Mutación del gen Lipa en PED-LIPIGEN (sujetos pediátricos con HF)
Prevalencia y tasa de mutación del gen Lipa en sujetos LIPIGEN con diagnóstico clínico de HF
La Hipercolesterolemia Familiar (FH) es una enfermedad monogénica autosómica dominante también conocida como Hipercolesterolemia Autosómica Dominante - ADH) que conduce a niveles dramáticamente elevados de lipoproteínas de baja densidad (LDL) y colesterol total asociado a xantomas tendinosos, xantelasma, arco corneal, aterosclerosis prematura y a un mayor riesgo de enfermedad arterial coronaria (CAD) e infarto de miocardio.
La FH es causada principalmente por mutaciones en genes que codifican proteínas que afectan la captación hepática de colesterol LDL, incluido el gen del receptor de LDL (LDLR) o el gen que codifica la única apolipoproteína de LDL, la apolipoproteína B (APOB), o el gen que codifica una proteasa que regula los niveles de LDLR en la membrana celular El gen de la lipasa ácida lisosomal A (LIPA) codifica para la enzima lipasa ácida lisosomal (LAL) responsable de hidrolizar los ésteres de colesterol y los triglicéridos que se envían a los lisosomas. Las mutaciones en LIPA que inactivan por completo LAL son la causa molecular de la enfermedad de Wolman, una enfermedad de la infancia rápidamente letal, mientras que las mutaciones en LIPA que provocan actividad enzimática residual de LAL son responsables de un trastorno caracterizado por un fenotipo menos grave conocido como enfermedad por almacenamiento de ésteres de colesterol. (CESD). Los pacientes con CESD suelen presentar un fenotipo caracterizado por enfermedad hepática e hiperlipidemia mixta con niveles elevados de C-LDL y triglicéridos (TG) y niveles disminuidos de C-HDL.
Una presentación fenotípica más amplia para las mutaciones de pérdida de función en LIPA sugiere que las mutaciones de LIPA pueden considerarse en pacientes con HF aparentemente monogénica en quienes las mutaciones en los genes candidatos conocidos no son detectables.
El proyecto tiene como objetivo evaluar la prevalencia y la tasa de mutación del gen LIPA en sujetos con diagnóstico clínico de HF y ya caracterizados genéticamente en los que no se han identificado mutaciones patogénicas en los genes candidatos conocidos. El análisis se realizará en alrededor de 250 sujetos pediátricos con FH y también se evaluarán las mutaciones causales putativas para determinar la cosegregación en familias disponibles en miembros afectados y no afectados.
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
La lipasa ácida lisosomal (LAL) está codificada por el gen LIPA ubicado en el cromosoma 10q23.3-q23 y consta de 10 exones. El ARNm de LIPA (ácido ribonucleico mensajero) (número de acceso de GenBank NM_000235) tiene una longitud de 2782 pb y codifica una proteína madura de 375 residuos (número de acceso de GenBank NP_000226). La secuenciación de los 10 exones del gen LIPA constará de 10 reacciones de amplificación por PCR (reacción en cadena de la polimerasa) (para los 10 exones y el promotor proximal) seguidas de 20 reacciones de secuenciación (secuenciación directa e inversa) con cebadores apropiados diseñados para incluir el intrón -límites del exón. Este análisis se realizará en aproximadamente 250 sujetos pediátricos FH como se especifica en la descripción del proyecto.
El trabajo de secuenciación se realizará aprovechando 2 Secuenciadores de ADN automatizados de 8 capilares (3500 Genetic Analyzer, Thermo Fisher Scientific, Monza, Italia) actualmente disponibles en el laboratorio de las Unidades involucradas en el proyecto.
En caso de identificación de variantes de secuencia no reportadas, se evaluará la presencia de estas mutaciones en una muestra de al menos 100 sujetos normolipidémicos de la población, para definir si los cambios de nucleótidos son variaciones de secuencia raras (con un supuesto efecto funcional) o representan polimorfismos comunes. En caso de encontrar variantes raras en las regiones codificantes, se realizará un análisis in silico utilizando dos softwares diferentes (Polyphen, http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/ y Panther, http://www.pantherdb.org/) para predecir el supuesto papel dañino de las mutaciones en la proteína. En el caso de las variantes intrónicas, se aplicará el software de Análisis Automatizado del Sitio de Empalme diseñado específicamente (https://www.splice.uwo.ca/).
Las mutaciones causales putativas también se probarán para la cosegregación en familias disponibles en miembros afectados y no afectados.
Con el fin de probar el efecto de las variantes sobre la actividad enzimática, se ensayará la actividad LAL con la técnica de gota de sangre seca (DBS) utilizando los inhibidores Lalistat 2 en portadores y no portadores de estas mutaciones pertenecientes a la familia disponible.
