Næste generations sekvensering (NGS) monitorerer minimal restsygdom (MRD) hos Allo-PBSCT-patienter

Detektion af minimal residual sygdom (MRD) er påvisning af resterende mikrokloner hos patienter med leukæmi i remission, forudsigelse af tilbagefald af sygdommen og bestemmelse af næste behandling af sygdommen. Der er mange metoder til at påvise MRD, den mest almindelige. er Flowcytometri (FCM). Fusionsgenerne af Wilms tumor 1 (WT1), pml-rara, runx1-runx1t1, cbfb-myh11 og nucleophosmin (NPM1) blev påvist ved polymerasekædereaktion (PCR). Kromosomanalyse; Fluorescens i situa hybridisering (FISH) osv. FCM er en almindeligt anvendt metode til klinisk påvisning af MRD, med en sensitivitet på 10-3~4. Dens specificitet er kun høj, når der er unormal kloning i prøver, og falsk negativ kan forårsages, når der er er fænotypisk drift og knoglemarvsfortynding.PCR-detektion af WT1 anses for at være en markør for præleukæmi, men WT1 udtrykkes også i ikke-leukæmiske celler og anbefales ikke af det europæiske leukæmi-netværk (ELN).PCR-påvisning af pml-rara , runx1-runx1t1, cbfb-myh11 og andre fusionerede gener understøttede kun de kliniske forsøgsdata, når log-indekset faldt i den numeriske procedure. Kromosomanalyse er mindre følsom på grund af dens manglende metafase-kromosomdeling. FISH har en følsomhed på 10-2 ~ 3, specificiteten er kun høj i unormale celler, men påvisningshastigheden af ​​mutationer, der ikke er dækket af prober, er lav, og ikke-specifik binding af prober kan føre til falske positiver. Sensitiviteten, specificiteten og relevansen af ​​forskellige MRD-detektionsteknologier er forskellige. I øjeblikket kombineres disse teknologier for at analysere MRD klinisk.

Næste generations gensekventering (NGS) er evnen til samtidigt at detektere strukturen af ​​alle sygdomskloner og subkloner og spore deres skiftende mutationer. Sammenlignet med PCR og FCM, der påviser abnormiteter i en enkelt klon, kan NGS detektere hver sygdomsklon og subklon.NGS er blevet klinisk brugt til at diagnosticere mutationer og undertyper af blodsygdomme. Vedvarende mutationer er forbundet med høje gentagelsesrater.

Denne kliniske undersøgelse er observationel og involverer ikke lægemidler. Den sensitive næste generations sekventering (NGS) blev brugt til at overvåge de minimale resterende læsioner efter allogen hæmatopoietisk stamcelletransplantation, til at forudsige tilbagefald af sygdommen i det tidlige stadie og til at overvåge og evaluere prognosen for at danne grundlag for tidlig interventionsbehandling efter transplantation, for at reducere det hæmatologiske tilbagefald og forbedre overlevelsesraten.