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Meilleure délimitation du phénotype lié à CDK13 et de la signature épigénétique. (CDK13)

12 mai 2020 mis à jour par: University Hospital, Montpellier

Trouble lié à CDK13 : phénotype clinique, profil neuropsychologique, caractéristiques de l'IRM cérébrale et signature épigénétique.

Le trouble lié à CDK13 est principalement caractérisé par un retard de développement (DD) et une déficience intellectuelle (DI), allant de léger à sévère, et un syndrome malformatif.

Les objectifs de cette étude sont d'abord de mieux délimiter le phénotype clinique, ainsi que le profil neuropsychologique, et les caractéristiques de l'IRM cérébrale ; et, deuxièmement, d'étudier les signatures épigénétiques dans une cohorte d'individus porteurs de variants pathogènes intragéniques de CDK13. Ce travail conduira à une thèse de médecine d'un généticien clinicien résident en France.

Le médecin qui participera remplira une feuille Excel concernant l'évaluation clinique et neuropsychologique.

Les enquêteurs seront également heureux d'avoir soit un CD-ROM ou un lien pour avoir accès aux données d'IRM cérébrale ainsi qu'à un échantillon d'ADN avec un minimum de 0,5 ug d'ADN génomique du sang périphérique. Les enquêteurs recueilleront l'ADN au laboratoire de génétique de Montpellier (Dr Mouna BARAT) et enverront le lot au laboratoire du Dr Sadikovic.

Entre 2019 et 2020, les chercheurs ont déjà recruté des données d'individus porteurs de variants pathogènes CDK13 en France et dans plusieurs centres de génétique européens.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Les chercheurs visent à mieux comprendre et délimiter le syndrome génétique CDK13. Cette maladie génétique a été décrite en septembre 2016 dans Nature Genetics (PMID 27479907).

Depuis cette première publication de 6 individus porteurs de la mutation pathogène CDK13, 37 autres individus porteurs d'une mutation pathogène de CDK13 ont été rapportés dans la littérature Les chercheurs cherchent à mieux définir le phénotype des individus porteurs de variants pathogènes de CDK13, pour mieux comprendre le fonctionnement intellectuel ainsi que les forces et les faiblesses du fonctionnement intellectuel en collectant des évaluations neuropsychologiques standardisées déjà réalisées telles que WPPSI/WISC et WAIS. A cet effet, les investigateurs rassembleront des données cliniques et neuropsychologiques déjà réalisées dans le cadre de soins.

Les investigateurs visent également à rassembler les IRM cérébrales déjà réalisées afin de mieux délimiter les anomalies cérébrales observées chez les individus et si la séquence est adaptée, les investigateurs réaliseront des études VBM.

Enfin, les chercheurs tenteront d'identifier une signature épigénétique dans cette maladie génétique. À cette fin, les enquêteurs prélèveront de l'ADN génomique à partir de sang périphérique déjà prélevé pour analyse génétique et enverront un lot d'échantillons anonymisés à notre collaborateur, le Dr Bekim Sadicovik. Le Dr Bekim Sadicovik et son équipe compareront les marqueurs épigénétiques de type méthylation de l'ADN avec les témoins de sexe et d'âge correspondants. Si des sondes spécifiques sont anormalement méthylées chez les individus CDK13, cela déterminera une signature épigénétique spécifique à la maladie. Les chercheurs pourront alors proposer une signature épigénétique pour les individus présentant des variations CDK13 non caractérisées (classe 3, VUS). Cette méthode permettra de définir si la variation est responsable ou non de la maladie sans passer par des étapes d'analyse fonctionnelle difficiles à mettre en œuvre en routine.

Les bénéfices attendus sont une meilleure compréhension de la maladie CDK13, des clés de rééducation neuropsychologique, une meilleure compréhension des fonctions cérébrales humaines, la possibilité de proposer une signature épigénétique pour les personnes chez qui il n'est pas possible de décider si une variation du gène CDK13 est pathologique ou non

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

100

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Individus avec CDK13 pathogène intragénique SNV (variante de nucléotide unique)

La description

Critère d'intégration:

- CDK13 intragénique pathogène SNV (Single Nucleotide Variant)

Critère d'exclusion:

  • pas de SNV pathogène dans CDK13
  • pas de consentement pour l'étude

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Autre

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
CDK13
Variante pathogène intragénique de CDK13
Signatures épigénétiques (laboratoire du Dr Sadikovic, London, Ontario, Canada)

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Évolution des données cliniques
Délai: Un jour
Données cliniques telles que les paramètres de croissance, faciales, neurologiques, ORL, oculaires, cardiaques, etc.
Un jour
Test neuropsychologique
Délai: Un jour
Test neuropsychologique avec QI total et données de sous-scores utilisant le test WISC ou WAIS
Un jour

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Évolution des données génétiques
Délai: Un jour
Evolution des données génétiques : Signatures épigénétiques
Un jour

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: David GENEVIEVE, Department of Medical Genetics

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 novembre 2019

Achèvement primaire (Anticipé)

1 décembre 2020

Achèvement de l'étude (Anticipé)

30 décembre 2020

Dates d'inscription aux études

Première soumission

6 mai 2020

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

6 mai 2020

Première publication (Réel)

11 mai 2020

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

14 mai 2020

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

12 mai 2020

Dernière vérification

1 mai 2020

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Indécis

Description du régime IPD

NC

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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