Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) monitoruje minimalną chorobę resztkową (MRD) u pacjentów Allo-PBSCT

Wykrywanie minimalnej choroby resztkowej (MRD) polega na wykrywaniu resztkowych mikroklonów u pacjentów z białaczką w stanie remisji, przewidywaniu nawrotu choroby i określaniu dalszego leczenia choroby. Istnieje wiele metod wykrywania MRD, najczęstsza to cytometria przepływowa (FCM). Geny fuzyjne guza Wilmsa 1（WT1）, pml-rara, runx1-runx1t1, cbfb-myh11 i nukleofosminy (NPM1) wykryto za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR). Analiza chromosomów; Fluorescencja in situ hybrydyzacja (FISH) itp. FCM jest powszechnie stosowaną metodą klinicznego wykrywania MRD, z czułością 10-3 ~ 4. Jej swoistość jest wysoka tylko wtedy, gdy w próbkach występuje nieprawidłowe klonowanie, a fałszywie ujemny wynik może wystąpić, gdy to dryf fenotypowy i rozcieńczenie szpiku kostnego. Wykrywanie WT1 metodą PCR jest uważane za marker stanu przedbiałaczkowego, ale WT1 ulega również ekspresji w komórkach innych niż białaczka i nie jest zalecane przez europejską sieć ds. białaczki (ELN). Wykrywanie PCR pml-rara , runx1-runx1t1, cbfb-myh11 i inne połączone geny potwierdziły dane z badań klinicznych tylko wtedy, gdy indeks logarytmiczny zmniejszył się w procedurze numerycznej. Analiza chromosomów jest mniej czuła ze względu na brak metafazowego podziału chromosomów. FISH ma czułość 10-2 ~ 3, specyficzność jest wysoka tylko w nieprawidłowych komórkach, ale wskaźnik wykrywania mutacji nieobjętych sondami jest niski, a niespecyficzne wiązanie sond może prowadzić do fałszywie dodatnich wyników. Czułość, swoistość i trafność różnych technologii wykrywania MRD są różne. Obecnie technologie te są łączone w celu analizy klinicznej MRD.

Sekwencjonowanie genów nowej generacji (NGS) to zdolność do jednoczesnego wykrywania struktury wszystkich klonów i subklonów chorobowych oraz śledzenia ich zmieniających się mutacji. W porównaniu z PCR i FCM, które wykrywają nieprawidłowości w pojedynczym klonie, NGS może wykryć każdy klon i subklon chorobowy.NGS był klinicznie stosowany do diagnozowania mutacji i podtypów chorób krwi. Trwałe mutacje są związane z wysokim odsetkiem nawrotów.

To badanie kliniczne ma charakter obserwacyjny i nie obejmuje leków. Czułe sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) zastosowano do monitorowania minimalnych zmian resztkowych po allogenicznym przeszczepieniu hematopoetycznych komórek macierzystych, do przewidywania nawrotu choroby we wczesnym stadium oraz do monitorowania i ocenić rokowanie, aby stworzyć podstawy do wczesnej interwencji po transplantacji, aby zmniejszyć nawrót hematologiczny i poprawić przeżywalność.