mar;91(3):282-6. doi: 10.1001/archpedi.1956.02060020284010. No abstract available.
- Bernstein DL, Hulkova H, Bialer MG, Desnick RJ. Cholesteryl ester storage disease: review of the findings in 135 reported patients with an underdiagnosed disease. J Hepatol. 2013 Jun;58(6):1230-43. doi: 10.1016/j.jhep.2013.02.014. Epub 2013 Feb 26.
- Bertolini S, Pisciotta L, Rabacchi C, Cefalu AB, Noto D, Fasano T, Signori A, Fresa R, Averna M, Calandra S. Spectrum of mutations and phenotypic expression in patients with autosomal dominant hypercholesterolemia identified in Italy. Atherosclerosis. 2013 Apr;227(2):342-8. doi: 10.1016/j.atherosclerosis.2013.01.007. Epub 2013 Jan 19.
- Burke JA, Schubert WK. Deficient activity of hepatic acid lipase in cholesterol ester storage disease. Science. 1972 Apr 21;176(4032):309-10. doi: 10.1126/science.176.4032.309.
- Futema M, Plagnol V, Li K, Whittall RA, Neil HA, Seed M; Simon Broome Consortium, Bertolini S, Calandra S, Descamps OS, Graham CA, Hegele RA, Karpe F, Durst R, Leitersdorf E, Lench N, Nair DR, Soran H, Van Bockxmeer FM; UK10K Consortium, Humphries SE. Whole exome sequencing of familial hypercholesterolaemia patients negative for LDLR/APOB/PCSK9 mutations. J Med Genet. 2014 Aug;51(8):537-44. doi: 10.1136/jmedgenet-2014-102405. Epub 2014 Jul 1.
- Hamilton J, Jones I, Srivastava R, Galloway P. A new method for the measurement of lysosomal acid lipase in dried blood spots using the inhibitor Lalistat 2. Clin Chim Acta. 2012 Aug 16;413(15-16):1207-10. doi: 10.1016/j.cca.2012.03.019. Epub 2012 Mar 29.
- Hopkins PN, Toth PP, Ballantyne CM, Rader DJ; National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. Familial hypercholesterolemias: prevalence, genetics, diagnosis and screening recommendations from the National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. J Clin Lipidol. 2011 Jun;5(3 Suppl):S9-17. doi: 10.1016/j.jacl.2011.03.452. Epub 2011 Apr 3. No abstract available.
- Nordestgaard BG, Chapman MJ, Humphries SE, Ginsberg HN, Masana L, Descamps OS, Wiklund O, Hegele RA, Raal FJ, Defesche JC, Wiegman A, Santos RD, Watts GF, Parhofer KG, Hovingh GK, Kovanen PT, Boileau C, Averna M, Boren J, Bruckert E, Catapano AL, Kuivenhoven JA, Pajukanta P, Ray K, Stalenhoef AF, Stroes E, Taskinen MR, Tybjaerg-Hansen A; European Atherosclerosis Society Consensus Panel. Familial hypercholesterolaemia is underdiagnosed and undertreated in the general population: guidance for clinicians to prevent coronary heart disease: consensus statement of the European Atherosclerosis Society. Eur Heart J. 2013 Dec;34(45):3478-90a. doi: 10.1093/eurheartj/eht273. Epub 2013 Aug 15. Erratum In: Eur Heart J. 2020 Dec 14;41(47):4517.
- Patrick AD, Lake BD. Deficiency of an acid lipase in Wolman's disease. Nature. 1969 Jun 14;222(5198):1067-8. doi: 10.1038/2221067a0. No abstract available.
- Risk of fatal coronary heart disease in familial hypercholesterolaemia. Scientific Steering Committee on behalf of the Simon Broome Register Group. BMJ. 1991 Oct 12;303(6807):893-6. doi: 10.1136/bmj.303.6807.893.
- Stitziel NO, Fouchier SW, Sjouke B, Peloso GM, Moscoso AM, Auer PL, Goel A, Gigante B, Barnes TA, Melander O, Orho-Melander M, Duga S, Sivapalaratnam S, Nikpay M, Martinelli N, Girelli D, Jackson RD, Kooperberg C, Lange LA, Ardissino D, McPherson R, Farrall M, Watkins H, Reilly MP, Rader DJ, de Faire U, Schunkert H, Erdmann J, Samani NJ, Charnas L, Altshuler D, Gabriel S, Kastelein JJ, Defesche JC, Nederveen AJ, Kathiresan S, Hovingh GK; National Heart, Lung, and Blood Institute GO Exome Sequencing Project. Exome sequencing and directed clinical phenotyping diagnose cholesterol ester storage disease presenting as autosomal recessive hypercholesterolemia. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2013 Dec;33(12):2909-14. doi: 10.1161/ATVBAHA.113.302426. Epub 2013 Sep 26.
- Talmud PJ, Futema M, Humphries SE. The genetic architecture of the familial hyperlipidaemia syndromes: rare mutations and common variants in multiple genes. Curr Opin Lipidol. 2014 Aug;25(4):274-81. doi: 10.1097/MOL.0000000000000090.
- Williams RR, Hunt SC, Schumacher MC, Hegele RA, Leppert MF, Ludwig EH, Hopkins PN. Diagnosing heterozygous familial hypercholesterolemia using new practical criteria validated by molecular genetics. Am J Cardiol. 1993 Jul 15;72(2):171-6. doi: 10.1016/0002-9149(93)90155-6.
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Antecipado)
Conclusão do estudo (Antecipado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- LIPIGEN-002
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Descrição do plano IPD
Prazo de Compartilhamento de IPD
Critérios de acesso de compartilhamento IPD
Tipo de informação de suporte de compartilhamento de IPD
- Protocolo de estudo
- Plano de Análise Estatística (SAP)
- Termo de Consentimento Livre e Esclarecido (TCLE)
- Relatório de Estudo Clínico (CSR)
- Código Analítico
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
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Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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