Le séquençage de nouvelle génération (NGS) surveille la maladie résiduelle minimale (MRD) chez les patients Allo-PBSCT

La détection de la maladie résiduelle minimale (MRM) est la détection de microclones résiduels chez les patients atteints de leucémie en rémission, prédisant la récurrence de la maladie et déterminant le prochain traitement de la maladie. Il existe de nombreuses méthodes pour détecter la MRD, la plus courante est la cytométrie en flux (FCM). Les gènes de fusion de la tumeur de Wilms 1 (WT1), pml-rara, runx1-runx1t1, cbfb-myh11 et la nucléophosmine (NPM1) ont été détectés par réaction en chaîne par polymérase (PCR). Analyse chromosomique ; Fluorescence in situ hybridation (FISH), etc. FCM est une méthode couramment utilisée pour la détection clinique de MRD, avec une sensibilité de 10-3 ~ 4. Sa spécificité n'est élevée que lorsqu'il y a un clonage anormal dans les échantillons, et un faux négatif peut être causé lorsqu'il y a est la dérive phénotypique et la dilution de la moelle osseuse. La détection PCR de WT1 est considérée comme un marqueur de préleucémie, mais WT1 est également exprimée dans des cellules non leucémiques et n'est pas recommandée par le réseau européen de leucémie (ELN). Détection PCR de pml-rara , runx1-runx1t1, cbfb-myh11 et d'autres gènes fusionnés n'ont soutenu les données des essais cliniques que lorsque l'indice logarithmique a diminué dans la procédure numérique. L'analyse chromosomique est moins sensible en raison de son absence de division chromosomique en métaphase. FISH a une sensibilité de 10-2 ~ 3, la spécificité n'est élevée que dans les cellules anormales, mais le taux de détection des mutations non couvertes par les sondes est faible et la liaison non spécifique des sondes peut conduire à des faux positifs. La sensibilité, la spécificité et la pertinence des diverses technologies de détection MRD sont différentes. Actuellement, ces technologies sont combinées pour analyser cliniquement la MRD.

Le séquençage de gènes de nouvelle génération (NGS) est la capacité de détecter simultanément la structure de tous les clones et sous-clones de la maladie et de suivre leurs mutations changeantes. Par rapport à la PCR et à la FCM qui détectent les anomalies dans un seul clone, le NGS peut détecter chaque clone et sous-clone de la maladie. NGS a été cliniquement utilisé pour diagnostiquer des mutations et des sous-types de maladies du sang. Les mutations persistantes sont associées à des taux de récidive élevés.

Cette étude clinique est observationnelle et n'implique pas de médicaments. Le séquençage sensible de nouvelle génération (NGS) a été utilisé pour surveiller les lésions résiduelles minimales après une allogreffe de cellules souches hématopoïétiques, pour prédire la rechute de la maladie au stade précoce, et pour surveiller et évaluer le pronostic, afin de fournir la base d'un traitement d'intervention précoce après la transplantation, afin de réduire la rechute hématologique et d'améliorer le taux de survie.