L'utilité de Biofire Filmarray dans l'évaluation des déclencheurs d'entéropathogènes chez les patients atteints de diarrhée chronique

La diarrhée chronique est une affection courante et un symptôme clé de nombreux troubles. Il s'agit d'une cause majeure de morbidité et de mortalité dans le monde et l'un des motifs les plus courants d'orientation vers une clinique de gastro-entérologie. La prévalence varie en fonction de la population et de la définition de la diarrhée utilisée. Elle affecte environ 5 % de la population à un moment donné, bien que la prévalence exacte soit inconnue. La diarrhée est associée à 4 mécanismes physiopathologiques : motilité osmotique, sécrétoire, exsudative et altérée. Il est plus utile de classer les patients présentant des symptômes de diarrhée selon des caractéristiques « fonctionnelles » ou « organiques ». Il est généralement difficile de faire une différenciation fiable entre les causes organiques et fonctionnelles chez les patients souffrant de diarrhée chronique en se basant uniquement sur l'anamnèse et l'examen physique.

L'évaluation standard des patients atteints de diarrhée chronique, qui commence par une anamnèse détaillée, un examen physique minutieux, puis des tests diagnostiques de base, est essentielle pour un traitement et une prévention optimaux. Au départ, la réflexion doit exclure plusieurs autres possibilités telles que (a) l'incontinence fécale déguisée en diarrhée, (b) la diarrhée iatrogène due aux médicaments, à la chirurgie ou à la radiothérapie, (c) les infections chroniques et (d) le syndrome du côlon irritable avec diarrhée ( IBS-D).

La détection d'un large éventail d'agents potentiellement offensants a traditionnellement nécessité une combinaison d'approches microbiologiques, y compris la culture bactérienne, la détection d'antigène, la microscopie et la réaction en chaîne par polymérase (PCR). Les nouveaux panels basés sur la PCR multiplex présentent plusieurs avantages par rapport aux méthodes conventionnelles, notamment (i) des exigences de volume d'échantillon réduites, (ii) une large couverture sans qu'il soit nécessaire de sélectionner des tests spécifiques, (iii) une capacité accrue à détecter les co-infections (iv) une sensibilité et une spécificité accrues jusqu'à 97-100 % et (v) un débit plus élevé. La Food and Drug Administration (FDA) a autorisé et recommandé l'utilisation du panneau FilmArray GI (BioFire Diagnostics), qui cible 22 analytes (bactéries avec toxine bactérienne, virus et parasites )