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- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04126850
Projet pilote : L'étude amplicon et métatranscriptomique du microbiome intra et extra-intestinal dans l'uvéite non infectieuse
Projet pilote : l'amplicon et le séquençage métatranscriptomique de nouvelle génération d'échantillons de microbiome intra et extra-intestinal chez des patients atteints d'uvéite non infectieuse pour déchiffrer la possibilité d'une pathogénie de l'uvéite
Aperçu de l'étude
Statut
Description détaillée
Le microbiome intestinal a été largement étudié dans le monde entier et il est convaincu que le microbiome intestinal joue un rôle essentiel dans de nombreuses maladies humaines. Dans une revue publiée a montré la présence de microbes dans le sang d'un patient qui souffrait d'une maladie non transmissible. Les microbes présents dans des états dormants ou non immédiatement cultivables comme si le sang était un environnement «stérile». Il a été avancé que la difficulté de cultiver des microbes à partir du sang provenait de la compréhension limitée des milieux de croissance/isolement appropriés pour les microbes à cultiver. Cette limitation peut être surmontée par les méthodes séquencées pour détecter les microbes non proliférants. La présence de microbes dans le sang peut également être observée par des méthodes ultrastructurales (microscopiques). Grâce aux observations microscopiques, il a été témoin de la présence de bactéries en forme de coccus et de bacilles qui présentent la proximité des globules rouges (globules rouges) dans les échantillons sanguins de patients atteints de la maladie d'Alzheimer ou de Parkinson. La présence de microbes dans des lieux autres que leur état de localisation normal par le terme « atopobiose ». La présence de microbes dans le sang suspectée à la suite d'une translocation entre l'intestin et le sang.
Par conséquent, selon les connaissances actuelles sur l'association du microbiome et les maladies humaines, nous sommes impatients de mener un projet pilote qui donne une image complète de l'association entre le microbiome et l'uvéite maladie partiellement non infectieuse et l'uvéite idiopathique. Nous étudierons le profil du microbiome dans l'intestin et l'extra-intestinal des patients atteints d'uvéite avant et après le traitement pour voir s'il existe une altération de l'abondance microbienne dans deux conditions cliniques distinctes partiellement chez les patients atteints d'uvéite ayant des antécédents de maladie auto-immune (Behcet et Vogt-Koyanagi-Harada) et uvéite idiopathique. Un autre objectif de cette étude est d'explorer tout microorganisme pathogène présent dans les échantillons de patients atteints d'uvéite réalisés par une méthode séquencée.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Jakarta
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Jakarta Pusat, Jakarta, Indonésie, 10320
- RSUPN dr. Cipto Mangunkusumo (Cipto Mangunkusumo Hospital)
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Nouveau patient enregistré à l'hôpital Cipto Mangunkusumo depuis novembre 2019
- Patient diagnostiqué avec une uvéite non infectieuse (avec antécédents de Behcet, VKH)
- Uvéite idiopathique du patient (résultat négatif prouvé par les bilans d'uvéite étiologique disponibles)
- Âge minimum : 18 ans
Présentez une inflammation active au cours des 180 derniers jours et/ou lors de l'inscription du patient conformément aux directives de la Nomenclature standard de l'uvéite (SUN), au moins :
- égale et ou supérieure à 2+ cellules de la chambre antérieure
- égal et ou supérieur à 2+ voile vitreux et/ou
- lésions rétiniennes/choroïdiennes actives
Critère d'exclusion:
- les patients avaient pris un supplément de probiotiques ou des antibiotiques 3 mois avant le prélèvement de l'échantillon
- ou qui souffrent de diarrhée prolongée ou de constipation
- ou subi une chirurgie gastro-intestinale
- ayant une forme quelconque de malignité
- ayant une maladie systémique telle que l'hypertension, l'obésité, une maladie intestinale inflammatoire ou le diabète.
- Refuser de signer un consentement éclairé
- L'uvéite se révèle être d'origine infectieuse
- Patiente enceinte
- Patient perdu de vue
Des volontaires sains sont recrutés pour cette étude après avoir donné leur consentement avec les critères d'inclusion suivants :
- âge : 18-50 ans (homme/femme)
- ne pas avoir de problèmes de santé ou de symptômes
- pas dans les médicaments à long terme
- n'ayant aucun antécédent d'allergie
- prêt à coopérer à l'étude
- état de complet bien-être physique, mental et social
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Groupes taxonomiques différentiels abondants bactériens
Délai: 0, 6 semaines
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L'amorce utilisée dans cette étude d'amplicon est ciblée sur la région V3-V4 du gène de l'ARNr 16S pour détecter la diversité bactérienne dans les échantillons.
Le séquençage sera généré par Illumina selon le protocole standard.
Le filtre préalable est effectué à l'aide de Prinseq-lite, puis les séquences chimériques sont supprimées à l'aide de Usearch61 et laissées sur les lectures de haute qualité.
L'OTU (unité taxonomique opérationnelle) est sélectionnée à l'aide d'un outil bioinformatique (Quantitative Insights Into Microbial Ecology - QIIME).
La classification taxonomique pour le regroupement de novo des OTU sera générée à l'aide d'un progiciel open source pour le traitement des données bioinformatiques.
La diversité de Shanon, l'indice de Simpson seront examinés pour calculer la diversité alpha.
Et puis nous ferons l'identification des groupes taxonomiques abondants différentiels.
Et faire un réseau de corrélation d'analyse entre les genres bactériens parmi deux conditions cliniques (avant et après avoir reçu des stéroïdes oraux) relativement au contrôle de la santé.
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0, 6 semaines
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Détection de microorganismes pathogènes dans des échantillons
Délai: 0, 6 semaines
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Dans cette étude, nous allons utiliser IDseq Portal, une nouvelle plateforme bioinformatique conçue pour la détection de microbes à partir de données métagénomiques.
Cette analyse sera appliquée à tous les types d'échantillons (selles, sang et humeur aqueuse).
Nous nous attendons à trouver une signature microbiome spécifique (bactérienne/fongique/virale) dans les échantillons d'uvéite des patients.
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0, 6 semaines
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Collaborateurs et enquêteurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Ratna Sitompul, Professor, RSUPN dr. Cipto Mangunkusumo Hospital (RSCM)
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (ANTICIPÉ)
Achèvement primaire (ANTICIPÉ)
Achèvement de l'étude (ANTICIPÉ)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (RÉEL)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (RÉEL)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Maladies cardiovasculaires
- Maladies vasculaires
- Maladies du système nerveux
- Maladies de la peau
- Maladies du système immunitaire
- Maladies auto-immunes du système nerveux
- Maladies auto-immunes
- Maladies oculaires
- Maladies génétiques, innées
- Maladies stomatognathiques
- Maladies de la bouche
- Maladies de l'uvée
- Vascularite
- Maladies auto-inflammatoires héréditaires
- Maladies de la peau, Génétique
- Maladies de la peau, vasculaire
- Maladies choroïdiennes
- Choroïdite
- Maladies de l'iris
- Syndrome de Behçet
- Uvéite
- Syndrome uvéoméningoencéphalitique
- Uvéite postérieure
- Panuvéite
- Uvéite intermédiaire
- Pars planite
- Uvéite antérieure
- Iridocyclite
Autres numéros d'identification d'étude
- 19-05-0624
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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