Tipo de estudio
Inscripción (Anticipado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Alberico L Catapano
- Correo electrónico: alberico.catapano@unimi.it
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Alessia Tincani
- Número de teléfono: +39026173276
- Correo electrónico: catapano.centroatero@gmail.com
Ubicaciones de estudio
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Modena, Italia
- Reclutamiento
- Laboratorio di biochimica delle lipoproteine - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOMEDICHE
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Contacto:
- Patrizia M. Tarugi
- Correo electrónico: patriziamaria.tarugi@unimore.it
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Palermo, Italia
- Reclutamiento
- Centro Di Riferimento Regionale Per La Prevenzione, Diagnosi E Cura Delle Malattie Rare Del Metabolismo
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Contacto:
- Maurizio Averna
- Correo electrónico: maurizio.averna@unipa.it
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Roma, Italia
- Reclutamiento
- Centro Per L'Arteriosclerosi Dipartimento Di Medicina Interna E Specialità Mediche
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Contacto:
- Marcello Arca
- Correo electrónico: marcello.arca@uniroma1.it
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Mi
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Cinisello Balsamo, Mi, Italia
- Reclutamiento
- CENTRO PER LO STUDIO DELL'ATEROSCLEROSI - Ospedale Bassini
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Contacto:
- Alberico L Catapano
- Correo electrónico: alberico.catapano@unimi.it
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Géneros elegibles para el estudio
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Sujetos pediátricos (<18 años) con diagnóstico clínico de HF y sin mutaciones patogénicas identificadas en los genes candidatos conocidos.
Criterio de exclusión:
- Sujetos con diagnóstico clínico de HF con mutaciones patogénicas identificadas en los genes candidatos conocidos.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Otro
- Perspectivas temporales: Retrospectivo
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
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Pacientes pediátricos con HF
1000 pacientes pediátricos con HF diagnosticados clínicamente (edad <18 años) incluidos en la base de datos LIPIGEN (Lipid TransPort Disorders italian Genetic Network)
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Estudio observacional: No hay intervención.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Prevalencia de pacientes con mutaciones del gen LIPA entre sujetos con HF diagnosticados clínicamente
Periodo de tiempo: 2 años desde el inicio del estudio
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Porcentaje de pacientes con al menos una mutación del gen LIPA entre sujetos con HF diagnosticados clínicamente según una puntuación de 6 o superior de la "Red holandesa de clínicas de lípidos"
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2 años desde el inicio del estudio
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Frecuencia de mutaciones específicas del gen LIPA entre sujetos con HF diagnosticados clínicamente
Periodo de tiempo: 2 años desde el inicio del estudio
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Número de pacientes que portan mutaciones específicas del gen LIPA entre sujetos con HF diagnosticados clínicamente para cada mutación identificada mediante la secuenciación de los 10 exones del gen LIPA.
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2 años desde el inicio del estudio
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Colaboradores e Investigadores
Investigadores
- Director de estudio: Maurizio Averna, Fondazione SISA
Publicaciones y enlaces útiles
Publicaciones Generales
- ABRAMOV A, SCHORR S, WOLMAN M. Generalized xanthomatosis with calcified adrenals. AMA J Dis Child. 1956 Mar;91(3):282-6. doi: 10.1001/archpedi.1956.02060020284010. No abstract available.
- Bernstein DL, Hulkova H, Bialer MG, Desnick RJ. Cholesteryl ester storage disease: review of the findings in 135 reported patients with an underdiagnosed disease. J Hepatol. 2013 Jun;58(6):1230-43. doi: 10.1016/j.jhep.2013.02.014. Epub 2013 Feb 26.
- Bertolini S, Pisciotta L, Rabacchi C, Cefalu AB, Noto D, Fasano T, Signori A, Fresa R, Averna M, Calandra S. Spectrum of mutations and phenotypic expression in patients with autosomal dominant hypercholesterolemia identified in Italy. Atherosclerosis. 2013 Apr;227(2):342-8. doi: 10.1016/j.atherosclerosis.2013.01.007. Epub 2013 Jan 19.
- Burke JA, Schubert WK. Deficient activity of hepatic acid lipase in cholesterol ester storage disease. Science. 1972 Apr 21;176(4032):309-10. doi: 10.1126/science.176.4032.309.
- Futema M, Plagnol V, Li K, Whittall RA, Neil HA, Seed M; Simon Broome Consortium, Bertolini S, Calandra S, Descamps OS, Graham CA, Hegele RA, Karpe F, Durst R, Leitersdorf E, Lench N, Nair DR, Soran H, Van Bockxmeer FM; UK10K Consortium, Humphries SE. Whole exome sequencing of familial hypercholesterolaemia patients negative for LDLR/APOB/PCSK9 mutations. J Med Genet. 2014 Aug;51(8):537-44. doi: 10.1136/jmedgenet-2014-102405. Epub 2014 Jul 1.
- Hamilton J, Jones I, Srivastava R, Galloway P. A new method for the measurement of lysosomal acid lipase in dried blood spots using the inhibitor Lalistat 2. Clin Chim Acta. 2012 Aug 16;413(15-16):1207-10. doi: 10.1016/j.cca.2012.03.019. Epub 2012 Mar 29.
- Hopkins PN, Toth PP, Ballantyne CM, Rader DJ; National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. Familial hypercholesterolemias: prevalence, genetics, diagnosis and screening recommendations from the National Lipid Association Expert Panel on Familial Hypercholesterolemia. J Clin Lipidol. 2011 Jun;5(3 Suppl):S9-17. doi: 10.1016/j.jacl.2011.03.452. Epub 2011 Apr 3. No abstract available.
- Nordestgaard BG, Chapman MJ, Humphries SE, Ginsberg HN, Masana L, Descamps OS, Wiklund O, Hegele RA, Raal FJ, Defesche JC, Wiegman A, Santos RD, Watts GF, Parhofer KG, Hovingh GK, Kovanen PT, Boileau C, Averna M, Boren J, Bruckert E, Catapano AL, Kuivenhoven JA, Pajukanta P, Ray K, Stalenhoef AF, Stroes E, Taskinen MR, Tybjaerg-Hansen A; European Atherosclerosis Society Consensus Panel. Familial hypercholesterolaemia is underdiagnosed and undertreated in the general population: guidance for clinicians to prevent coronary heart disease: consensus statement of the European Atherosclerosis Society. Eur Heart J. 2013 Dec;34(45):3478-90a. doi: 10.1093/eurheartj/eht273. Epub 2013 Aug 15. Erratum In: Eur Heart J. 2020 Dec 14;41(47):4517.
- Patrick AD, Lake BD. Deficiency of an acid lipase in Wolman's disease. Nature. 1969 Jun 14;222(5198):1067-8. doi: 10.1038/2221067a0. No abstract available.
- Risk of fatal coronary heart disease in familial hypercholesterolaemia. Scientific Steering Committee on behalf of the Simon Broome Register Group. BMJ. 1991 Oct 12;303(6807):893-6. doi: 10.1136/bmj.303.6807.893.
- Stitziel NO, Fouchier SW, Sjouke B, Peloso GM, Moscoso AM, Auer PL, Goel A, Gigante B, Barnes TA, Melander O, Orho-Melander M, Duga S, Sivapalaratnam S, Nikpay M, Martinelli N, Girelli D, Jackson RD, Kooperberg C, Lange LA, Ardissino D, McPherson R, Farrall M, Watkins H, Reilly MP, Rader DJ, de Faire U, Schunkert H, Erdmann J, Samani NJ, Charnas L, Altshuler D, Gabriel S, Kastelein JJ, Defesche JC, Nederveen AJ, Kathiresan S, Hovingh GK; National Heart, Lung, and Blood Institute GO Exome Sequencing Project. Exome sequencing and directed clinical phenotyping diagnose cholesterol ester storage disease presenting as autosomal recessive hypercholesterolemia. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2013 Dec;33(12):2909-14. doi: 10.1161/ATVBAHA.113.302426. Epub 2013 Sep 26.
- Talmud PJ, Futema M, Humphries SE. The genetic architecture of the familial hyperlipidaemia syndromes: rare mutations and common variants in multiple genes. Curr Opin Lipidol. 2014 Aug;25(4):274-81. doi: 10.1097/MOL.0000000000000090.
- Williams RR, Hunt SC, Schumacher MC, Hegele RA, Leppert MF, Ludwig EH, Hopkins PN. Diagnosing heterozygous familial hypercholesterolemia using new practical criteria validated by molecular genetics. Am J Cardiol. 1993 Jul 15;72(2):171-6. doi: 10.1016/0002-9149(93)90155-6.
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Anticipado)
Finalización del estudio (Anticipado)
Fechas de registro del estudio
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Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
- Enfermedades metabólicas
- Infantil, Recién Nacido, Enfermedades
- Enfermedades Genéticas Congénitas
- Metabolismo, errores congénitos
- Enfermedades de almacenamiento lisosomal
- Trastornos del metabolismo de los lípidos
- Lipidosis
- Metabolismo de lípidos, errores congénitos
- Enfermedad por almacenamiento de ésteres de colesterol
- Enfermedad de Wolman
Otros números de identificación del estudio
- LIPIGEN-002
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
Descripción del plan IPD
Marco de tiempo para compartir IPD
Criterios de acceso compartido de IPD
Tipo de información de apoyo para compartir IPD
- Protocolo de estudio
- Plan de Análisis Estadístico (SAP)
- Formulario de consentimiento informado (ICF)
- Informe de estudio clínico (CSR)
- Código analítico
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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